Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S9B3

Protein Details
Accession C9S9B3    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-187WQDHRLYQVRHRRHCHGHRWPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18, cyto 5.5, cyto_nucl 5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000876  Ribosomal_S4e  
IPR013845  Ribosomal_S4e_central_region  
IPR038237  Ribosomal_S4e_central_sf  
IPR013843  Ribosomal_S4e_N  
IPR018199  Ribosomal_S4e_N_CS  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG val:VDBG_02085  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00900  Ribosomal_S4e  
PF08071  RS4NT  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00528  RIBOSOMAL_S4E  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MGKGLKKHQKRLSAPSHWLLDKLSGTYAPRPSAGPHKLRDCMPLIVFLRNRLKYALNFRETRSIMMQRLVKVDGKVRTDITYPAGFMDVITIEKTGENFRLIYDIKGRFTVHRIQAEEAEYKLGKVKRVQLGRGGVPFLVTHDARTIRYPDPLIKVNDTVKIDPCHWQDHRLYQVRHRRHCHGHRWP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.72
3 0.7
4 0.6
5 0.54
6 0.45
7 0.39
8 0.32
9 0.26
10 0.21
11 0.18
12 0.2
13 0.24
14 0.27
15 0.24
16 0.24
17 0.24
18 0.26
19 0.33
20 0.39
21 0.39
22 0.42
23 0.46
24 0.49
25 0.49
26 0.5
27 0.44
28 0.4
29 0.34
30 0.34
31 0.3
32 0.33
33 0.32
34 0.35
35 0.4
36 0.37
37 0.37
38 0.33
39 0.34
40 0.32
41 0.42
42 0.43
43 0.4
44 0.41
45 0.42
46 0.48
47 0.45
48 0.43
49 0.37
50 0.33
51 0.29
52 0.32
53 0.33
54 0.26
55 0.28
56 0.27
57 0.24
58 0.22
59 0.26
60 0.25
61 0.25
62 0.25
63 0.24
64 0.23
65 0.22
66 0.22
67 0.2
68 0.16
69 0.14
70 0.12
71 0.12
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.16
91 0.17
92 0.17
93 0.19
94 0.2
95 0.18
96 0.21
97 0.26
98 0.26
99 0.28
100 0.29
101 0.28
102 0.3
103 0.31
104 0.29
105 0.22
106 0.19
107 0.15
108 0.14
109 0.18
110 0.18
111 0.19
112 0.21
113 0.28
114 0.33
115 0.37
116 0.39
117 0.4
118 0.42
119 0.42
120 0.4
121 0.33
122 0.26
123 0.22
124 0.2
125 0.16
126 0.16
127 0.13
128 0.12
129 0.16
130 0.17
131 0.18
132 0.21
133 0.24
134 0.21
135 0.24
136 0.26
137 0.27
138 0.3
139 0.34
140 0.35
141 0.34
142 0.37
143 0.35
144 0.39
145 0.38
146 0.35
147 0.35
148 0.35
149 0.33
150 0.37
151 0.37
152 0.4
153 0.38
154 0.42
155 0.41
156 0.46
157 0.55
158 0.56
159 0.57
160 0.58
161 0.67
162 0.71
163 0.76
164 0.75
165 0.74
166 0.76
167 0.82