Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9STN3

Protein Details
Accession C9STN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
518-538VSLRARPAVSPRRRRAWPCQRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
496-532RRAHPPAFPKNTKPPEVTRIRPVSLRARPAVSPRRRR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, cyto 5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043154  Sec-1-like_dom1  
IPR043127  Sec-1-like_dom3a  
IPR001619  Sec1-like  
IPR027482  Sec1-like_dom2  
IPR036045  Sec1-like_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG val:VDBG_08304  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00995  Sec1  
Amino Acid Sequences MGGPSIIQEQRDLLLSTIKNITRGDVSHQALSSPNLHAPDTTRCKTDRDDPVQWKVLVVDESANKLIENVATEDDVLNLNVANIEHIEKKREMNPTMDAIYILSPKPHVIECLLADLDRRRYQNAFLVWTGVVDPRLRRRIDESPGKRMIRCFETLAIDFFPRESNLATFRDPWSFPILYNPECNDLIREHLQGLAQKILGVCVTLGEYPRVRYYKPANAMHEASVLCEHLARMVQEELDTYANWNQDYPPQTNRPASTLIITDRSMDITAPLVHEFTYQAMAHDLLPIREGEKIMYHTVTDKGTPDEAEIDYEITDKDKVWTDYRHQHMKDTIGRMTVDFKKFLEANPAFVNEQTGPGSVNNLRDMLGGMKEFAAQKESFSLHMSMAQDAMNLFQQYKLPDVASVEQSLATGMDEDNRRPKNILESVVRLLDDQAITPSDRLRLIILYILYREGVIENDITLLLEHAKLPRDEAVVVKNLAHLGGRVLHNLKEARRAHPPAFPKNTKPPEVTRIRPVSLRARPAVSPRRRRAWPCQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.23
4 0.29
5 0.29
6 0.3
7 0.29
8 0.31
9 0.27
10 0.28
11 0.31
12 0.33
13 0.35
14 0.35
15 0.35
16 0.33
17 0.32
18 0.33
19 0.29
20 0.23
21 0.23
22 0.22
23 0.22
24 0.22
25 0.24
26 0.32
27 0.38
28 0.37
29 0.39
30 0.38
31 0.42
32 0.46
33 0.52
34 0.52
35 0.52
36 0.59
37 0.62
38 0.68
39 0.71
40 0.66
41 0.56
42 0.46
43 0.41
44 0.32
45 0.26
46 0.22
47 0.18
48 0.21
49 0.22
50 0.21
51 0.18
52 0.17
53 0.17
54 0.13
55 0.14
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.1
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.1
72 0.16
73 0.18
74 0.23
75 0.24
76 0.28
77 0.33
78 0.4
79 0.4
80 0.37
81 0.39
82 0.38
83 0.38
84 0.34
85 0.28
86 0.21
87 0.21
88 0.19
89 0.16
90 0.13
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.15
98 0.15
99 0.18
100 0.18
101 0.16
102 0.18
103 0.2
104 0.26
105 0.28
106 0.28
107 0.28
108 0.29
109 0.32
110 0.36
111 0.35
112 0.32
113 0.28
114 0.28
115 0.25
116 0.24
117 0.22
118 0.16
119 0.15
120 0.14
121 0.17
122 0.23
123 0.31
124 0.31
125 0.32
126 0.37
127 0.43
128 0.49
129 0.56
130 0.53
131 0.55
132 0.63
133 0.63
134 0.58
135 0.54
136 0.5
137 0.44
138 0.41
139 0.34
140 0.28
141 0.3
142 0.29
143 0.28
144 0.24
145 0.2
146 0.18
147 0.16
148 0.14
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.14
154 0.16
155 0.17
156 0.18
157 0.2
158 0.22
159 0.22
160 0.22
161 0.24
162 0.22
163 0.2
164 0.26
165 0.28
166 0.26
167 0.29
168 0.28
169 0.26
170 0.26
171 0.26
172 0.2
173 0.17
174 0.19
175 0.19
176 0.18
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.17
181 0.18
182 0.15
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.08
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.16
198 0.17
199 0.17
200 0.21
201 0.27
202 0.32
203 0.39
204 0.43
205 0.42
206 0.45
207 0.46
208 0.41
209 0.37
210 0.3
211 0.22
212 0.17
213 0.14
214 0.1
215 0.08
216 0.08
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.14
235 0.17
236 0.18
237 0.21
238 0.23
239 0.27
240 0.3
241 0.3
242 0.28
243 0.26
244 0.24
245 0.2
246 0.18
247 0.16
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.11
252 0.12
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.1
272 0.1
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.1
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.06
303 0.07
304 0.06
305 0.08
306 0.11
307 0.13
308 0.16
309 0.2
310 0.25
311 0.33
312 0.39
313 0.46
314 0.43
315 0.44
316 0.43
317 0.46
318 0.46
319 0.41
320 0.36
321 0.3
322 0.29
323 0.26
324 0.3
325 0.3
326 0.26
327 0.24
328 0.22
329 0.24
330 0.24
331 0.24
332 0.29
333 0.22
334 0.23
335 0.24
336 0.25
337 0.22
338 0.22
339 0.24
340 0.14
341 0.15
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.14
347 0.13
348 0.15
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.14
354 0.12
355 0.11
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.15
366 0.16
367 0.15
368 0.16
369 0.17
370 0.13
371 0.17
372 0.17
373 0.14
374 0.14
375 0.13
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.12
384 0.12
385 0.14
386 0.15
387 0.13
388 0.13
389 0.16
390 0.18
391 0.17
392 0.17
393 0.15
394 0.14
395 0.14
396 0.13
397 0.1
398 0.07
399 0.06
400 0.05
401 0.11
402 0.12
403 0.16
404 0.24
405 0.26
406 0.28
407 0.28
408 0.3
409 0.33
410 0.37
411 0.4
412 0.36
413 0.38
414 0.39
415 0.39
416 0.38
417 0.29
418 0.25
419 0.21
420 0.17
421 0.13
422 0.12
423 0.12
424 0.13
425 0.13
426 0.14
427 0.13
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.13
432 0.13
433 0.15
434 0.15
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.13
439 0.12
440 0.11
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.09
454 0.11
455 0.15
456 0.15
457 0.18
458 0.2
459 0.21
460 0.21
461 0.22
462 0.24
463 0.24
464 0.25
465 0.23
466 0.22
467 0.2
468 0.2
469 0.17
470 0.13
471 0.11
472 0.16
473 0.16
474 0.2
475 0.22
476 0.23
477 0.28
478 0.33
479 0.33
480 0.37
481 0.39
482 0.39
483 0.46
484 0.52
485 0.49
486 0.52
487 0.58
488 0.59
489 0.66
490 0.68
491 0.66
492 0.71
493 0.76
494 0.75
495 0.72
496 0.68
497 0.68
498 0.71
499 0.68
500 0.67
501 0.66
502 0.63
503 0.6
504 0.59
505 0.6
506 0.59
507 0.6
508 0.55
509 0.52
510 0.52
511 0.59
512 0.64
513 0.64
514 0.67
515 0.69
516 0.73
517 0.79
518 0.83