Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SD01

Protein Details
Accession C9SD01    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPSPTKKRKLNKDASGPTSRGHydrophilic
592-614KTAENGAKKKTRRKPLLATYEPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
586-606KRKVTGKTAENGAKKKTRRKP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000977  DNA_ligase_ATP-dep  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0071897  P:DNA biosynthetic process  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
KEGG val:VDBG_03075  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd07900  Adenylation_DNA_ligase_I_Euk  
Amino Acid Sequences MPSPTKKRKLNKDASGPTSRGLEYFFSKQKQGDSSAASTPPQLKQDVGEAPKSEQELTDEELARKLQAEWDSEVQNTETLSAESQLVLRCSASPALDPSSTASAQVAKSAATPVKKHACKYRTEDSHAIKDQDSGHSCEFHQTYHSDGSRKSPPRCLASDKRHFAALHFLGIGSCGSAISKALKQVCGLNGPSLKNLYDKYGDAGDVAFEAKKKQSFTLRKPKPLTIKAVYQSLVKIANTQGQGSGEVKQRIVDRLLQDARGGEESRYIVRTLCQHLRIGAVKTTMLIALARAFSITSPPGADFAVRDRGSLAKLKKEELVEVWAKAEEIVKACFAKRPNYNDLVPILLEIGVCDELLLRCGLTLHIPLRPMLGSITRDLTEMLTKLQGGDFACEYKYDGQRAQIHCDVKGKVSIFSRHLELMTDKYPDLVALMPQIRGEGVDSFVMEGEVVAIDRQTGDMKNFQALTNRARKDVAIGSIQVDVCMYSFDLMYLNGEPLLDRPFRERRELLRSMFIEVPHQFTWVKSLDATSQDSDAVLDFFKSATDVKCEGIMVKILDNLTEIPYQGGEVDAPVDEMEEPHTPSKRKVTGKTAENGAKKKTRRKPLLATYEPDKRLDSWLKVKKDYNASFDTIDMVPVAGWHGQGRKAKWWSPILLAVRNEDSGSFEVVCKCISGFTDTFYKAIGFYDDVAEEAALYKYSFLKACLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.84
3 0.74
4 0.65
5 0.58
6 0.48
7 0.38
8 0.31
9 0.27
10 0.25
11 0.31
12 0.36
13 0.36
14 0.39
15 0.41
16 0.44
17 0.44
18 0.44
19 0.41
20 0.39
21 0.4
22 0.4
23 0.4
24 0.35
25 0.35
26 0.35
27 0.34
28 0.32
29 0.3
30 0.26
31 0.26
32 0.31
33 0.35
34 0.34
35 0.35
36 0.33
37 0.34
38 0.37
39 0.37
40 0.31
41 0.24
42 0.23
43 0.21
44 0.23
45 0.27
46 0.26
47 0.25
48 0.27
49 0.27
50 0.24
51 0.23
52 0.2
53 0.19
54 0.2
55 0.23
56 0.25
57 0.29
58 0.3
59 0.29
60 0.3
61 0.25
62 0.22
63 0.19
64 0.15
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.15
78 0.17
79 0.15
80 0.15
81 0.17
82 0.2
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.23
87 0.22
88 0.2
89 0.18
90 0.17
91 0.17
92 0.19
93 0.16
94 0.12
95 0.13
96 0.17
97 0.2
98 0.21
99 0.23
100 0.29
101 0.39
102 0.43
103 0.47
104 0.53
105 0.53
106 0.56
107 0.62
108 0.65
109 0.62
110 0.65
111 0.69
112 0.65
113 0.69
114 0.66
115 0.61
116 0.5
117 0.46
118 0.41
119 0.4
120 0.37
121 0.32
122 0.3
123 0.29
124 0.29
125 0.32
126 0.3
127 0.24
128 0.23
129 0.19
130 0.22
131 0.28
132 0.3
133 0.27
134 0.27
135 0.32
136 0.4
137 0.47
138 0.47
139 0.48
140 0.51
141 0.54
142 0.58
143 0.61
144 0.61
145 0.64
146 0.7
147 0.67
148 0.62
149 0.61
150 0.56
151 0.48
152 0.47
153 0.37
154 0.29
155 0.24
156 0.22
157 0.17
158 0.18
159 0.17
160 0.07
161 0.06
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.06
166 0.08
167 0.1
168 0.15
169 0.17
170 0.18
171 0.19
172 0.23
173 0.24
174 0.25
175 0.25
176 0.24
177 0.26
178 0.26
179 0.27
180 0.25
181 0.24
182 0.22
183 0.22
184 0.2
185 0.18
186 0.18
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.14
191 0.14
192 0.1
193 0.08
194 0.09
195 0.07
196 0.07
197 0.09
198 0.12
199 0.15
200 0.16
201 0.2
202 0.3
203 0.39
204 0.48
205 0.58
206 0.62
207 0.69
208 0.72
209 0.75
210 0.74
211 0.7
212 0.67
213 0.6
214 0.59
215 0.52
216 0.51
217 0.45
218 0.36
219 0.31
220 0.25
221 0.24
222 0.16
223 0.16
224 0.14
225 0.18
226 0.17
227 0.17
228 0.16
229 0.14
230 0.16
231 0.15
232 0.19
233 0.19
234 0.2
235 0.2
236 0.21
237 0.22
238 0.23
239 0.24
240 0.23
241 0.19
242 0.25
243 0.27
244 0.25
245 0.24
246 0.22
247 0.21
248 0.2
249 0.19
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.13
256 0.11
257 0.12
258 0.16
259 0.2
260 0.23
261 0.24
262 0.24
263 0.24
264 0.27
265 0.28
266 0.26
267 0.21
268 0.18
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.11
273 0.09
274 0.07
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.06
291 0.09
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.17
297 0.19
298 0.24
299 0.23
300 0.21
301 0.23
302 0.24
303 0.26
304 0.26
305 0.25
306 0.2
307 0.23
308 0.18
309 0.18
310 0.17
311 0.14
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.13
322 0.15
323 0.2
324 0.24
325 0.3
326 0.33
327 0.37
328 0.37
329 0.35
330 0.33
331 0.28
332 0.22
333 0.16
334 0.11
335 0.07
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.08
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.12
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.09
376 0.08
377 0.09
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.13
384 0.15
385 0.16
386 0.17
387 0.22
388 0.29
389 0.3
390 0.34
391 0.34
392 0.33
393 0.32
394 0.35
395 0.3
396 0.24
397 0.27
398 0.22
399 0.2
400 0.23
401 0.25
402 0.23
403 0.24
404 0.25
405 0.22
406 0.21
407 0.19
408 0.17
409 0.16
410 0.15
411 0.15
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.11
416 0.11
417 0.08
418 0.06
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.06
434 0.05
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.06
445 0.07
446 0.08
447 0.12
448 0.13
449 0.16
450 0.17
451 0.17
452 0.21
453 0.23
454 0.28
455 0.33
456 0.34
457 0.33
458 0.32
459 0.32
460 0.3
461 0.3
462 0.26
463 0.18
464 0.18
465 0.18
466 0.2
467 0.19
468 0.15
469 0.12
470 0.1
471 0.08
472 0.08
473 0.07
474 0.04
475 0.04
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.07
486 0.12
487 0.11
488 0.11
489 0.17
490 0.25
491 0.28
492 0.35
493 0.37
494 0.39
495 0.47
496 0.52
497 0.48
498 0.48
499 0.46
500 0.44
501 0.42
502 0.36
503 0.33
504 0.28
505 0.31
506 0.23
507 0.24
508 0.2
509 0.18
510 0.22
511 0.18
512 0.18
513 0.13
514 0.15
515 0.16
516 0.19
517 0.22
518 0.18
519 0.17
520 0.17
521 0.16
522 0.15
523 0.13
524 0.1
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.07
531 0.09
532 0.09
533 0.14
534 0.15
535 0.15
536 0.16
537 0.17
538 0.16
539 0.15
540 0.16
541 0.12
542 0.12
543 0.14
544 0.13
545 0.13
546 0.13
547 0.13
548 0.13
549 0.12
550 0.12
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.09
555 0.08
556 0.06
557 0.05
558 0.06
559 0.05
560 0.06
561 0.05
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.09
566 0.1
567 0.13
568 0.17
569 0.23
570 0.24
571 0.28
572 0.37
573 0.43
574 0.49
575 0.53
576 0.58
577 0.62
578 0.67
579 0.67
580 0.67
581 0.66
582 0.66
583 0.63
584 0.61
585 0.6
586 0.62
587 0.67
588 0.68
589 0.72
590 0.74
591 0.79
592 0.82
593 0.84
594 0.87
595 0.82
596 0.77
597 0.73
598 0.72
599 0.65
600 0.57
601 0.48
602 0.39
603 0.41
604 0.42
605 0.42
606 0.44
607 0.51
608 0.55
609 0.59
610 0.62
611 0.62
612 0.66
613 0.64
614 0.6
615 0.55
616 0.52
617 0.46
618 0.42
619 0.38
620 0.28
621 0.23
622 0.17
623 0.12
624 0.09
625 0.09
626 0.1
627 0.08
628 0.08
629 0.11
630 0.14
631 0.21
632 0.27
633 0.3
634 0.37
635 0.43
636 0.48
637 0.52
638 0.55
639 0.52
640 0.5
641 0.55
642 0.51
643 0.51
644 0.48
645 0.44
646 0.4
647 0.38
648 0.34
649 0.26
650 0.25
651 0.19
652 0.2
653 0.17
654 0.17
655 0.18
656 0.19
657 0.19
658 0.16
659 0.14
660 0.14
661 0.14
662 0.18
663 0.17
664 0.19
665 0.27
666 0.27
667 0.27
668 0.26
669 0.25
670 0.18
671 0.19
672 0.19
673 0.13
674 0.13
675 0.15
676 0.14
677 0.14
678 0.14
679 0.13
680 0.1
681 0.1
682 0.1
683 0.08
684 0.08
685 0.09
686 0.11
687 0.15
688 0.16