Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SPT1

Protein Details
Accession C9SPT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-49VPETLLKKRKSQEKARAERNAANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-59KKRKSQEKARAERNAANDQKKTNNKEK
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036919  L30_ferredoxin-like_sf  
IPR016082  Ribosomal_L30_ferredoxin-like  
IPR012988  Ribosomal_L30_N  
IPR039699  Ribosomal_L7/L30  
IPR005998  Ribosomal_L7_euk  
IPR035808  Ribosomal_L7_euk_arc  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG val:VDBG_06906  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00327  Ribosomal_L30  
PF08079  Ribosomal_L30_N  
CDD cd01657  Ribosomal_L7_archeal_euk  
Amino Acid Sequences MSRTAAILAPALCSILRSVPTKEQILVPETLLKKRKSQEKARAERNAANDQKKTNNKEKREVIFKRAEKYVQEYREQEREKVRLARVARESDSAYVPAEANLIFLIRIKGINKIAPKPRKILQLLRLLQINNGVFIRVTKATTEMIKVIEPWVAYGYPNLKSIKELIYKRGYGKVNKQRIALTDNSIIEENLGKYGIICMEDLIHEIYTVGPNFKQAANFLWPFKLSNPTGGFRPRKFKHFIEGGDLGNREEKINALIRQMN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.15
4 0.17
5 0.22
6 0.28
7 0.34
8 0.35
9 0.36
10 0.35
11 0.35
12 0.35
13 0.32
14 0.26
15 0.29
16 0.29
17 0.35
18 0.39
19 0.38
20 0.42
21 0.49
22 0.57
23 0.59
24 0.67
25 0.7
26 0.74
27 0.82
28 0.84
29 0.85
30 0.81
31 0.76
32 0.72
33 0.71
34 0.68
35 0.64
36 0.58
37 0.54
38 0.58
39 0.61
40 0.63
41 0.63
42 0.65
43 0.65
44 0.7
45 0.75
46 0.72
47 0.74
48 0.71
49 0.68
50 0.69
51 0.66
52 0.61
53 0.57
54 0.52
55 0.44
56 0.46
57 0.47
58 0.4
59 0.42
60 0.41
61 0.42
62 0.49
63 0.49
64 0.46
65 0.44
66 0.43
67 0.43
68 0.46
69 0.42
70 0.39
71 0.39
72 0.42
73 0.4
74 0.41
75 0.37
76 0.33
77 0.33
78 0.28
79 0.28
80 0.21
81 0.17
82 0.13
83 0.12
84 0.1
85 0.09
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.07
95 0.07
96 0.11
97 0.12
98 0.16
99 0.19
100 0.25
101 0.34
102 0.4
103 0.41
104 0.42
105 0.44
106 0.49
107 0.49
108 0.49
109 0.47
110 0.5
111 0.49
112 0.46
113 0.44
114 0.37
115 0.33
116 0.3
117 0.23
118 0.14
119 0.12
120 0.1
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.09
128 0.1
129 0.11
130 0.12
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.09
143 0.11
144 0.11
145 0.15
146 0.16
147 0.15
148 0.15
149 0.17
150 0.21
151 0.26
152 0.26
153 0.29
154 0.33
155 0.35
156 0.36
157 0.41
158 0.4
159 0.38
160 0.47
161 0.51
162 0.56
163 0.57
164 0.57
165 0.51
166 0.49
167 0.48
168 0.4
169 0.34
170 0.29
171 0.26
172 0.26
173 0.24
174 0.21
175 0.17
176 0.17
177 0.13
178 0.09
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.12
200 0.14
201 0.15
202 0.16
203 0.14
204 0.17
205 0.22
206 0.25
207 0.24
208 0.25
209 0.25
210 0.25
211 0.26
212 0.3
213 0.24
214 0.29
215 0.32
216 0.32
217 0.36
218 0.44
219 0.5
220 0.48
221 0.58
222 0.55
223 0.58
224 0.62
225 0.6
226 0.6
227 0.59
228 0.56
229 0.53
230 0.52
231 0.47
232 0.46
233 0.43
234 0.35
235 0.31
236 0.3
237 0.23
238 0.2
239 0.18
240 0.18
241 0.24
242 0.25