Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SMM5

Protein Details
Accession C9SMM5    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MLRQVKRRNARSKRALADREPKVHydrophilic
225-244KEAMRRPKTTEERTKKNIKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-14RRNARSKR
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG val:VDBG_06149  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRQVKRRNARSKRALADREPKVVENPKRLMALKGSTCSQVVQDALSNLCIMREPLAHEEDEIHPFEKADSLEFPRRKEPSRPSSCLVSTRRSGRTRSRLRGLFAPQVQERQVRVGQRPMVVFFRARPRDSPVANEYTMAKSMWTDFFKGEPSDKVDVEGLRYLVSLSVEEEGLAGAKPPMRLRVYTIRTRRSGQRLPRVEVDEIGPRMDFRVGRMQQPEEAVLKEAMRRPKTTEERTKKNIKTDEIGDKVGRVHTGRQDLSQLQTRRMKGLKRSRDVADDDAASDDEVKTDKRKKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.85
3 0.83
4 0.83
5 0.77
6 0.74
7 0.66
8 0.59
9 0.56
10 0.58
11 0.57
12 0.55
13 0.54
14 0.5
15 0.52
16 0.52
17 0.48
18 0.43
19 0.43
20 0.39
21 0.38
22 0.36
23 0.34
24 0.33
25 0.3
26 0.26
27 0.21
28 0.17
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.08
39 0.09
40 0.1
41 0.12
42 0.16
43 0.19
44 0.18
45 0.18
46 0.21
47 0.21
48 0.23
49 0.21
50 0.18
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.13
56 0.12
57 0.14
58 0.2
59 0.29
60 0.32
61 0.35
62 0.39
63 0.43
64 0.46
65 0.51
66 0.54
67 0.56
68 0.62
69 0.64
70 0.6
71 0.61
72 0.59
73 0.59
74 0.53
75 0.47
76 0.43
77 0.44
78 0.49
79 0.47
80 0.51
81 0.52
82 0.59
83 0.64
84 0.66
85 0.68
86 0.64
87 0.63
88 0.64
89 0.59
90 0.55
91 0.47
92 0.45
93 0.37
94 0.36
95 0.35
96 0.32
97 0.27
98 0.24
99 0.25
100 0.24
101 0.26
102 0.29
103 0.29
104 0.29
105 0.29
106 0.27
107 0.26
108 0.23
109 0.21
110 0.19
111 0.26
112 0.28
113 0.29
114 0.28
115 0.32
116 0.37
117 0.37
118 0.38
119 0.32
120 0.31
121 0.3
122 0.29
123 0.24
124 0.2
125 0.2
126 0.15
127 0.11
128 0.08
129 0.09
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.15
137 0.14
138 0.12
139 0.15
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.11
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.06
165 0.08
166 0.09
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.21
171 0.3
172 0.34
173 0.41
174 0.48
175 0.49
176 0.5
177 0.54
178 0.56
179 0.55
180 0.58
181 0.58
182 0.61
183 0.61
184 0.62
185 0.63
186 0.6
187 0.52
188 0.44
189 0.37
190 0.33
191 0.27
192 0.24
193 0.18
194 0.14
195 0.15
196 0.17
197 0.14
198 0.12
199 0.22
200 0.23
201 0.28
202 0.32
203 0.32
204 0.32
205 0.33
206 0.32
207 0.24
208 0.23
209 0.2
210 0.17
211 0.16
212 0.18
213 0.22
214 0.28
215 0.3
216 0.31
217 0.34
218 0.44
219 0.52
220 0.58
221 0.64
222 0.65
223 0.71
224 0.77
225 0.83
226 0.77
227 0.77
228 0.74
229 0.67
230 0.63
231 0.6
232 0.61
233 0.55
234 0.53
235 0.44
236 0.38
237 0.36
238 0.32
239 0.28
240 0.21
241 0.23
242 0.26
243 0.33
244 0.33
245 0.33
246 0.37
247 0.36
248 0.39
249 0.43
250 0.39
251 0.4
252 0.45
253 0.45
254 0.48
255 0.51
256 0.53
257 0.55
258 0.63
259 0.66
260 0.66
261 0.71
262 0.67
263 0.68
264 0.66
265 0.59
266 0.53
267 0.43
268 0.36
269 0.32
270 0.28
271 0.22
272 0.18
273 0.14
274 0.11
275 0.12
276 0.14
277 0.22