Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHV2

Protein Details
Accession C9SHV2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-92INGLIGAWQRKRRRRRSAKGRQARMGHGHydrophilic
308-328TATARQKLRLAKRKIDKWVEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-91RKRRRRRSAKGRQARMGH
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG val:VDBG_04634  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MSHVHGRPFVRLQSHGTWVSRHRFRETIQQRDAGSAFASSGTPACQRRLPIHVFPEGIQPASIQINGLIGAWQRKRRRRRSAKGRQARMGHGQGAHPLCRPPQAARGAGGRRVHAGRQDEQHLRGRPNAQGDPGDVFAAGGELPGAEAAEAHGGLWVAFREAEISPDAFMLNQLMESHSQFGDIDEAQELYRSLVHQRGVKPDSYTFMALWKMIGVNRLQILSEDRAAGEIRLTRETFAETVRFAHVFKGQSLDGQLARKMLHTFRRLKDNLGLVVAMRALRAVFGYVPPEVLGLEMVVGTTNLAWDTATARQKLRLAKRKIDKWVEDRQKQLGRPVRTLDDMTPEERGLEMMEYLESEYLPAARNIEDDLADVAREMGVYDIVKDH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.46
3 0.43
4 0.42
5 0.45
6 0.52
7 0.53
8 0.53
9 0.52
10 0.51
11 0.52
12 0.58
13 0.6
14 0.6
15 0.58
16 0.59
17 0.53
18 0.53
19 0.51
20 0.41
21 0.32
22 0.22
23 0.17
24 0.13
25 0.12
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.16
30 0.19
31 0.22
32 0.24
33 0.28
34 0.31
35 0.39
36 0.43
37 0.43
38 0.45
39 0.47
40 0.45
41 0.42
42 0.45
43 0.39
44 0.33
45 0.26
46 0.21
47 0.19
48 0.19
49 0.18
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.09
57 0.16
58 0.22
59 0.3
60 0.39
61 0.49
62 0.6
63 0.69
64 0.78
65 0.82
66 0.88
67 0.91
68 0.93
69 0.95
70 0.95
71 0.93
72 0.9
73 0.83
74 0.77
75 0.73
76 0.66
77 0.58
78 0.49
79 0.41
80 0.39
81 0.37
82 0.33
83 0.27
84 0.25
85 0.23
86 0.25
87 0.27
88 0.23
89 0.28
90 0.31
91 0.31
92 0.31
93 0.38
94 0.36
95 0.4
96 0.39
97 0.32
98 0.31
99 0.31
100 0.31
101 0.29
102 0.31
103 0.29
104 0.32
105 0.38
106 0.37
107 0.4
108 0.45
109 0.44
110 0.41
111 0.42
112 0.4
113 0.37
114 0.39
115 0.36
116 0.31
117 0.27
118 0.27
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.12
123 0.1
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.04
128 0.03
129 0.02
130 0.02
131 0.03
132 0.03
133 0.02
134 0.02
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.1
182 0.12
183 0.16
184 0.18
185 0.25
186 0.26
187 0.27
188 0.27
189 0.25
190 0.25
191 0.23
192 0.22
193 0.14
194 0.15
195 0.14
196 0.12
197 0.11
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.12
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.13
220 0.14
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.13
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.14
245 0.15
246 0.15
247 0.17
248 0.2
249 0.25
250 0.32
251 0.39
252 0.41
253 0.51
254 0.5
255 0.51
256 0.51
257 0.47
258 0.4
259 0.33
260 0.29
261 0.19
262 0.19
263 0.17
264 0.11
265 0.07
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.07
295 0.14
296 0.19
297 0.22
298 0.23
299 0.27
300 0.32
301 0.41
302 0.5
303 0.53
304 0.55
305 0.62
306 0.71
307 0.75
308 0.8
309 0.8
310 0.77
311 0.74
312 0.77
313 0.78
314 0.74
315 0.71
316 0.7
317 0.67
318 0.62
319 0.65
320 0.63
321 0.57
322 0.56
323 0.57
324 0.52
325 0.48
326 0.49
327 0.41
328 0.39
329 0.37
330 0.34
331 0.31
332 0.27
333 0.24
334 0.21
335 0.19
336 0.13
337 0.11
338 0.1
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.12
353 0.14
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.15
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.08
367 0.08