Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SPD6

Protein Details
Accession C9SPD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
182-206SGASAGRRTRRRRAARTGSCSRRRSHydrophilic
222-267PTSSTSCLRTPRRYRAPRRLRLSRSSTRRRLSRKRREKEGAEQMGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-212GSKTVGERRRADARRGPAANSGASAGRRTRRRRAARTGSCSRRRSSGGTSR
231-260TPRRYRAPRRLRLSRSSTRRRLSRKRREKE
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024629  Mhr1  
Gene Ontology GO:0000150  F:DNA strand exchange activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
KEGG val:VDBG_06761  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12829  Mhr1  
Amino Acid Sequences MNSTPIFRFAQLSLSAGIPRATVRNGHTWSRRRTAKPELSNFAPGHGEQIWSNHALKQLPFIAKKSTPAKLRKDLWRPMALIQFPAGAGTAGQSAFQKLREYRRRHELEWGDEKLYRTKEDAATGRLVRSTRTRKERGFAIHEQRENAIADMAAVLAGGGRGSKTVGERRRADARRGPAANSGASAGRRTRRRRAARTGSCSRRRSSGGTSRTRTLRARGAPTSSTSCLRTPRRYRAPRRLRLSRSSTRRRLSRKRREKEGAEQMGAHESK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.17
5 0.13
6 0.13
7 0.15
8 0.15
9 0.17
10 0.21
11 0.28
12 0.32
13 0.4
14 0.48
15 0.54
16 0.59
17 0.65
18 0.7
19 0.67
20 0.7
21 0.73
22 0.74
23 0.75
24 0.76
25 0.72
26 0.67
27 0.68
28 0.61
29 0.52
30 0.44
31 0.34
32 0.29
33 0.23
34 0.21
35 0.14
36 0.17
37 0.17
38 0.18
39 0.19
40 0.18
41 0.2
42 0.21
43 0.21
44 0.23
45 0.27
46 0.3
47 0.31
48 0.31
49 0.34
50 0.33
51 0.4
52 0.4
53 0.41
54 0.44
55 0.5
56 0.56
57 0.58
58 0.64
59 0.67
60 0.7
61 0.71
62 0.69
63 0.66
64 0.59
65 0.54
66 0.53
67 0.44
68 0.36
69 0.28
70 0.22
71 0.17
72 0.16
73 0.12
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.14
85 0.17
86 0.27
87 0.36
88 0.42
89 0.46
90 0.56
91 0.59
92 0.56
93 0.62
94 0.56
95 0.54
96 0.54
97 0.5
98 0.42
99 0.39
100 0.39
101 0.34
102 0.31
103 0.24
104 0.19
105 0.21
106 0.2
107 0.23
108 0.24
109 0.21
110 0.23
111 0.23
112 0.21
113 0.2
114 0.19
115 0.16
116 0.23
117 0.28
118 0.32
119 0.4
120 0.46
121 0.45
122 0.48
123 0.51
124 0.48
125 0.47
126 0.46
127 0.46
128 0.46
129 0.45
130 0.43
131 0.39
132 0.36
133 0.29
134 0.22
135 0.14
136 0.08
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.03
141 0.03
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.08
152 0.16
153 0.22
154 0.3
155 0.32
156 0.37
157 0.47
158 0.49
159 0.52
160 0.5
161 0.5
162 0.51
163 0.5
164 0.47
165 0.41
166 0.4
167 0.34
168 0.28
169 0.23
170 0.17
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.22
175 0.31
176 0.37
177 0.45
178 0.54
179 0.64
180 0.7
181 0.77
182 0.81
183 0.82
184 0.85
185 0.85
186 0.85
187 0.84
188 0.8
189 0.71
190 0.65
191 0.59
192 0.54
193 0.53
194 0.52
195 0.52
196 0.57
197 0.59
198 0.6
199 0.6
200 0.6
201 0.54
202 0.5
203 0.49
204 0.46
205 0.49
206 0.47
207 0.48
208 0.44
209 0.45
210 0.45
211 0.4
212 0.36
213 0.33
214 0.32
215 0.37
216 0.43
217 0.5
218 0.53
219 0.61
220 0.69
221 0.77
222 0.85
223 0.87
224 0.9
225 0.9
226 0.91
227 0.91
228 0.87
229 0.86
230 0.84
231 0.83
232 0.83
233 0.83
234 0.83
235 0.82
236 0.84
237 0.85
238 0.87
239 0.88
240 0.89
241 0.9
242 0.89
243 0.91
244 0.91
245 0.88
246 0.87
247 0.87
248 0.84
249 0.75
250 0.66
251 0.57