Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHI4

Protein Details
Accession C9SHI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-136GQAIAPKSRQPPRQKAPQYPLAPHydrophilic
181-202VHLPCVKKWHKSQIEKPNPLEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-36AARRRAGRG
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG val:VDBG_04516  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
cd16492  RING-CH-C4HC3_NFX1-like  
Amino Acid Sequences MPAEASSAPASDGAQGSRGTPEAAAERAARRRAGRGRAVAALLSRVDSRRLLLLSRGPTALRHLQTIQAMPLHRFVAGTQRTFGGHLTSEMADGGGQVDGDAGLSAAAAEFVPGQAIAPKSRQPPRQKAPQYPLAPKSTAEDLPTRIHQDISNGQYECVICASEVLRSSKVWSCNLCWTVVHLPCVKKWHKSQIEKPNPLEQEQPDQPRTWRCPGCNSKLTEHPSSYHCWCGKDINPQNVGSLPPHSCGQTCTKPRATCPHLCFSDCHAGPCRPCDLMGPTQPCFCGKQESTKRCSDTDYDNGWSCKEICGDLLPCGEHFCEQECHSGLCGSCTVPMVSRCYCGKVEKKIPCDRRDEVRTSFNYGQIDASETDTVQPQEPFDGCFDCGASCGRKYDCGHHECQKTCHPQDEVEAHCPLSPNVVENCPCGKTPLERLLEQPRQSCQDPVPHCQEICGKTLACGHECDRTCHVGPCPPCYQRMDIACRCGRTSSRTLCHGDDMALPVCVRVCQAQLNCGRHQCGDRCCPGEKKAVERQAAKRKNKLQNPDEIEAEHICIRVCGRTLKCGAHQCQQICHRGPCGSCLEAVFDEISCTCGRTVLQPPQPCGTRPPECRFDCTRRPVCGHPPVSHNCHPDDIACPKCPFLVEKPCICGKQRLKNQPCWFEEVRCGLPCGEKLKCGLVANQESRVGTQTKITAMRHTDKACQAKEFITCACQHRKKEIKCLATRINPEPERETLKCDDECLRLQRNQKLAAALSIDPATHTDDHVPYSDTTLKLFRDSVRWCQTQEREFRVFASDAAEKRIRFKPMPPSQRAFLHALAEDFGLDTESQDPEPHRHVSVFKTPRFVSAPSKTLAQCVKIKNVQAAAAKAGASASEAPKQAPFNALLLSTPRFALTIEELDAALAGDFAAHNNLSFTTSFLPSDEAGLAGAVTLVHADQDQNVLRKEVTGETKDAGGWSSVVGRRPQAAAPAPVEKKPASGFVSFSRLPRKKIVQETEEDWEAAAEKMDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.16
4 0.17
5 0.17
6 0.15
7 0.14
8 0.16
9 0.16
10 0.17
11 0.19
12 0.2
13 0.26
14 0.32
15 0.37
16 0.39
17 0.39
18 0.47
19 0.53
20 0.58
21 0.6
22 0.6
23 0.6
24 0.58
25 0.57
26 0.49
27 0.41
28 0.35
29 0.27
30 0.22
31 0.21
32 0.19
33 0.2
34 0.2
35 0.2
36 0.22
37 0.23
38 0.23
39 0.25
40 0.31
41 0.32
42 0.34
43 0.34
44 0.3
45 0.29
46 0.34
47 0.38
48 0.33
49 0.32
50 0.31
51 0.34
52 0.37
53 0.38
54 0.34
55 0.3
56 0.3
57 0.27
58 0.29
59 0.25
60 0.22
61 0.2
62 0.18
63 0.24
64 0.27
65 0.28
66 0.26
67 0.27
68 0.27
69 0.28
70 0.28
71 0.21
72 0.16
73 0.15
74 0.17
75 0.16
76 0.15
77 0.14
78 0.13
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.09
103 0.11
104 0.13
105 0.17
106 0.23
107 0.31
108 0.4
109 0.49
110 0.56
111 0.64
112 0.7
113 0.78
114 0.81
115 0.82
116 0.82
117 0.83
118 0.8
119 0.77
120 0.75
121 0.69
122 0.62
123 0.52
124 0.48
125 0.43
126 0.37
127 0.32
128 0.29
129 0.27
130 0.3
131 0.33
132 0.33
133 0.29
134 0.29
135 0.26
136 0.28
137 0.32
138 0.32
139 0.35
140 0.31
141 0.3
142 0.32
143 0.31
144 0.26
145 0.2
146 0.16
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.14
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.22
156 0.26
157 0.29
158 0.32
159 0.31
160 0.32
161 0.4
162 0.41
163 0.38
164 0.32
165 0.33
166 0.36
167 0.36
168 0.37
169 0.34
170 0.34
171 0.36
172 0.46
173 0.44
174 0.44
175 0.48
176 0.55
177 0.59
178 0.67
179 0.74
180 0.76
181 0.83
182 0.83
183 0.8
184 0.77
185 0.7
186 0.62
187 0.58
188 0.49
189 0.46
190 0.46
191 0.49
192 0.43
193 0.42
194 0.45
195 0.47
196 0.51
197 0.52
198 0.51
199 0.46
200 0.55
201 0.61
202 0.66
203 0.64
204 0.62
205 0.58
206 0.6
207 0.63
208 0.57
209 0.5
210 0.44
211 0.4
212 0.41
213 0.39
214 0.39
215 0.36
216 0.33
217 0.33
218 0.36
219 0.37
220 0.43
221 0.48
222 0.48
223 0.49
224 0.47
225 0.47
226 0.42
227 0.39
228 0.29
229 0.26
230 0.19
231 0.18
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.19
236 0.26
237 0.31
238 0.35
239 0.4
240 0.47
241 0.47
242 0.52
243 0.59
244 0.58
245 0.58
246 0.58
247 0.59
248 0.54
249 0.53
250 0.5
251 0.46
252 0.5
253 0.41
254 0.39
255 0.35
256 0.36
257 0.36
258 0.37
259 0.34
260 0.24
261 0.24
262 0.24
263 0.24
264 0.27
265 0.33
266 0.34
267 0.33
268 0.34
269 0.34
270 0.32
271 0.3
272 0.25
273 0.26
274 0.23
275 0.33
276 0.42
277 0.49
278 0.52
279 0.56
280 0.58
281 0.5
282 0.52
283 0.44
284 0.4
285 0.4
286 0.38
287 0.35
288 0.36
289 0.35
290 0.33
291 0.3
292 0.25
293 0.2
294 0.17
295 0.13
296 0.11
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.14
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.14
309 0.15
310 0.19
311 0.19
312 0.19
313 0.18
314 0.2
315 0.17
316 0.15
317 0.15
318 0.11
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.17
325 0.17
326 0.2
327 0.2
328 0.22
329 0.24
330 0.28
331 0.32
332 0.36
333 0.45
334 0.48
335 0.55
336 0.62
337 0.68
338 0.66
339 0.67
340 0.62
341 0.62
342 0.61
343 0.58
344 0.53
345 0.52
346 0.49
347 0.49
348 0.47
349 0.41
350 0.35
351 0.31
352 0.27
353 0.2
354 0.2
355 0.13
356 0.14
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.09
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.11
377 0.1
378 0.13
379 0.13
380 0.18
381 0.2
382 0.27
383 0.33
384 0.36
385 0.4
386 0.45
387 0.52
388 0.48
389 0.5
390 0.5
391 0.51
392 0.48
393 0.48
394 0.41
395 0.35
396 0.38
397 0.39
398 0.34
399 0.29
400 0.28
401 0.23
402 0.23
403 0.22
404 0.18
405 0.15
406 0.12
407 0.11
408 0.12
409 0.15
410 0.15
411 0.16
412 0.18
413 0.17
414 0.17
415 0.16
416 0.16
417 0.16
418 0.2
419 0.27
420 0.28
421 0.27
422 0.31
423 0.39
424 0.43
425 0.43
426 0.4
427 0.34
428 0.35
429 0.35
430 0.33
431 0.26
432 0.28
433 0.29
434 0.32
435 0.36
436 0.34
437 0.32
438 0.32
439 0.35
440 0.29
441 0.28
442 0.25
443 0.18
444 0.18
445 0.21
446 0.21
447 0.17
448 0.17
449 0.16
450 0.21
451 0.22
452 0.24
453 0.23
454 0.25
455 0.25
456 0.26
457 0.26
458 0.24
459 0.24
460 0.26
461 0.29
462 0.26
463 0.28
464 0.28
465 0.29
466 0.28
467 0.32
468 0.35
469 0.31
470 0.37
471 0.36
472 0.35
473 0.33
474 0.3
475 0.27
476 0.24
477 0.29
478 0.29
479 0.3
480 0.33
481 0.36
482 0.34
483 0.34
484 0.29
485 0.24
486 0.18
487 0.17
488 0.13
489 0.11
490 0.1
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.05
496 0.06
497 0.09
498 0.1
499 0.16
500 0.22
501 0.26
502 0.28
503 0.29
504 0.29
505 0.26
506 0.3
507 0.28
508 0.27
509 0.29
510 0.3
511 0.31
512 0.33
513 0.35
514 0.34
515 0.37
516 0.33
517 0.35
518 0.39
519 0.43
520 0.44
521 0.47
522 0.53
523 0.56
524 0.64
525 0.62
526 0.63
527 0.65
528 0.7
529 0.7
530 0.71
531 0.64
532 0.64
533 0.65
534 0.59
535 0.5
536 0.41
537 0.37
538 0.27
539 0.25
540 0.17
541 0.11
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.09
547 0.14
548 0.14
549 0.18
550 0.21
551 0.23
552 0.27
553 0.34
554 0.36
555 0.37
556 0.41
557 0.37
558 0.4
559 0.43
560 0.45
561 0.41
562 0.39
563 0.34
564 0.33
565 0.32
566 0.29
567 0.27
568 0.21
569 0.18
570 0.17
571 0.16
572 0.13
573 0.14
574 0.11
575 0.08
576 0.07
577 0.07
578 0.08
579 0.06
580 0.07
581 0.06
582 0.07
583 0.07
584 0.11
585 0.17
586 0.24
587 0.3
588 0.32
589 0.35
590 0.38
591 0.39
592 0.36
593 0.34
594 0.33
595 0.36
596 0.4
597 0.43
598 0.49
599 0.49
600 0.54
601 0.56
602 0.57
603 0.57
604 0.59
605 0.6
606 0.54
607 0.57
608 0.56
609 0.57
610 0.58
611 0.54
612 0.47
613 0.47
614 0.48
615 0.52
616 0.53
617 0.48
618 0.4
619 0.37
620 0.34
621 0.29
622 0.28
623 0.27
624 0.26
625 0.26
626 0.25
627 0.24
628 0.24
629 0.24
630 0.23
631 0.23
632 0.29
633 0.31
634 0.32
635 0.36
636 0.39
637 0.41
638 0.4
639 0.42
640 0.4
641 0.46
642 0.53
643 0.61
644 0.64
645 0.71
646 0.77
647 0.76
648 0.69
649 0.66
650 0.59
651 0.5
652 0.48
653 0.42
654 0.38
655 0.29
656 0.29
657 0.22
658 0.22
659 0.23
660 0.23
661 0.2
662 0.18
663 0.19
664 0.2
665 0.22
666 0.21
667 0.21
668 0.24
669 0.3
670 0.3
671 0.31
672 0.3
673 0.27
674 0.27
675 0.27
676 0.21
677 0.15
678 0.15
679 0.15
680 0.17
681 0.21
682 0.22
683 0.23
684 0.28
685 0.32
686 0.36
687 0.36
688 0.38
689 0.4
690 0.47
691 0.44
692 0.4
693 0.37
694 0.34
695 0.34
696 0.3
697 0.24
698 0.2
699 0.22
700 0.26
701 0.34
702 0.39
703 0.39
704 0.48
705 0.57
706 0.58
707 0.65
708 0.68
709 0.67
710 0.65
711 0.7
712 0.68
713 0.65
714 0.66
715 0.6
716 0.62
717 0.54
718 0.52
719 0.48
720 0.44
721 0.43
722 0.39
723 0.39
724 0.33
725 0.35
726 0.32
727 0.32
728 0.32
729 0.29
730 0.33
731 0.34
732 0.36
733 0.37
734 0.44
735 0.47
736 0.49
737 0.49
738 0.46
739 0.42
740 0.37
741 0.33
742 0.29
743 0.23
744 0.19
745 0.16
746 0.14
747 0.12
748 0.12
749 0.14
750 0.11
751 0.12
752 0.14
753 0.14
754 0.16
755 0.17
756 0.18
757 0.15
758 0.19
759 0.22
760 0.19
761 0.2
762 0.22
763 0.21
764 0.21
765 0.23
766 0.21
767 0.25
768 0.28
769 0.36
770 0.41
771 0.42
772 0.42
773 0.48
774 0.53
775 0.53
776 0.57
777 0.54
778 0.5
779 0.48
780 0.47
781 0.43
782 0.37
783 0.29
784 0.26
785 0.24
786 0.21
787 0.27
788 0.3
789 0.26
790 0.31
791 0.36
792 0.38
793 0.35
794 0.41
795 0.46
796 0.52
797 0.62
798 0.63
799 0.63
800 0.61
801 0.63
802 0.61
803 0.54
804 0.45
805 0.38
806 0.32
807 0.27
808 0.23
809 0.2
810 0.15
811 0.11
812 0.09
813 0.07
814 0.06
815 0.07
816 0.08
817 0.09
818 0.1
819 0.12
820 0.14
821 0.17
822 0.22
823 0.23
824 0.23
825 0.24
826 0.27
827 0.3
828 0.39
829 0.43
830 0.42
831 0.46
832 0.45
833 0.48
834 0.48
835 0.46
836 0.44
837 0.42
838 0.43
839 0.37
840 0.42
841 0.37
842 0.4
843 0.4
844 0.36
845 0.37
846 0.37
847 0.44
848 0.44
849 0.46
850 0.45
851 0.43
852 0.43
853 0.4
854 0.37
855 0.31
856 0.27
857 0.25
858 0.2
859 0.18
860 0.12
861 0.11
862 0.12
863 0.13
864 0.16
865 0.17
866 0.18
867 0.22
868 0.24
869 0.23
870 0.23
871 0.22
872 0.18
873 0.19
874 0.18
875 0.16
876 0.18
877 0.19
878 0.17
879 0.15
880 0.14
881 0.13
882 0.13
883 0.15
884 0.15
885 0.15
886 0.16
887 0.16
888 0.16
889 0.15
890 0.15
891 0.12
892 0.08
893 0.06
894 0.04
895 0.04
896 0.04
897 0.05
898 0.07
899 0.07
900 0.07
901 0.08
902 0.09
903 0.1
904 0.11
905 0.12
906 0.13
907 0.15
908 0.16
909 0.16
910 0.17
911 0.16
912 0.18
913 0.16
914 0.12
915 0.1
916 0.1
917 0.09
918 0.06
919 0.06
920 0.04
921 0.04
922 0.04
923 0.04
924 0.04
925 0.05
926 0.06
927 0.06
928 0.12
929 0.16
930 0.21
931 0.22
932 0.24
933 0.23
934 0.24
935 0.26
936 0.27
937 0.3
938 0.29
939 0.3
940 0.3
941 0.3
942 0.3
943 0.27
944 0.22
945 0.15
946 0.12
947 0.11
948 0.16
949 0.18
950 0.22
951 0.25
952 0.26
953 0.28
954 0.3
955 0.31
956 0.32
957 0.34
958 0.34
959 0.36
960 0.43
961 0.43
962 0.43
963 0.46
964 0.39
965 0.37
966 0.35
967 0.37
968 0.31
969 0.3
970 0.31
971 0.31
972 0.38
973 0.36
974 0.39
975 0.44
976 0.45
977 0.48
978 0.53
979 0.58
980 0.6
981 0.69
982 0.73
983 0.68
984 0.69
985 0.69
986 0.67
987 0.6
988 0.5
989 0.4
990 0.31
991 0.26
992 0.2