Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S7N8

Protein Details
Accession C9S7N8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-61TTSPIKTPQRHRREGSKLNPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-251KGHGRPRARYARGRGGGRRGGRTG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009818  Ataxin-2_C  
KEGG val:VDBG_01364  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07145  PAM2  
Amino Acid Sequences MGKYASLWATKEPCKQNETSCPRYADRSTSTEPKAVLECIVTTSPIKTPQRHRREGSKLNPDAPEFTPGALAAARSNPSPFINRVETPTPAQRSTTPLPENIVLPPSAAPVTRAEFRFPLVSPRRRFQSKSETKEYDSDECATPRRVSAPSPSRTMRATSREAEKLGCGRVHEDQGPVVVEKDKPKDQQVITINTIKPAASPPAKSSTNHAQSPKNDEGSNTPAAAQKGHGRPRARYARGRGGGRRGGRTGTTRGPVEGSSALPVPTKGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.55
3 0.57
4 0.61
5 0.64
6 0.62
7 0.6
8 0.6
9 0.57
10 0.6
11 0.55
12 0.51
13 0.48
14 0.47
15 0.48
16 0.51
17 0.51
18 0.48
19 0.45
20 0.41
21 0.37
22 0.31
23 0.26
24 0.18
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.14
29 0.13
30 0.14
31 0.16
32 0.24
33 0.29
34 0.34
35 0.44
36 0.54
37 0.63
38 0.7
39 0.73
40 0.74
41 0.78
42 0.81
43 0.79
44 0.79
45 0.73
46 0.69
47 0.67
48 0.58
49 0.52
50 0.43
51 0.37
52 0.27
53 0.23
54 0.18
55 0.15
56 0.15
57 0.11
58 0.1
59 0.07
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.16
67 0.17
68 0.2
69 0.24
70 0.24
71 0.28
72 0.29
73 0.29
74 0.3
75 0.35
76 0.33
77 0.29
78 0.3
79 0.27
80 0.31
81 0.32
82 0.36
83 0.3
84 0.27
85 0.29
86 0.28
87 0.27
88 0.22
89 0.2
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.11
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.16
103 0.18
104 0.18
105 0.16
106 0.23
107 0.28
108 0.36
109 0.38
110 0.41
111 0.46
112 0.48
113 0.5
114 0.46
115 0.49
116 0.51
117 0.54
118 0.58
119 0.55
120 0.53
121 0.54
122 0.51
123 0.42
124 0.33
125 0.28
126 0.22
127 0.2
128 0.2
129 0.19
130 0.16
131 0.14
132 0.15
133 0.14
134 0.15
135 0.23
136 0.29
137 0.3
138 0.34
139 0.35
140 0.34
141 0.34
142 0.36
143 0.32
144 0.29
145 0.3
146 0.29
147 0.32
148 0.33
149 0.32
150 0.3
151 0.27
152 0.24
153 0.22
154 0.2
155 0.15
156 0.16
157 0.17
158 0.2
159 0.19
160 0.18
161 0.15
162 0.15
163 0.16
164 0.13
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.16
169 0.21
170 0.25
171 0.27
172 0.31
173 0.37
174 0.35
175 0.41
176 0.42
177 0.42
178 0.41
179 0.45
180 0.42
181 0.35
182 0.36
183 0.27
184 0.22
185 0.19
186 0.22
187 0.19
188 0.2
189 0.23
190 0.29
191 0.31
192 0.31
193 0.36
194 0.39
195 0.43
196 0.46
197 0.48
198 0.47
199 0.49
200 0.57
201 0.55
202 0.48
203 0.42
204 0.38
205 0.38
206 0.37
207 0.36
208 0.27
209 0.24
210 0.24
211 0.24
212 0.23
213 0.21
214 0.24
215 0.31
216 0.38
217 0.44
218 0.45
219 0.48
220 0.58
221 0.66
222 0.64
223 0.65
224 0.65
225 0.69
226 0.72
227 0.76
228 0.72
229 0.7
230 0.71
231 0.67
232 0.64
233 0.56
234 0.52
235 0.49
236 0.47
237 0.45
238 0.44
239 0.44
240 0.4
241 0.38
242 0.37
243 0.33
244 0.32
245 0.27
246 0.22
247 0.19
248 0.19
249 0.18
250 0.17
251 0.18