Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SCX3

Protein Details
Accession C9SCX3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
576-597GVGNKGKPPTPRMPKRVKGNPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
580-595KGKPPTPRMPKRVKGN
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
KEGG val:VDBG_03047  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MLGSTDRSPAAAASGAKPADAARWTPGQPVHMSAQQMQSLQQAQIAALQAQQQGHQQAQQQQQQQQQQQQAQQQQAQQQQAQQQAQQAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQGQPPQQQQQPGGPQPQQQTPQQQAAQPAGPQSAGHPTPSQTPGPQPNQQPQPPQAQNQAQGPQPGQQPQQQLNPAQQQAQHAAAQAVMANNMALAQQQAQAQQARREGMKGHCLLKLMQFSEHLSGFSRKDDLSYWNMFVNQFFSTKGVFRHSVHITDHEDPSDKHGVRNMQWFMKKATTDRPLPGDGHWIENTKSSLVYWFDNGSHLVATGTVRAHFDHEQKIELFEFVTSGHEEYISRKSVIESAKPAHNWVKEWHKVNSQDSKTSPEMSKKGKARPLKSPQNPPPEALVDLPESSVKRGMGVTEEVFQFLEIVEVFGQMNPLFGFSHSHPGMRPYLALEQYVNQINSQPQPNMNGQPMQQGPPRTPGFGQFPVPQMPPGGVGASPAQPHMQLPGSPHIMGSPAQIQMQAPGMQLQQSQQGTSSSGPSANTSPASNKRRRPSGVKTEDDGSSAPTPQSGPGGQVNGVGNKGKPPTPRMPKRVKGNPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.21
4 0.21
5 0.19
6 0.2
7 0.21
8 0.2
9 0.19
10 0.24
11 0.25
12 0.3
13 0.32
14 0.32
15 0.31
16 0.33
17 0.34
18 0.32
19 0.34
20 0.33
21 0.35
22 0.34
23 0.33
24 0.3
25 0.3
26 0.29
27 0.26
28 0.24
29 0.19
30 0.16
31 0.19
32 0.19
33 0.15
34 0.14
35 0.17
36 0.18
37 0.18
38 0.2
39 0.21
40 0.23
41 0.24
42 0.26
43 0.29
44 0.34
45 0.42
46 0.48
47 0.51
48 0.54
49 0.61
50 0.66
51 0.67
52 0.66
53 0.66
54 0.65
55 0.64
56 0.65
57 0.64
58 0.62
59 0.59
60 0.56
61 0.56
62 0.56
63 0.55
64 0.49
65 0.47
66 0.47
67 0.5
68 0.48
69 0.43
70 0.41
71 0.41
72 0.43
73 0.44
74 0.43
75 0.42
76 0.45
77 0.5
78 0.51
79 0.53
80 0.59
81 0.6
82 0.63
83 0.64
84 0.67
85 0.69
86 0.71
87 0.72
88 0.71
89 0.73
90 0.71
91 0.71
92 0.69
93 0.66
94 0.66
95 0.65
96 0.64
97 0.63
98 0.62
99 0.61
100 0.59
101 0.57
102 0.52
103 0.51
104 0.52
105 0.5
106 0.5
107 0.46
108 0.48
109 0.48
110 0.52
111 0.49
112 0.46
113 0.49
114 0.47
115 0.5
116 0.47
117 0.45
118 0.42
119 0.42
120 0.38
121 0.31
122 0.28
123 0.22
124 0.19
125 0.17
126 0.15
127 0.19
128 0.18
129 0.19
130 0.18
131 0.19
132 0.24
133 0.27
134 0.28
135 0.23
136 0.29
137 0.36
138 0.4
139 0.45
140 0.45
141 0.5
142 0.57
143 0.59
144 0.58
145 0.53
146 0.58
147 0.55
148 0.54
149 0.54
150 0.49
151 0.49
152 0.47
153 0.47
154 0.39
155 0.37
156 0.34
157 0.31
158 0.3
159 0.31
160 0.29
161 0.31
162 0.34
163 0.35
164 0.4
165 0.4
166 0.38
167 0.39
168 0.42
169 0.39
170 0.36
171 0.34
172 0.31
173 0.29
174 0.3
175 0.24
176 0.19
177 0.17
178 0.15
179 0.13
180 0.12
181 0.09
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.07
192 0.08
193 0.1
194 0.12
195 0.16
196 0.19
197 0.22
198 0.24
199 0.24
200 0.23
201 0.23
202 0.24
203 0.24
204 0.29
205 0.28
206 0.28
207 0.27
208 0.28
209 0.28
210 0.28
211 0.28
212 0.22
213 0.2
214 0.18
215 0.18
216 0.2
217 0.19
218 0.15
219 0.14
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.16
224 0.13
225 0.14
226 0.15
227 0.17
228 0.19
229 0.2
230 0.2
231 0.19
232 0.2
233 0.19
234 0.18
235 0.16
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.12
242 0.13
243 0.15
244 0.17
245 0.18
246 0.23
247 0.24
248 0.26
249 0.25
250 0.27
251 0.28
252 0.27
253 0.27
254 0.21
255 0.21
256 0.19
257 0.22
258 0.26
259 0.22
260 0.2
261 0.23
262 0.25
263 0.26
264 0.33
265 0.3
266 0.28
267 0.3
268 0.31
269 0.3
270 0.3
271 0.29
272 0.24
273 0.29
274 0.29
275 0.3
276 0.3
277 0.3
278 0.29
279 0.29
280 0.27
281 0.26
282 0.22
283 0.22
284 0.21
285 0.19
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.12
290 0.12
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.11
312 0.13
313 0.16
314 0.2
315 0.2
316 0.21
317 0.21
318 0.22
319 0.19
320 0.16
321 0.13
322 0.08
323 0.08
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.09
332 0.13
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.19
338 0.21
339 0.21
340 0.21
341 0.22
342 0.26
343 0.26
344 0.28
345 0.29
346 0.28
347 0.27
348 0.28
349 0.34
350 0.36
351 0.39
352 0.4
353 0.4
354 0.44
355 0.48
356 0.52
357 0.46
358 0.45
359 0.42
360 0.44
361 0.4
362 0.39
363 0.35
364 0.32
365 0.36
366 0.36
367 0.43
368 0.43
369 0.48
370 0.52
371 0.58
372 0.56
373 0.61
374 0.66
375 0.69
376 0.71
377 0.75
378 0.75
379 0.77
380 0.74
381 0.65
382 0.58
383 0.49
384 0.43
385 0.32
386 0.26
387 0.17
388 0.16
389 0.15
390 0.14
391 0.13
392 0.12
393 0.14
394 0.12
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.14
400 0.13
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.14
405 0.13
406 0.11
407 0.08
408 0.08
409 0.05
410 0.06
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.08
420 0.07
421 0.08
422 0.11
423 0.11
424 0.2
425 0.2
426 0.21
427 0.21
428 0.24
429 0.26
430 0.23
431 0.22
432 0.16
433 0.21
434 0.21
435 0.22
436 0.19
437 0.18
438 0.21
439 0.25
440 0.22
441 0.17
442 0.18
443 0.2
444 0.24
445 0.26
446 0.24
447 0.22
448 0.26
449 0.3
450 0.31
451 0.31
452 0.29
453 0.26
454 0.31
455 0.31
456 0.32
457 0.31
458 0.3
459 0.29
460 0.35
461 0.35
462 0.31
463 0.3
464 0.31
465 0.33
466 0.34
467 0.36
468 0.31
469 0.33
470 0.35
471 0.35
472 0.3
473 0.24
474 0.21
475 0.18
476 0.16
477 0.14
478 0.1
479 0.1
480 0.12
481 0.14
482 0.14
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.13
487 0.15
488 0.16
489 0.15
490 0.18
491 0.23
492 0.26
493 0.25
494 0.25
495 0.22
496 0.21
497 0.2
498 0.19
499 0.16
500 0.14
501 0.15
502 0.16
503 0.16
504 0.16
505 0.19
506 0.17
507 0.15
508 0.15
509 0.16
510 0.16
511 0.17
512 0.17
513 0.21
514 0.2
515 0.2
516 0.19
517 0.2
518 0.2
519 0.2
520 0.22
521 0.16
522 0.17
523 0.17
524 0.19
525 0.2
526 0.21
527 0.21
528 0.2
529 0.26
530 0.35
531 0.43
532 0.49
533 0.56
534 0.62
535 0.7
536 0.75
537 0.76
538 0.77
539 0.79
540 0.8
541 0.76
542 0.71
543 0.65
544 0.59
545 0.52
546 0.42
547 0.36
548 0.28
549 0.24
550 0.21
551 0.18
552 0.18
553 0.17
554 0.21
555 0.17
556 0.18
557 0.2
558 0.23
559 0.22
560 0.25
561 0.27
562 0.25
563 0.27
564 0.26
565 0.23
566 0.26
567 0.29
568 0.3
569 0.33
570 0.39
571 0.47
572 0.56
573 0.66
574 0.71
575 0.77
576 0.82
577 0.87