FuNGI

C9SE54

Protein Details

Accession

C9SE54

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
570-595	IQAKYQRTRIKDKSWHPKHVKGGQKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005607 BSD_dom IPR011993 PH-like_dom_sf IPR027079 Tfb1/GTF2H1 IPR013876 TFIIH_BTF_p62_N
Gene Ontology	GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0006289 P:nucleotide-excision repair
KEGG	val:VDBG_03410 -
Pfam	View protein in Pfam PF03909 BSD PF08567 PH_TFIIH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50858 BSD
CDD	cd13229 PH_TFIIH

Amino Acid Sequences

MSARTPRVSAPQHLKLAARFTADTLTDLQQTPDTAAKVMLRIIEKAPDATEQTPYSFHFTSPDARAEANAVKDVLSKLLQDLRSGDPNLPKPASSTGTPNANGEGNGGVSASMAFASSVNSKPAPPRWFDDGQLKSDIELQQSLMKADRNLYQTYVDARATKPDSISDAAFNSQFWSTRTNLLRAHAIEMNQKRGSYNVLSTIKPRTEGEELKLNISVEQVQLIFSQHPLIKRLYNENVPKITEAEFWSRFFLSKLSRTLRGDKVQDEKKEGIVRDPLFDNHDESENTLGFQSRIMAQSVPNIINVEANEENQGGFRSGNQADFEMRPRKNVLIVKTLNSLSEKIMANVAPSDIEAEQTNGNEDATFGQLALRDLQGDVEEQRVILNVKEQSRFFSKHEDTQSANARIFSRQVAADVLSSVRRELRLMATDNSGALDLHAGISVDDQSDSDEETRKPPRVGSRATRKLAEDDVMAGVKRRRMEKYGTGSDATDLMGLQPELAERCQLTHATTVEFLHQFWTAFLSGDPDRAAELQYLVESLKRSEERIHAVAGDAEKARKALIEAKTAEIQAKYQRTRIKDKSWHPKHVKGGQKAVFQMMQPITDALKKAQADYQRALAAEGVQATTENQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.52
3	0.52
4	0.46
5	0.4
6	0.32
7	0.29
8	0.3
9	0.27
10	0.26
11	0.24
12	0.23
13	0.23
14	0.23
15	0.23
16	0.2
17	0.2
18	0.21
19	0.21
20	0.2
21	0.17
22	0.19
23	0.19
24	0.18
25	0.19
26	0.21
27	0.19
28	0.21
29	0.22
30	0.24
31	0.24
32	0.24
33	0.24
34	0.22
35	0.25
36	0.24
37	0.27
38	0.24
39	0.24
40	0.25
41	0.25
42	0.29
43	0.25
44	0.24
45	0.22
46	0.23
47	0.28
48	0.3
49	0.31
50	0.27
51	0.26
52	0.26
53	0.28
54	0.29
55	0.24
56	0.23
57	0.19
58	0.18
59	0.2
60	0.2
61	0.19
62	0.16
63	0.14
64	0.16
65	0.22
66	0.23
67	0.22
68	0.25
69	0.26
70	0.31
71	0.32
72	0.33
73	0.34
74	0.39
75	0.44
76	0.41
77	0.37
78	0.34
79	0.37
80	0.36
81	0.3
82	0.31
83	0.29
84	0.35
85	0.35
86	0.33
87	0.31
88	0.28
89	0.26
90	0.21
91	0.17
92	0.11
93	0.1
94	0.09
95	0.07
96	0.06
97	0.06
98	0.05
99	0.04
100	0.04
101	0.04
102	0.04
103	0.07
104	0.1
105	0.11
106	0.14
107	0.15
108	0.17
109	0.22
110	0.3
111	0.32
112	0.33
113	0.37
114	0.41
115	0.42
116	0.44
117	0.48
118	0.43
119	0.42
120	0.42
121	0.37
122	0.3
123	0.33
124	0.31
125	0.24
126	0.21
127	0.19
128	0.19
129	0.19
130	0.2
131	0.17
132	0.17
133	0.16
134	0.18
135	0.22
136	0.22
137	0.23
138	0.24
139	0.23
140	0.22
141	0.24
142	0.25
143	0.21
144	0.2
145	0.19
146	0.24
147	0.26
148	0.26
149	0.23
150	0.21
151	0.23
152	0.23
153	0.23
154	0.18
155	0.17
156	0.17
157	0.17
158	0.15
159	0.14
160	0.13
161	0.13
162	0.12
163	0.14
164	0.14
165	0.22
166	0.25
167	0.27
168	0.28
169	0.29
170	0.33
171	0.3
172	0.32
173	0.27
174	0.26
175	0.3
176	0.31
177	0.35
178	0.32
179	0.31
180	0.28
181	0.26
182	0.29
183	0.22
184	0.21
185	0.23
186	0.25
187	0.25
188	0.27
189	0.32
190	0.29
191	0.28
192	0.27
193	0.23
194	0.26
195	0.28
196	0.29
197	0.32
198	0.31
199	0.31
200	0.32
201	0.27
202	0.22
203	0.2
204	0.18
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.11
214	0.12
215	0.13
216	0.15
217	0.17
218	0.19
219	0.21
220	0.27
221	0.27
222	0.33
223	0.37
224	0.39
225	0.39
226	0.37
227	0.35
228	0.3
229	0.27
230	0.22
231	0.2
232	0.22
233	0.21
234	0.21
235	0.23
236	0.21
237	0.2
238	0.18
239	0.19
240	0.17
241	0.19
242	0.25
243	0.27
244	0.32
245	0.34
246	0.4
247	0.43
248	0.44
249	0.42
250	0.39
251	0.44
252	0.45
253	0.44
254	0.43
255	0.38
256	0.36
257	0.38
258	0.35
259	0.29
260	0.29
261	0.28
262	0.25
263	0.25
264	0.23
265	0.21
266	0.21
267	0.2
268	0.14
269	0.16
270	0.14
271	0.13
272	0.14
273	0.12
274	0.11
275	0.1
276	0.09
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.08
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.11
286	0.14
287	0.13
288	0.12
289	0.12
290	0.11
291	0.12
292	0.11
293	0.12
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.09
300	0.09
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.09
305	0.1
306	0.11
307	0.11
308	0.11
309	0.13
310	0.14
311	0.19
312	0.22
313	0.22
314	0.23
315	0.24
316	0.24
317	0.28
318	0.31
319	0.28
320	0.29
321	0.3
322	0.3
323	0.31
324	0.31
325	0.26
326	0.23
327	0.21
328	0.13
329	0.17
330	0.15
331	0.12
332	0.14
333	0.13
334	0.12
335	0.11
336	0.11
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.07
346	0.09
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.07
351	0.06
352	0.07
353	0.07
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.08
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.07
373	0.11
374	0.13
375	0.17
376	0.2
377	0.21
378	0.23
379	0.28
380	0.31
381	0.28
382	0.34
383	0.33
384	0.37
385	0.41
386	0.4
387	0.37
388	0.4
389	0.46
390	0.39
391	0.37
392	0.32
393	0.29
394	0.27
395	0.26
396	0.21
397	0.16
398	0.13
399	0.13
400	0.12
401	0.11
402	0.11
403	0.1
404	0.1
405	0.09
406	0.1
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.12
412	0.14
413	0.17
414	0.2
415	0.21
416	0.21
417	0.21
418	0.21
419	0.19
420	0.16
421	0.11
422	0.08
423	0.07
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.06
431	0.06
432	0.05
433	0.05
434	0.06
435	0.06
436	0.08
437	0.09
438	0.12
439	0.13
440	0.19
441	0.24
442	0.27
443	0.28
444	0.31
445	0.38
446	0.42
447	0.49
448	0.52
449	0.58
450	0.64
451	0.66
452	0.64
453	0.57
454	0.53
455	0.48
456	0.39
457	0.29
458	0.21
459	0.19
460	0.17
461	0.16
462	0.16
463	0.16
464	0.18
465	0.21
466	0.24
467	0.27
468	0.3
469	0.37
470	0.42
471	0.49
472	0.52
473	0.52
474	0.48
475	0.44
476	0.41
477	0.35
478	0.26
479	0.17
480	0.1
481	0.07
482	0.08
483	0.07
484	0.06
485	0.06
486	0.07
487	0.08
488	0.09
489	0.1
490	0.09
491	0.1
492	0.13
493	0.14
494	0.14
495	0.17
496	0.18
497	0.18
498	0.19
499	0.19
500	0.21
501	0.21
502	0.19
503	0.16
504	0.17
505	0.15
506	0.14
507	0.16
508	0.12
509	0.11
510	0.11
511	0.14
512	0.14
513	0.15
514	0.15
515	0.13
516	0.13
517	0.13
518	0.14
519	0.1
520	0.11
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.09
525	0.11
526	0.11
527	0.11
528	0.17
529	0.18
530	0.2
531	0.24
532	0.29
533	0.34
534	0.35
535	0.35
536	0.28
537	0.28
538	0.29
539	0.25
540	0.23
541	0.18
542	0.17
543	0.17
544	0.17
545	0.16
546	0.14
547	0.15
548	0.2
549	0.22
550	0.29
551	0.3
552	0.34
553	0.36
554	0.36
555	0.37
556	0.3
557	0.29
558	0.3
559	0.37
560	0.36
561	0.4
562	0.46
563	0.49
564	0.59
565	0.64
566	0.66
567	0.67
568	0.74
569	0.79
570	0.82
571	0.87
572	0.84
573	0.84
574	0.84
575	0.83
576	0.82
577	0.79
578	0.8
579	0.75
580	0.73
581	0.66
582	0.61
583	0.54
584	0.44
585	0.44
586	0.35
587	0.3
588	0.25
589	0.24
590	0.21
591	0.22
592	0.24
593	0.18
594	0.23
595	0.23
596	0.25
597	0.29
598	0.35
599	0.38
600	0.39
601	0.42
602	0.38
603	0.37
604	0.36
605	0.31
606	0.25
607	0.2
608	0.18
609	0.14
610	0.11

C9SE54

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer