FuNGI

C9SI41

Protein Details

Accession

C9SI41

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
221-240	AAAGRKRKKRWDVSSTPTDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
225-230	RKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 16, nucl 4.5, cyto_nucl 4.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
KEGG	val:VDBG_04723 -
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDSDFETIRQLQAERNAAAAAKKGSNAFDPSNQRPDAVSTKQKLTDTVDTDLYDANGADKFAGYATSIPTGINGDDDDDDMNGVDNTRRLVGQYTASRDMLDEFSRGDGVEEDDVLAGRGEKSNRITDRETDYQKRRFDRVLTPTRADPFAANRQAGAAEGGSTYRDVMEAKELEREEERVRRAILDKAEGRVEEGNTAPATLTNGDDKENGDSGSTELAAAGRKRKKRWDVSSTPTDDAAAAQPDGAVKKRSRWDQTPAPGAEVVKKSSRWDQAPSATPMGNQGLATPMHPSQAGGAILPSTFGPDMSGRNMPLSDEELNELLPGEEQGYKILEPPPGYAPLRAPTHRLVATPAPQSEIPGIGDLQFFKAEDMAYFGKLTDGTDENDLSVEQMKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGPLFDQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLATMISTMRHDIDHTDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKQWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIAPNLNDEQTKVRTVTSLAIAALAEASNPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGFIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVVSQCAGTDGVTAGYLKEHVLDDFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDIGQKVGVSEIIERIVVNLKDESEAYRKMTVETIEKIVASLGAADIGERLEERLIDGILHAFQEQSVEDIIMLNGFGSVVNALGSRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGITQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVNTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMIHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIVEAIEAVRMAVGPGVVMNYVWAGLFHPARKVRQPYWRLYNDAYVQGADAMVPYYPNLDEDKMDRPELAIML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.31
3	0.3
4	0.29
5	0.28
6	0.28
7	0.28
8	0.25
9	0.21
10	0.23
11	0.24
12	0.26
13	0.29
14	0.33
15	0.32
16	0.36
17	0.43
18	0.47
19	0.53
20	0.51
21	0.47
22	0.43
23	0.45
24	0.44
25	0.44
26	0.47
27	0.44
28	0.5
29	0.54
30	0.54
31	0.51
32	0.51
33	0.51
34	0.45
35	0.44
36	0.4
37	0.36
38	0.36
39	0.33
40	0.26
41	0.19
42	0.15
43	0.12
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.09
48	0.08
49	0.08
50	0.09
51	0.08
52	0.09
53	0.11
54	0.13
55	0.13
56	0.12
57	0.13
58	0.14
59	0.13
60	0.13
61	0.11
62	0.11
63	0.11
64	0.12
65	0.12
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.1
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.1
74	0.12
75	0.13
76	0.13
77	0.13
78	0.17
79	0.18
80	0.24
81	0.29
82	0.34
83	0.37
84	0.37
85	0.36
86	0.33
87	0.33
88	0.29
89	0.25
90	0.19
91	0.15
92	0.16
93	0.17
94	0.16
95	0.14
96	0.11
97	0.12
98	0.12
99	0.12
100	0.11
101	0.11
102	0.11
103	0.1
104	0.09
105	0.08
106	0.08
107	0.12
108	0.14
109	0.18
110	0.23
111	0.31
112	0.34
113	0.39
114	0.42
115	0.43
116	0.49
117	0.53
118	0.57
119	0.58
120	0.63
121	0.65
122	0.69
123	0.7
124	0.67
125	0.63
126	0.61
127	0.61
128	0.62
129	0.65
130	0.64
131	0.62
132	0.61
133	0.59
134	0.55
135	0.46
136	0.38
137	0.34
138	0.38
139	0.4
140	0.35
141	0.32
142	0.31
143	0.3
144	0.28
145	0.22
146	0.13
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.08
157	0.14
158	0.16
159	0.16
160	0.22
161	0.22
162	0.24
163	0.25
164	0.28
165	0.27
166	0.32
167	0.34
168	0.32
169	0.33
170	0.33
171	0.34
172	0.37
173	0.34
174	0.36
175	0.35
176	0.35
177	0.37
178	0.33
179	0.33
180	0.3
181	0.27
182	0.21
183	0.19
184	0.19
185	0.16
186	0.16
187	0.14
188	0.11
189	0.13
190	0.11
191	0.12
192	0.13
193	0.14
194	0.15
195	0.16
196	0.17
197	0.18
198	0.18
199	0.17
200	0.14
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.12
205	0.08
206	0.07
207	0.08
208	0.12
209	0.14
210	0.22
211	0.3
212	0.37
213	0.43
214	0.53
215	0.63
216	0.69
217	0.76
218	0.78
219	0.78
220	0.8
221	0.83
222	0.78
223	0.69
224	0.58
225	0.49
226	0.38
227	0.31
228	0.25
229	0.17
230	0.12
231	0.1
232	0.1
233	0.11
234	0.13
235	0.15
236	0.18
237	0.18
238	0.25
239	0.33
240	0.41
241	0.47
242	0.51
243	0.57
244	0.61
245	0.67
246	0.68
247	0.61
248	0.55
249	0.49
250	0.44
251	0.42
252	0.35
253	0.31
254	0.26
255	0.26
256	0.28
257	0.33
258	0.4
259	0.36
260	0.39
261	0.42
262	0.44
263	0.49
264	0.49
265	0.44
266	0.38
267	0.35
268	0.32
269	0.28
270	0.22
271	0.17
272	0.13
273	0.13
274	0.13
275	0.13
276	0.13
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.12
281	0.1
282	0.13
283	0.13
284	0.1
285	0.1
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.08
294	0.09
295	0.11
296	0.14
297	0.16
298	0.15
299	0.16
300	0.16
301	0.15
302	0.15
303	0.17
304	0.15
305	0.14
306	0.15
307	0.14
308	0.14
309	0.13
310	0.12
311	0.08
312	0.07
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.09
320	0.12
321	0.14
322	0.15
323	0.15
324	0.17
325	0.19
326	0.23
327	0.23
328	0.22
329	0.22
330	0.25
331	0.29
332	0.28
333	0.3
334	0.27
335	0.31
336	0.31
337	0.29
338	0.27
339	0.26
340	0.3
341	0.31
342	0.28
343	0.26
344	0.25
345	0.25
346	0.22
347	0.19
348	0.14
349	0.11
350	0.11
351	0.09
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.09
359	0.08
360	0.07
361	0.1
362	0.1
363	0.11
364	0.11
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.11
369	0.09
370	0.1
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.12
376	0.11
377	0.09
378	0.1
379	0.09
380	0.1
381	0.13
382	0.14
383	0.18
384	0.2
385	0.23
386	0.23
387	0.29
388	0.32
389	0.38
390	0.45
391	0.47
392	0.52
393	0.5
394	0.49
395	0.49
396	0.49
397	0.45
398	0.45
399	0.43
400	0.42
401	0.45
402	0.44
403	0.42
404	0.48
405	0.5
406	0.45
407	0.43
408	0.42
409	0.45
410	0.52
411	0.51
412	0.42
413	0.33
414	0.31
415	0.3
416	0.29
417	0.22
418	0.14
419	0.11
420	0.1
421	0.11
422	0.11
423	0.11
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.06
429	0.05
430	0.06
431	0.06
432	0.09
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.13
437	0.16
438	0.18
439	0.18
440	0.16
441	0.15
442	0.14
443	0.18
444	0.2
445	0.18
446	0.18
447	0.18
448	0.18
449	0.18
450	0.18
451	0.13
452	0.13
453	0.14
454	0.14
455	0.15
456	0.17
457	0.16
458	0.17
459	0.18
460	0.19
461	0.16
462	0.15
463	0.13
464	0.14
465	0.14
466	0.13
467	0.12
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.09
472	0.06
473	0.04
474	0.03
475	0.04
476	0.05
477	0.05
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.07
482	0.09
483	0.1
484	0.12
485	0.12
486	0.14
487	0.14
488	0.15
489	0.14
490	0.12
491	0.1
492	0.08
493	0.07
494	0.05
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.06
503	0.07
504	0.06
505	0.07
506	0.07
507	0.11
508	0.12
509	0.13
510	0.15
511	0.16
512	0.17
513	0.19
514	0.18
515	0.14
516	0.13
517	0.13
518	0.12
519	0.11
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.05
528	0.04
529	0.04
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.02
535	0.03
536	0.03
537	0.04
538	0.06
539	0.08
540	0.11
541	0.16
542	0.21
543	0.26
544	0.34
545	0.43
546	0.51
547	0.58
548	0.61
549	0.64
550	0.66
551	0.7
552	0.63
553	0.58
554	0.51
555	0.47
556	0.46
557	0.39
558	0.33
559	0.25
560	0.24
561	0.19
562	0.17
563	0.13
564	0.08
565	0.06
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.05
570	0.05
571	0.04
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.06
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.08
580	0.09
581	0.08
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.09
586	0.1
587	0.12
588	0.12
589	0.13
590	0.13
591	0.12
592	0.11
593	0.12
594	0.13
595	0.11
596	0.1
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.06
602	0.04
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.04
611	0.04
612	0.05
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.06
620	0.05
621	0.05
622	0.06
623	0.08
624	0.13
625	0.22
626	0.24
627	0.25
628	0.31
629	0.34
630	0.36
631	0.36
632	0.37
633	0.31
634	0.3
635	0.29
636	0.24
637	0.2
638	0.18
639	0.15
640	0.08
641	0.05
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.07
651	0.08
652	0.08
653	0.08
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.08
669	0.08
670	0.1
671	0.12
672	0.13
673	0.13
674	0.14
675	0.16
676	0.13
677	0.15
678	0.14
679	0.13
680	0.16
681	0.19
682	0.19
683	0.17
684	0.17
685	0.16
686	0.15
687	0.14
688	0.11
689	0.07
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.05
694	0.04
695	0.05
696	0.04
697	0.05
698	0.05
699	0.05
700	0.07
701	0.08
702	0.09
703	0.1
704	0.1
705	0.1
706	0.11
707	0.12
708	0.15
709	0.19
710	0.18
711	0.19
712	0.28
713	0.34
714	0.4
715	0.48
716	0.5
717	0.5
718	0.58
719	0.56
720	0.49
721	0.46
722	0.4
723	0.36
724	0.31
725	0.27
726	0.2
727	0.21
728	0.2
729	0.16
730	0.15
731	0.1
732	0.09
733	0.08
734	0.07
735	0.05
736	0.05
737	0.06
738	0.07
739	0.07
740	0.07
741	0.06
742	0.07
743	0.11
744	0.11
745	0.12
746	0.11
747	0.11
748	0.12
749	0.13
750	0.15
751	0.14
752	0.15
753	0.16
754	0.18
755	0.18
756	0.18
757	0.2
758	0.19
759	0.19
760	0.19
761	0.19
762	0.17
763	0.17
764	0.16
765	0.14
766	0.12
767	0.08
768	0.06
769	0.04
770	0.03
771	0.03
772	0.03
773	0.04
774	0.03
775	0.04
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.05
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.06
785	0.06
786	0.06
787	0.07
788	0.06
789	0.05
790	0.05
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.05
796	0.05
797	0.06
798	0.06
799	0.05
800	0.05
801	0.04
802	0.03
803	0.03
804	0.03
805	0.03
806	0.03
807	0.03
808	0.04
809	0.04
810	0.04
811	0.08
812	0.09
813	0.12
814	0.12
815	0.13
816	0.14
817	0.2
818	0.3
819	0.29
820	0.31
821	0.3
822	0.33
823	0.33
824	0.32
825	0.29
826	0.21
827	0.22
828	0.21
829	0.21
830	0.25
831	0.26
832	0.27
833	0.29
834	0.32
835	0.37
836	0.4
837	0.39
838	0.33
839	0.33
840	0.32
841	0.29
842	0.26
843	0.19
844	0.14
845	0.12
846	0.12
847	0.1
848	0.1
849	0.09
850	0.07
851	0.1
852	0.1
853	0.1
854	0.1
855	0.11
856	0.11
857	0.1
858	0.11
859	0.09
860	0.09
861	0.08
862	0.08
863	0.09
864	0.08
865	0.07
866	0.06
867	0.05
868	0.04
869	0.05
870	0.06
871	0.06
872	0.06
873	0.06
874	0.06
875	0.06
876	0.06
877	0.05
878	0.05
879	0.04
880	0.04
881	0.04
882	0.04
883	0.05
884	0.04
885	0.04
886	0.04
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.03
892	0.03
893	0.04
894	0.05
895	0.05
896	0.06
897	0.09
898	0.12
899	0.13
900	0.13
901	0.15
902	0.16
903	0.18
904	0.2
905	0.2
906	0.23
907	0.25
908	0.26
909	0.28
910	0.29
911	0.33
912	0.37
913	0.45
914	0.45
915	0.5
916	0.53
917	0.59
918	0.62
919	0.63
920	0.61
921	0.6
922	0.57
923	0.53
924	0.5
925	0.42
926	0.35
927	0.28
928	0.23
929	0.14
930	0.11
931	0.08
932	0.08
933	0.08
934	0.09
935	0.1
936	0.11
937	0.14
938	0.17
939	0.19
940	0.22
941	0.23
942	0.23
943	0.25
944	0.25
945	0.24
946	0.24
947	0.22
948	0.21
949	0.18
950	0.18
951	0.19
952	0.18
953	0.19
954	0.15
955	0.18
956	0.22
957	0.22
958	0.24
959	0.22
960	0.27
961	0.33
962	0.43
963	0.49
964	0.5
965	0.59
966	0.65
967	0.72
968	0.67
969	0.6
970	0.51
971	0.41
972	0.36
973	0.28
974	0.2
975	0.11
976	0.13
977	0.12
978	0.12
979	0.11
980	0.11
981	0.11
982	0.1
983	0.1
984	0.07
985	0.07
986	0.08
987	0.1
988	0.12
989	0.12
990	0.13
991	0.14
992	0.16
993	0.19
994	0.26
995	0.29
996	0.35
997	0.37
998	0.42
999	0.42
1000	0.43
1001	0.4
1002	0.32
1003	0.28
1004	0.2
1005	0.17
1006	0.11
1007	0.09
1008	0.06
1009	0.06
1010	0.05
1011	0.04
1012	0.04
1013	0.04
1014	0.05
1015	0.05
1016	0.06
1017	0.09
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.11
1021	0.16
1022	0.16
1023	0.18
1024	0.18
1025	0.17
1026	0.18
1027	0.18
1028	0.19
1029	0.2
1030	0.23
1031	0.25
1032	0.26
1033	0.24
1034	0.27
1035	0.27
1036	0.26
1037	0.2
1038	0.17
1039	0.14
1040	0.14
1041	0.15
1042	0.11
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.13
1047	0.12
1048	0.12
1049	0.11
1050	0.11
1051	0.11
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.09
1055	0.08
1056	0.07
1057	0.08
1058	0.08
1059	0.08
1060	0.08
1061	0.08
1062	0.08
1063	0.07
1064	0.06
1065	0.07
1066	0.1
1067	0.1
1068	0.1
1069	0.11
1070	0.14
1071	0.19
1072	0.21
1073	0.23
1074	0.2
1075	0.2
1076	0.22
1077	0.27
1078	0.3
1079	0.27
1080	0.27
1081	0.26
1082	0.26
1083	0.25
1084	0.23
1085	0.18
1086	0.11
1087	0.1
1088	0.08
1089	0.06
1090	0.05
1091	0.05
1092	0.05
1093	0.04
1094	0.04
1095	0.04
1096	0.03
1097	0.04
1098	0.05
1099	0.05
1100	0.06
1101	0.06
1102	0.07
1103	0.09
1104	0.09
1105	0.08
1106	0.08
1107	0.1
1108	0.11
1109	0.11
1110	0.1
1111	0.14
1112	0.21
1113	0.23
1114	0.24
1115	0.23
1116	0.21
1117	0.22
1118	0.23
1119	0.21
1120	0.14
1121	0.11
1122	0.11
1123	0.11
1124	0.11
1125	0.1
1126	0.08
1127	0.06
1128	0.05
1129	0.06
1130	0.06
1131	0.05
1132	0.05
1133	0.05
1134	0.06
1135	0.06
1136	0.06
1137	0.06
1138	0.06
1139	0.06
1140	0.06
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.12
1144	0.16
1145	0.17
1146	0.25
1147	0.31
1148	0.36
1149	0.45
1150	0.53
1151	0.55
1152	0.62
1153	0.67
1154	0.69
1155	0.74
1156	0.74
1157	0.71
1158	0.66
1159	0.66
1160	0.59
1161	0.55
1162	0.47
1163	0.37
1164	0.31
1165	0.26
1166	0.22
1167	0.14
1168	0.11
1169	0.08
1170	0.07
1171	0.07
1172	0.07
1173	0.08
1174	0.09
1175	0.11
1176	0.14
1177	0.15
1178	0.17
1179	0.2
1180	0.27
1181	0.29
1182	0.3
1183	0.28
1184	0.26

C9SI41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer