FuNGI

C9SI40

Protein Details

Accession

C9SI40

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
204-233	RSEAEVKKSLARKKKRRREKAKDGKTEDEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
210-226	KKSLARKKKRRREKAKD

Subcellular Location(s)

mito 9, cyto 7.5, cyto_nucl 6, nucl 3.5, extr 2, plas 1, pero 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR010920 LSM_dom_sf IPR011047 Quinoprotein_ADH-like_supfam IPR047575 Sm IPR001163 Sm_dom_euk/arc IPR007148 SSU_processome_Utp12 IPR016654 U6_snRNA_Lsm2 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	val:VDBG_04722 -
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM PF04003 Utp12 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS52002 SM PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd01725 LSm2 cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MVKSYLKYEHTKSFGVVASSTSNLVWTSKDRNGTGAGQVVVAANEEVLSWDIKKGELLSRWRDDKCTLPVTAIAQSKADKDVYAVGYEDGSIRLWDSKIATVIVNFQGHSSAITHLAFDKAGVRLASGSKDTDVIIWDLVAEVGQYKLRGHKDQVTGLRFVEPEAQPDDEEDSKDRATEVVFHPKRDYFAVHGSEKSTEVWRIRSEAEVKKSLARKKKRRREKAKDGKTEDEEMGDAADAADDLSGAEASDYFVQYVIVRTGGKVRSVDWAVGSGSKSIQLVVGTTNNQLEYYSIPTKDSGKARKEDTPDYTRSLSVDLPGHRTDVRSVSLSSDDKMLASASNGSLKIWNIKTQTCIRTFECGYALCCSFLPGDKVVVVGTKGGELELFDVASASLLDSVTAHEGAIWSLQVHPDGKSMVSGSADKTAKFWNFQIVQEEILGTTRTTPKLKLAQSRILKVADDILSLKFSPDAKLLAVSLLDSTVKVFFVDSLKLYLNLYGHKLPVLSMDISYDSKLIITSSADKNIRIWGLDFGDCHKALFGHQDSILQVAFVPHNSDGNGHHFFSASKDRCIKYWDGDKFEQIQRLDGHHGEVWAMAVSHSGRTLVSAGHDKSIRVWDETDEQIFLEEEREKELEELYESTLTGSLERDPDAEDANGEVGAATKQTVETLMAGERIAEALELGMADLNLLKEYEQAKLTNRHAQPPQRNVIFVALGNISAETHVMSVLQRIKASALHDALLVLPFSTVPMLFTFLDLFAQRSMNMPLTCRILFFMLKTHHRQIVSSRTMRTMLDGIRANLRAALRKQKNEMGYNIAALKVVGMQLQAKSVKDYVDETWDEENDSKVVRKRATSITTLKAHPSSSLPYSSSPQKRLDKMLFFSFFKTLIDHEVTIELKNDIQIRGTLKSVDQYLNIKLEDISVVEELKYPHLSSVKNVFIRGSVVRYVHLPAASVDVPLLEDATRREAAAQQAKAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.36
3	0.3
4	0.24
5	0.22
6	0.22
7	0.22
8	0.17
9	0.15
10	0.14
11	0.15
12	0.15
13	0.17
14	0.23
15	0.28
16	0.34
17	0.34
18	0.35
19	0.39
20	0.38
21	0.37
22	0.34
23	0.29
24	0.23
25	0.23
26	0.2
27	0.16
28	0.15
29	0.11
30	0.07
31	0.06
32	0.06
33	0.07
34	0.07
35	0.09
36	0.08
37	0.11
38	0.12
39	0.12
40	0.14
41	0.15
42	0.21
43	0.27
44	0.34
45	0.4
46	0.48
47	0.54
48	0.54
49	0.56
50	0.52
51	0.52
52	0.52
53	0.48
54	0.41
55	0.36
56	0.37
57	0.35
58	0.39
59	0.35
60	0.29
61	0.26
62	0.28
63	0.28
64	0.28
65	0.26
66	0.19
67	0.17
68	0.22
69	0.21
70	0.2
71	0.19
72	0.17
73	0.16
74	0.16
75	0.16
76	0.1
77	0.1
78	0.09
79	0.09
80	0.11
81	0.11
82	0.14
83	0.15
84	0.16
85	0.17
86	0.18
87	0.18
88	0.16
89	0.2
90	0.22
91	0.22
92	0.19
93	0.18
94	0.18
95	0.17
96	0.18
97	0.15
98	0.11
99	0.13
100	0.13
101	0.14
102	0.14
103	0.15
104	0.14
105	0.13
106	0.14
107	0.12
108	0.15
109	0.14
110	0.13
111	0.14
112	0.16
113	0.18
114	0.17
115	0.18
116	0.15
117	0.16
118	0.16
119	0.15
120	0.15
121	0.13
122	0.11
123	0.1
124	0.09
125	0.08
126	0.08
127	0.07
128	0.05
129	0.04
130	0.06
131	0.07
132	0.08
133	0.1
134	0.17
135	0.22
136	0.27
137	0.31
138	0.38
139	0.42
140	0.49
141	0.56
142	0.52
143	0.49
144	0.45
145	0.43
146	0.35
147	0.31
148	0.31
149	0.23
150	0.23
151	0.24
152	0.24
153	0.21
154	0.22
155	0.26
156	0.19
157	0.21
158	0.2
159	0.21
160	0.2
161	0.2
162	0.19
163	0.15
164	0.14
165	0.18
166	0.19
167	0.28
168	0.3
169	0.32
170	0.35
171	0.36
172	0.37
173	0.34
174	0.32
175	0.25
176	0.3
177	0.34
178	0.33
179	0.33
180	0.32
181	0.31
182	0.3
183	0.27
184	0.23
185	0.23
186	0.23
187	0.25
188	0.26
189	0.27
190	0.27
191	0.3
192	0.35
193	0.36
194	0.4
195	0.4
196	0.4
197	0.44
198	0.5
199	0.54
200	0.56
201	0.6
202	0.65
203	0.72
204	0.82
205	0.87
206	0.91
207	0.94
208	0.95
209	0.95
210	0.96
211	0.95
212	0.95
213	0.9
214	0.86
215	0.79
216	0.71
217	0.6
218	0.5
219	0.39
220	0.28
221	0.22
222	0.14
223	0.1
224	0.06
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.15
249	0.16
250	0.19
251	0.18
252	0.18
253	0.23
254	0.24
255	0.24
256	0.18
257	0.18
258	0.16
259	0.17
260	0.17
261	0.12
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.09
266	0.1
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.11
271	0.11
272	0.13
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.11
278	0.1
279	0.14
280	0.17
281	0.16
282	0.17
283	0.18
284	0.21
285	0.26
286	0.32
287	0.34
288	0.37
289	0.41
290	0.44
291	0.49
292	0.51
293	0.51
294	0.5
295	0.48
296	0.45
297	0.45
298	0.43
299	0.37
300	0.32
301	0.29
302	0.22
303	0.19
304	0.2
305	0.18
306	0.21
307	0.21
308	0.22
309	0.21
310	0.21
311	0.2
312	0.18
313	0.19
314	0.16
315	0.16
316	0.16
317	0.2
318	0.2
319	0.18
320	0.17
321	0.15
322	0.13
323	0.13
324	0.12
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.07
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.11
333	0.12
334	0.18
335	0.17
336	0.21
337	0.21
338	0.22
339	0.27
340	0.32
341	0.37
342	0.33
343	0.36
344	0.33
345	0.36
346	0.36
347	0.33
348	0.28
349	0.23
350	0.21
351	0.2
352	0.19
353	0.14
354	0.13
355	0.12
356	0.11
357	0.12
358	0.12
359	0.1
360	0.11
361	0.1
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.04
396	0.04
397	0.05
398	0.07
399	0.07
400	0.08
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.08
407	0.08
408	0.09
409	0.09
410	0.15
411	0.16
412	0.15
413	0.16
414	0.2
415	0.2
416	0.21
417	0.2
418	0.2
419	0.22
420	0.23
421	0.24
422	0.21
423	0.2
424	0.18
425	0.18
426	0.11
427	0.1
428	0.09
429	0.06
430	0.08
431	0.1
432	0.12
433	0.14
434	0.14
435	0.18
436	0.25
437	0.29
438	0.35
439	0.37
440	0.43
441	0.45
442	0.47
443	0.45
444	0.38
445	0.34
446	0.26
447	0.24
448	0.16
449	0.13
450	0.12
451	0.09
452	0.1
453	0.1
454	0.1
455	0.08
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.08
464	0.07
465	0.06
466	0.05
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.05
476	0.06
477	0.07
478	0.07
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.1
483	0.1
484	0.1
485	0.1
486	0.12
487	0.11
488	0.11
489	0.1
490	0.1
491	0.09
492	0.1
493	0.1
494	0.08
495	0.07
496	0.08
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.08
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.05
506	0.05
507	0.09
508	0.11
509	0.16
510	0.17
511	0.17
512	0.17
513	0.19
514	0.18
515	0.14
516	0.14
517	0.11
518	0.12
519	0.13
520	0.12
521	0.12
522	0.16
523	0.15
524	0.14
525	0.12
526	0.1
527	0.1
528	0.16
529	0.15
530	0.13
531	0.13
532	0.15
533	0.14
534	0.15
535	0.15
536	0.08
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.06
541	0.08
542	0.07
543	0.08
544	0.08
545	0.09
546	0.09
547	0.15
548	0.17
549	0.16
550	0.15
551	0.15
552	0.15
553	0.18
554	0.26
555	0.23
556	0.24
557	0.3
558	0.3
559	0.31
560	0.35
561	0.33
562	0.28
563	0.35
564	0.36
565	0.37
566	0.37
567	0.38
568	0.39
569	0.4
570	0.4
571	0.31
572	0.3
573	0.25
574	0.26
575	0.27
576	0.22
577	0.21
578	0.17
579	0.17
580	0.13
581	0.12
582	0.1
583	0.07
584	0.07
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.05
592	0.06
593	0.07
594	0.06
595	0.08
596	0.13
597	0.13
598	0.16
599	0.17
600	0.17
601	0.18
602	0.23
603	0.22
604	0.18
605	0.18
606	0.17
607	0.2
608	0.21
609	0.2
610	0.15
611	0.14
612	0.13
613	0.12
614	0.1
615	0.09
616	0.09
617	0.09
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.12
622	0.12
623	0.1
624	0.1
625	0.1
626	0.09
627	0.09
628	0.09
629	0.09
630	0.09
631	0.09
632	0.08
633	0.08
634	0.08
635	0.09
636	0.09
637	0.09
638	0.1
639	0.11
640	0.12
641	0.11
642	0.1
643	0.09
644	0.09
645	0.08
646	0.06
647	0.05
648	0.04
649	0.05
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.06
658	0.07
659	0.07
660	0.08
661	0.08
662	0.07
663	0.07
664	0.06
665	0.06
666	0.04
667	0.04
668	0.03
669	0.03
670	0.03
671	0.03
672	0.03
673	0.03
674	0.03
675	0.04
676	0.04
677	0.04
678	0.05
679	0.05
680	0.09
681	0.1
682	0.12
683	0.13
684	0.15
685	0.2
686	0.27
687	0.31
688	0.36
689	0.37
690	0.41
691	0.47
692	0.54
693	0.59
694	0.59
695	0.63
696	0.55
697	0.54
698	0.49
699	0.44
700	0.35
701	0.26
702	0.21
703	0.13
704	0.12
705	0.11
706	0.1
707	0.08
708	0.06
709	0.07
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.05
714	0.05
715	0.1
716	0.14
717	0.16
718	0.16
719	0.16
720	0.17
721	0.19
722	0.21
723	0.21
724	0.18
725	0.16
726	0.16
727	0.16
728	0.16
729	0.14
730	0.12
731	0.07
732	0.06
733	0.05
734	0.05
735	0.06
736	0.05
737	0.05
738	0.06
739	0.09
740	0.09
741	0.1
742	0.1
743	0.1
744	0.12
745	0.11
746	0.12
747	0.1
748	0.11
749	0.1
750	0.12
751	0.14
752	0.18
753	0.19
754	0.19
755	0.2
756	0.25
757	0.25
758	0.23
759	0.21
760	0.19
761	0.19
762	0.17
763	0.22
764	0.23
765	0.3
766	0.35
767	0.39
768	0.41
769	0.41
770	0.42
771	0.42
772	0.45
773	0.48
774	0.47
775	0.44
776	0.41
777	0.43
778	0.41
779	0.37
780	0.32
781	0.24
782	0.26
783	0.26
784	0.25
785	0.29
786	0.3
787	0.27
788	0.26
789	0.26
790	0.26
791	0.29
792	0.39
793	0.41
794	0.46
795	0.51
796	0.54
797	0.59
798	0.57
799	0.55
800	0.51
801	0.44
802	0.41
803	0.36
804	0.3
805	0.23
806	0.18
807	0.15
808	0.09
809	0.09
810	0.07
811	0.07
812	0.1
813	0.1
814	0.15
815	0.17
816	0.17
817	0.19
818	0.2
819	0.19
820	0.19
821	0.21
822	0.18
823	0.22
824	0.23
825	0.23
826	0.24
827	0.24
828	0.24
829	0.22
830	0.22
831	0.17
832	0.17
833	0.2
834	0.23
835	0.3
836	0.31
837	0.33
838	0.37
839	0.44
840	0.47
841	0.49
842	0.49
843	0.5
844	0.52
845	0.51
846	0.51
847	0.44
848	0.41
849	0.35
850	0.32
851	0.3
852	0.28
853	0.29
854	0.26
855	0.27
856	0.31
857	0.39
858	0.44
859	0.44
860	0.49
861	0.54
862	0.57
863	0.63
864	0.66
865	0.63
866	0.6
867	0.63
868	0.6
869	0.53
870	0.51
871	0.44
872	0.37
873	0.31
874	0.27
875	0.2
876	0.2
877	0.22
878	0.2
879	0.19
880	0.22
881	0.22
882	0.22
883	0.22
884	0.17
885	0.14
886	0.17
887	0.19
888	0.17
889	0.17
890	0.2
891	0.22
892	0.23
893	0.24
894	0.22
895	0.21
896	0.24
897	0.26
898	0.25
899	0.25
900	0.26
901	0.29
902	0.31
903	0.3
904	0.27
905	0.23
906	0.22
907	0.19
908	0.16
909	0.14
910	0.11
911	0.12
912	0.11
913	0.14
914	0.14
915	0.17
916	0.19
917	0.17
918	0.21
919	0.25
920	0.25
921	0.29
922	0.36
923	0.41
924	0.41
925	0.41
926	0.37
927	0.34
928	0.37
929	0.33
930	0.29
931	0.26
932	0.24
933	0.24
934	0.25
935	0.27
936	0.27
937	0.24
938	0.21
939	0.17
940	0.22
941	0.21
942	0.19
943	0.16
944	0.13
945	0.13
946	0.12
947	0.13
948	0.07
949	0.09
950	0.11
951	0.16
952	0.17
953	0.16
954	0.18
955	0.21
956	0.3
957	0.37

C9SI40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer