Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SCM1

Protein Details
Accession C9SCM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-73NAALTCKRDHVPKKRGPKRGHGRVINELRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-66PKKRGPKRGHGR
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007219  Transcription_factor_dom_fun  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG val:VDBG_02945  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04082  Fungal_trans  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
Amino Acid Sequences MVSLTNLPFPPHLAHPSLSHTTLDHASRPGIRCDGKYPCEQCLNAALTCKRDHVPKKRGPKRGHGRVINELRAKDTFPGQLSLEGGGVGGQGSQDNPTEYVRRRLSAACPPLSFDPSMSDSSANPSAAPSAANSPPQFWATLTSNPGHNVPEPRSAFSSDDYRPNSRSYLYMVPQCVELYYEHIYPIMPLLYMPAIRQTIARPMTPSEKNLIYALCALTSMHMSGKSIEAPGPPSWEVAGRFFLDECISVRQSYDFLEDLSLSAVISSFYLSTSFFEINQSRKSWHYLREALNNAQDLGLQNDSTYYGLSPEDTLCRQRVFWILFVTERSFAILRNKPITFKQTPSLPSTRHSYESPDIHAGFLQLVSSYTPLDESFVTAWNEGSDPRVSAATFVALQNLLALPPIFLRPRSPTSLFAGSTDPSTPEPTDIQKADLLVTQQWLRLIVWQSSMRQQLLSWTNPADAPDPNAPPNSMCFSFPLSVARDTAAILASLPPKAVEVHGMGIMEKIFEIGTWCVNVLGACESVGFAPGGMDLTAGDLGVLNTGRRSSSKDPIEFFVRTLSASPNRKGAVCREAAQGRGENQAACAMGLGIMPVDMAAAAAAAAAATAGGLRGDSVDLTSPLTMTTSHSYSDMASAMGMTGLSDWSEWSPETGGGDEAAAAFAAEDGTGLAHVVSRSSAGDGNENGTRKEAKNIIHKYILLGLLVNNSFRCHARSNLAFHKGFGVEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.37
4 0.39
5 0.36
6 0.32
7 0.28
8 0.28
9 0.32
10 0.31
11 0.27
12 0.25
13 0.27
14 0.33
15 0.35
16 0.35
17 0.38
18 0.39
19 0.39
20 0.44
21 0.49
22 0.47
23 0.54
24 0.53
25 0.51
26 0.54
27 0.51
28 0.47
29 0.45
30 0.44
31 0.36
32 0.4
33 0.37
34 0.34
35 0.36
36 0.37
37 0.33
38 0.39
39 0.48
40 0.52
41 0.59
42 0.65
43 0.74
44 0.8
45 0.87
46 0.84
47 0.85
48 0.85
49 0.86
50 0.87
51 0.83
52 0.8
53 0.81
54 0.82
55 0.79
56 0.73
57 0.63
58 0.56
59 0.49
60 0.45
61 0.36
62 0.32
63 0.28
64 0.25
65 0.27
66 0.25
67 0.25
68 0.24
69 0.23
70 0.19
71 0.14
72 0.12
73 0.09
74 0.07
75 0.06
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.07
81 0.08
82 0.1
83 0.11
84 0.14
85 0.21
86 0.24
87 0.33
88 0.35
89 0.35
90 0.36
91 0.39
92 0.41
93 0.44
94 0.49
95 0.44
96 0.42
97 0.44
98 0.44
99 0.43
100 0.38
101 0.28
102 0.25
103 0.23
104 0.24
105 0.22
106 0.2
107 0.17
108 0.22
109 0.25
110 0.21
111 0.18
112 0.16
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.11
117 0.13
118 0.16
119 0.21
120 0.21
121 0.22
122 0.24
123 0.24
124 0.24
125 0.19
126 0.22
127 0.2
128 0.24
129 0.25
130 0.25
131 0.26
132 0.26
133 0.28
134 0.24
135 0.24
136 0.26
137 0.26
138 0.34
139 0.34
140 0.35
141 0.36
142 0.36
143 0.34
144 0.31
145 0.34
146 0.28
147 0.34
148 0.36
149 0.37
150 0.36
151 0.37
152 0.36
153 0.31
154 0.29
155 0.26
156 0.28
157 0.29
158 0.32
159 0.31
160 0.3
161 0.29
162 0.28
163 0.23
164 0.18
165 0.14
166 0.13
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.12
173 0.13
174 0.09
175 0.06
176 0.05
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.2
187 0.22
188 0.23
189 0.21
190 0.23
191 0.3
192 0.32
193 0.32
194 0.28
195 0.27
196 0.27
197 0.27
198 0.24
199 0.17
200 0.17
201 0.15
202 0.11
203 0.1
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.14
218 0.14
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.17
224 0.17
225 0.15
226 0.17
227 0.14
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.13
264 0.16
265 0.19
266 0.22
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.28
271 0.28
272 0.32
273 0.35
274 0.39
275 0.41
276 0.47
277 0.49
278 0.45
279 0.43
280 0.38
281 0.31
282 0.24
283 0.21
284 0.14
285 0.12
286 0.1
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.09
300 0.1
301 0.12
302 0.13
303 0.14
304 0.14
305 0.15
306 0.19
307 0.18
308 0.19
309 0.18
310 0.17
311 0.18
312 0.19
313 0.18
314 0.14
315 0.12
316 0.12
317 0.1
318 0.11
319 0.18
320 0.21
321 0.22
322 0.26
323 0.27
324 0.27
325 0.29
326 0.35
327 0.3
328 0.29
329 0.29
330 0.29
331 0.31
332 0.35
333 0.36
334 0.3
335 0.29
336 0.32
337 0.31
338 0.29
339 0.27
340 0.27
341 0.27
342 0.28
343 0.28
344 0.25
345 0.23
346 0.21
347 0.2
348 0.15
349 0.11
350 0.09
351 0.07
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.09
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.1
396 0.15
397 0.18
398 0.24
399 0.25
400 0.25
401 0.29
402 0.32
403 0.3
404 0.27
405 0.25
406 0.2
407 0.19
408 0.17
409 0.14
410 0.11
411 0.13
412 0.12
413 0.12
414 0.13
415 0.14
416 0.18
417 0.17
418 0.18
419 0.16
420 0.16
421 0.15
422 0.15
423 0.13
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.1
429 0.11
430 0.1
431 0.13
432 0.15
433 0.14
434 0.17
435 0.18
436 0.19
437 0.23
438 0.26
439 0.22
440 0.2
441 0.19
442 0.22
443 0.25
444 0.25
445 0.22
446 0.2
447 0.2
448 0.2
449 0.21
450 0.16
451 0.12
452 0.15
453 0.17
454 0.18
455 0.19
456 0.19
457 0.19
458 0.17
459 0.19
460 0.2
461 0.17
462 0.15
463 0.15
464 0.18
465 0.18
466 0.18
467 0.19
468 0.17
469 0.17
470 0.17
471 0.16
472 0.13
473 0.13
474 0.13
475 0.09
476 0.07
477 0.06
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.08
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.07
495 0.06
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.08
503 0.08
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.06
514 0.07
515 0.06
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.04
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.06
533 0.07
534 0.08
535 0.09
536 0.16
537 0.2
538 0.29
539 0.37
540 0.4
541 0.42
542 0.45
543 0.49
544 0.43
545 0.38
546 0.32
547 0.24
548 0.21
549 0.2
550 0.22
551 0.25
552 0.3
553 0.31
554 0.33
555 0.34
556 0.36
557 0.37
558 0.37
559 0.36
560 0.33
561 0.34
562 0.36
563 0.37
564 0.37
565 0.38
566 0.35
567 0.29
568 0.31
569 0.29
570 0.22
571 0.21
572 0.2
573 0.17
574 0.14
575 0.12
576 0.08
577 0.07
578 0.07
579 0.06
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.03
584 0.03
585 0.02
586 0.02
587 0.02
588 0.02
589 0.02
590 0.02
591 0.02
592 0.02
593 0.02
594 0.02
595 0.02
596 0.02
597 0.02
598 0.02
599 0.02
600 0.02
601 0.03
602 0.03
603 0.04
604 0.04
605 0.05
606 0.07
607 0.08
608 0.09
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.09
613 0.09
614 0.11
615 0.15
616 0.15
617 0.16
618 0.16
619 0.17
620 0.17
621 0.18
622 0.14
623 0.1
624 0.09
625 0.08
626 0.07
627 0.07
628 0.06
629 0.04
630 0.04
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.06
635 0.07
636 0.09
637 0.09
638 0.1
639 0.11
640 0.12
641 0.13
642 0.13
643 0.12
644 0.11
645 0.1
646 0.09
647 0.08
648 0.07
649 0.06
650 0.05
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.03
656 0.03
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.07
665 0.08
666 0.09
667 0.11
668 0.14
669 0.13
670 0.18
671 0.18
672 0.22
673 0.26
674 0.27
675 0.25
676 0.26
677 0.3
678 0.27
679 0.34
680 0.35
681 0.37
682 0.46
683 0.52
684 0.55
685 0.55
686 0.54
687 0.48
688 0.48
689 0.42
690 0.32
691 0.26
692 0.2
693 0.21
694 0.22
695 0.22
696 0.17
697 0.18
698 0.2
699 0.21
700 0.24
701 0.23
702 0.27
703 0.34
704 0.4
705 0.46
706 0.53
707 0.6
708 0.56
709 0.52
710 0.52