Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SM16

Protein Details
Accession C9SM16    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1143-1168TSNPVPKPTDPPKPKPPQPGTNKATCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024535  Pectate_lyase_SF_prot  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
IPR039279  QRT3-like  
Gene Ontology GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
KEGG val:VDBG_05940  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12708  Pectate_lyase_3  
Amino Acid Sequences MARRYPFSSILSLLLLLLSLAAVQSQAGKLHQEHGEAPVRRSTDGVVSLSGSLFETDNVVPGEQAHAAARPRLVPRQLRNSTTNANATISEAEQIVLAAQAEARGAQRPGSCPMCGRNRYEFHSPTPSKGLLSSSGDDNATGVNETVAEAAAVLTEVMIQNGTLSVDDESAASDGPLQARQSGTWWLEGMTQNGLSPFAPSGYKVWRNVKDYGAKGDGVTDDTAAINKAVSDQNRCGLDCGSTTTLQAVVYFPPGTYIISGSIIQYYHTQFIGHPTNRPVLKASPAFVGLGMISSDVYVEGGEGAQWYINQSNFLRQVRNFVLDMTSAPLQAYVAAIHWQVAQATSLQNIKFVMSTVAGNNQQGMFMENGSGGFMSDLEFVGGALGMYVGNQQFSVRNLKFSNHLSKAIEIHWDWGWTWKGVEISNCPVGIVMVSPDATTKVGSAIFIDSKITNCPVGLQLQKPAAKAAISLSLFSVTTSNVPAIVKYVDGATLLAGSTGTSTVAAWGVGKRYDTQNGEASGVQQSGAYPRAPVISGGLLKNPSSQTSGFFDRSKPQSIFFVARGVLIREHQTPSGCTGTAERALRPSTQYQTIDASNIFHGHDPDGSRPTFKDTPRAPAPFGTAPAIYKASDPTFDFCKPGERKCAVSWGVRIVNSEKIYIYGAGLYSWFDNYDQACVGTEDCQRRMVSIETSSDIWIYSLITKATIEMISPVGGVAVLGKDNKINYCDVVMAWLGSATGGSASKGVIYRSPISATVIPLSATTVPKGATLTIDRPVASNVVSLPKDGNQNQPKGPGASKCNTCDLARAISSTCCGTGGSLGNPINVPAGVPIPRPFLLPPGFVPNQPIVDTAGKEWQAGVPLTQEVEVPAGTVFTFPLIVPAGLPFSDKYTPEENQDDDDSGALYLPADFWEGEHTVSCRYPCTIVYPPSATTTTWIPPPLTTVVSSQTITFTVEKQTTEKVHISKTTVKTESGSQPTVIVAPVPAPKPLCISYTIPVVNIKVKFGLCPPDLKPFPPPIPKVTIIPVPPGGKPGPTTPGNKPSEEQEQQEDDETRDNPVCPFIPYISDDYDSGLPGYNPFDPENYDPDTDSYPWKNGGSGNNGGGGSSSGPGAGTGTPKTTTIPVPPKTTRTTTATTPVSTSNPVPKPTDPPKPKPPQPGTNKATCWGSGRQVYGHELQDALNKFCDYADGTRIHSNQEFAIAKSGSWWSMLHVGVTGKNNCEFTIRAQECKDILNEVVGCKPYSASLLRIGGYVENNCAVWNLDPDASLDGECPPIPIPLLRLFCAAKRVFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.12
3 0.08
4 0.06
5 0.04
6 0.03
7 0.03
8 0.03
9 0.03
10 0.04
11 0.06
12 0.08
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.17
17 0.23
18 0.26
19 0.26
20 0.26
21 0.31
22 0.39
23 0.38
24 0.39
25 0.38
26 0.38
27 0.35
28 0.35
29 0.3
30 0.26
31 0.27
32 0.26
33 0.22
34 0.21
35 0.22
36 0.21
37 0.19
38 0.14
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.11
43 0.11
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.13
48 0.13
49 0.15
50 0.12
51 0.13
52 0.11
53 0.14
54 0.17
55 0.19
56 0.21
57 0.23
58 0.28
59 0.34
60 0.42
61 0.47
62 0.54
63 0.62
64 0.67
65 0.68
66 0.67
67 0.65
68 0.63
69 0.59
70 0.55
71 0.45
72 0.4
73 0.34
74 0.32
75 0.28
76 0.23
77 0.18
78 0.14
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.11
92 0.12
93 0.16
94 0.19
95 0.22
96 0.29
97 0.31
98 0.31
99 0.31
100 0.38
101 0.44
102 0.46
103 0.49
104 0.51
105 0.53
106 0.58
107 0.63
108 0.59
109 0.55
110 0.61
111 0.56
112 0.52
113 0.53
114 0.48
115 0.4
116 0.38
117 0.34
118 0.28
119 0.31
120 0.29
121 0.25
122 0.26
123 0.25
124 0.24
125 0.21
126 0.17
127 0.13
128 0.11
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.09
163 0.12
164 0.12
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.17
169 0.22
170 0.21
171 0.2
172 0.2
173 0.18
174 0.22
175 0.24
176 0.23
177 0.19
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.17
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.14
189 0.22
190 0.28
191 0.33
192 0.42
193 0.48
194 0.51
195 0.54
196 0.57
197 0.56
198 0.53
199 0.52
200 0.46
201 0.39
202 0.35
203 0.33
204 0.27
205 0.21
206 0.19
207 0.13
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.1
212 0.09
213 0.07
214 0.06
215 0.09
216 0.13
217 0.16
218 0.22
219 0.23
220 0.29
221 0.31
222 0.31
223 0.3
224 0.26
225 0.24
226 0.2
227 0.22
228 0.2
229 0.18
230 0.18
231 0.17
232 0.17
233 0.15
234 0.15
235 0.11
236 0.09
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.1
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.14
258 0.21
259 0.29
260 0.27
261 0.29
262 0.3
263 0.37
264 0.37
265 0.38
266 0.35
267 0.28
268 0.34
269 0.32
270 0.3
271 0.25
272 0.26
273 0.24
274 0.21
275 0.19
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.07
295 0.09
296 0.09
297 0.13
298 0.14
299 0.19
300 0.26
301 0.29
302 0.32
303 0.29
304 0.36
305 0.35
306 0.38
307 0.32
308 0.26
309 0.24
310 0.2
311 0.2
312 0.17
313 0.14
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.05
321 0.05
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.1
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.14
345 0.15
346 0.15
347 0.16
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.13
352 0.09
353 0.07
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.08
381 0.1
382 0.19
383 0.18
384 0.22
385 0.23
386 0.25
387 0.29
388 0.33
389 0.4
390 0.33
391 0.37
392 0.33
393 0.34
394 0.34
395 0.31
396 0.3
397 0.21
398 0.2
399 0.17
400 0.17
401 0.15
402 0.18
403 0.19
404 0.15
405 0.15
406 0.14
407 0.15
408 0.16
409 0.18
410 0.16
411 0.19
412 0.21
413 0.2
414 0.18
415 0.16
416 0.15
417 0.13
418 0.1
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.06
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.1
436 0.09
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.1
441 0.09
442 0.1
443 0.1
444 0.14
445 0.17
446 0.16
447 0.19
448 0.24
449 0.26
450 0.25
451 0.25
452 0.21
453 0.18
454 0.17
455 0.14
456 0.15
457 0.13
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.06
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.04
488 0.03
489 0.03
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.06
495 0.07
496 0.08
497 0.09
498 0.1
499 0.12
500 0.17
501 0.19
502 0.21
503 0.23
504 0.23
505 0.24
506 0.22
507 0.21
508 0.17
509 0.15
510 0.12
511 0.09
512 0.08
513 0.08
514 0.1
515 0.09
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.08
522 0.09
523 0.11
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.13
528 0.15
529 0.15
530 0.13
531 0.14
532 0.14
533 0.15
534 0.18
535 0.22
536 0.22
537 0.22
538 0.23
539 0.26
540 0.29
541 0.32
542 0.29
543 0.26
544 0.25
545 0.27
546 0.28
547 0.22
548 0.21
549 0.16
550 0.16
551 0.16
552 0.14
553 0.12
554 0.11
555 0.13
556 0.12
557 0.14
558 0.14
559 0.15
560 0.14
561 0.17
562 0.17
563 0.14
564 0.13
565 0.12
566 0.13
567 0.17
568 0.17
569 0.14
570 0.16
571 0.17
572 0.17
573 0.19
574 0.2
575 0.18
576 0.22
577 0.22
578 0.21
579 0.22
580 0.22
581 0.2
582 0.17
583 0.15
584 0.11
585 0.11
586 0.1
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.1
591 0.1
592 0.12
593 0.14
594 0.14
595 0.14
596 0.14
597 0.2
598 0.24
599 0.23
600 0.3
601 0.28
602 0.35
603 0.4
604 0.42
605 0.36
606 0.31
607 0.35
608 0.27
609 0.27
610 0.21
611 0.15
612 0.13
613 0.14
614 0.14
615 0.1
616 0.1
617 0.1
618 0.1
619 0.11
620 0.11
621 0.12
622 0.15
623 0.15
624 0.16
625 0.14
626 0.22
627 0.24
628 0.26
629 0.31
630 0.29
631 0.31
632 0.31
633 0.37
634 0.3
635 0.3
636 0.28
637 0.25
638 0.25
639 0.23
640 0.24
641 0.19
642 0.21
643 0.2
644 0.19
645 0.15
646 0.13
647 0.13
648 0.12
649 0.11
650 0.06
651 0.06
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.06
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.09
668 0.14
669 0.15
670 0.16
671 0.19
672 0.18
673 0.18
674 0.2
675 0.18
676 0.16
677 0.15
678 0.15
679 0.13
680 0.14
681 0.14
682 0.12
683 0.1
684 0.08
685 0.07
686 0.06
687 0.05
688 0.06
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.06
693 0.07
694 0.07
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.05
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.03
705 0.03
706 0.04
707 0.04
708 0.04
709 0.06
710 0.06
711 0.08
712 0.09
713 0.09
714 0.09
715 0.09
716 0.1
717 0.08
718 0.09
719 0.08
720 0.06
721 0.06
722 0.05
723 0.04
724 0.04
725 0.04
726 0.02
727 0.03
728 0.03
729 0.03
730 0.04
731 0.04
732 0.05
733 0.06
734 0.07
735 0.08
736 0.11
737 0.12
738 0.13
739 0.14
740 0.13
741 0.15
742 0.16
743 0.15
744 0.13
745 0.12
746 0.11
747 0.1
748 0.11
749 0.1
750 0.1
751 0.09
752 0.09
753 0.09
754 0.09
755 0.1
756 0.09
757 0.08
758 0.1
759 0.12
760 0.14
761 0.14
762 0.14
763 0.14
764 0.15
765 0.13
766 0.11
767 0.1
768 0.08
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.14
774 0.2
775 0.21
776 0.3
777 0.31
778 0.35
779 0.36
780 0.38
781 0.37
782 0.33
783 0.34
784 0.29
785 0.29
786 0.31
787 0.34
788 0.33
789 0.35
790 0.35
791 0.32
792 0.3
793 0.27
794 0.24
795 0.2
796 0.19
797 0.16
798 0.14
799 0.15
800 0.13
801 0.11
802 0.08
803 0.08
804 0.07
805 0.08
806 0.1
807 0.09
808 0.14
809 0.14
810 0.14
811 0.14
812 0.14
813 0.12
814 0.1
815 0.1
816 0.05
817 0.07
818 0.08
819 0.09
820 0.1
821 0.14
822 0.14
823 0.15
824 0.15
825 0.19
826 0.19
827 0.19
828 0.19
829 0.23
830 0.24
831 0.23
832 0.25
833 0.21
834 0.21
835 0.2
836 0.19
837 0.15
838 0.15
839 0.16
840 0.14
841 0.17
842 0.16
843 0.16
844 0.15
845 0.13
846 0.13
847 0.13
848 0.12
849 0.09
850 0.09
851 0.09
852 0.09
853 0.08
854 0.07
855 0.07
856 0.07
857 0.06
858 0.05
859 0.05
860 0.05
861 0.05
862 0.05
863 0.04
864 0.05
865 0.04
866 0.06
867 0.07
868 0.06
869 0.06
870 0.07
871 0.08
872 0.07
873 0.08
874 0.07
875 0.1
876 0.13
877 0.13
878 0.17
879 0.2
880 0.22
881 0.25
882 0.28
883 0.25
884 0.26
885 0.26
886 0.23
887 0.18
888 0.17
889 0.13
890 0.1
891 0.09
892 0.06
893 0.05
894 0.04
895 0.04
896 0.04
897 0.05
898 0.05
899 0.05
900 0.08
901 0.09
902 0.09
903 0.1
904 0.11
905 0.12
906 0.14
907 0.14
908 0.12
909 0.13
910 0.14
911 0.14
912 0.19
913 0.23
914 0.25
915 0.29
916 0.3
917 0.29
918 0.31
919 0.32
920 0.25
921 0.21
922 0.2
923 0.18
924 0.19
925 0.19
926 0.17
927 0.16
928 0.19
929 0.19
930 0.17
931 0.16
932 0.15
933 0.17
934 0.18
935 0.18
936 0.16
937 0.14
938 0.14
939 0.15
940 0.14
941 0.13
942 0.15
943 0.16
944 0.17
945 0.18
946 0.22
947 0.22
948 0.26
949 0.29
950 0.28
951 0.3
952 0.32
953 0.34
954 0.38
955 0.41
956 0.44
957 0.41
958 0.39
959 0.37
960 0.4
961 0.43
962 0.4
963 0.36
964 0.29
965 0.27
966 0.27
967 0.26
968 0.2
969 0.13
970 0.07
971 0.09
972 0.13
973 0.13
974 0.15
975 0.16
976 0.16
977 0.2
978 0.22
979 0.2
980 0.2
981 0.22
982 0.22
983 0.27
984 0.27
985 0.24
986 0.24
987 0.24
988 0.26
989 0.24
990 0.22
991 0.2
992 0.19
993 0.2
994 0.21
995 0.27
996 0.22
997 0.26
998 0.28
999 0.35
1000 0.36
1001 0.36
1002 0.38
1003 0.38
1004 0.44
1005 0.48
1006 0.48
1007 0.43
1008 0.48
1009 0.48
1010 0.45
1011 0.42
1012 0.4
1013 0.33
1014 0.33
1015 0.33
1016 0.29
1017 0.28
1018 0.29
1019 0.26
1020 0.23
1021 0.23
1022 0.23
1023 0.24
1024 0.27
1025 0.32
1026 0.35
1027 0.44
1028 0.46
1029 0.45
1030 0.44
1031 0.42
1032 0.47
1033 0.45
1034 0.41
1035 0.37
1036 0.37
1037 0.36
1038 0.39
1039 0.35
1040 0.27
1041 0.27
1042 0.25
1043 0.23
1044 0.22
1045 0.22
1046 0.19
1047 0.21
1048 0.2
1049 0.18
1050 0.2
1051 0.17
1052 0.18
1053 0.19
1054 0.22
1055 0.21
1056 0.22
1057 0.2
1058 0.21
1059 0.21
1060 0.18
1061 0.16
1062 0.14
1063 0.11
1064 0.11
1065 0.14
1066 0.13
1067 0.15
1068 0.15
1069 0.16
1070 0.19
1071 0.21
1072 0.24
1073 0.25
1074 0.24
1075 0.23
1076 0.24
1077 0.26
1078 0.24
1079 0.27
1080 0.26
1081 0.24
1082 0.26
1083 0.25
1084 0.25
1085 0.26
1086 0.3
1087 0.3
1088 0.31
1089 0.29
1090 0.3
1091 0.29
1092 0.27
1093 0.23
1094 0.19
1095 0.13
1096 0.1
1097 0.09
1098 0.06
1099 0.06
1100 0.06
1101 0.07
1102 0.08
1103 0.1
1104 0.11
1105 0.13
1106 0.14
1107 0.15
1108 0.16
1109 0.18
1110 0.19
1111 0.26
1112 0.34
1113 0.37
1114 0.44
1115 0.47
1116 0.51
1117 0.54
1118 0.56
1119 0.52
1120 0.49
1121 0.48
1122 0.44
1123 0.48
1124 0.46
1125 0.41
1126 0.39
1127 0.36
1128 0.33
1129 0.32
1130 0.31
1131 0.32
1132 0.34
1133 0.36
1134 0.39
1135 0.38
1136 0.45
1137 0.5
1138 0.58
1139 0.58
1140 0.62
1141 0.69
1142 0.76
1143 0.81
1144 0.83
1145 0.84
1146 0.83
1147 0.83
1148 0.85
1149 0.8
1150 0.78
1151 0.72
1152 0.65
1153 0.58
1154 0.5
1155 0.45
1156 0.38
1157 0.39
1158 0.35
1159 0.35
1160 0.33
1161 0.33
1162 0.36
1163 0.36
1164 0.33
1165 0.27
1166 0.24
1167 0.22
1168 0.28
1169 0.28
1170 0.25
1171 0.23
1172 0.22
1173 0.21
1174 0.2
1175 0.22
1176 0.18
1177 0.19
1178 0.23
1179 0.22
1180 0.26
1181 0.32
1182 0.33
1183 0.36
1184 0.34
1185 0.32
1186 0.26
1187 0.32
1188 0.3
1189 0.24
1190 0.3
1191 0.25
1192 0.23
1193 0.25
1194 0.26
1195 0.19
1196 0.19
1197 0.18
1198 0.15
1199 0.19
1200 0.2
1201 0.17
1202 0.18
1203 0.19
1204 0.22
1205 0.29
1206 0.29
1207 0.27
1208 0.3
1209 0.31
1210 0.29
1211 0.3
1212 0.27
1213 0.25
1214 0.34
1215 0.33
1216 0.35
1217 0.36
1218 0.4
1219 0.38
1220 0.4
1221 0.35
1222 0.27
1223 0.25
1224 0.25
1225 0.25
1226 0.22
1227 0.26
1228 0.25
1229 0.24
1230 0.22
1231 0.21
1232 0.17
1233 0.2
1234 0.21
1235 0.19
1236 0.23
1237 0.25
1238 0.25
1239 0.25
1240 0.26
1241 0.24
1242 0.25
1243 0.24
1244 0.2
1245 0.19
1246 0.18
1247 0.18
1248 0.17
1249 0.16
1250 0.14
1251 0.16
1252 0.16
1253 0.15
1254 0.16
1255 0.17
1256 0.18
1257 0.17
1258 0.16
1259 0.14
1260 0.12
1261 0.14
1262 0.14
1263 0.14
1264 0.13
1265 0.13
1266 0.14
1267 0.15
1268 0.18
1269 0.24
1270 0.27
1271 0.27
1272 0.31
1273 0.32
1274 0.32
1275 0.4