Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QHP8

Protein Details
Accession W1QHP8    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-63QQPNKRTKRAADFAKSRKEEHydrophilic
260-279LTTSKKPRELRITRCRNQTVHydrophilic
316-337GHAGGKKKPRNPEGRAARRSKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-345KAGKVVLEGERAKKGTRVKGIKNGGHAGGKKKPRNPEGRAARRSKEFRQKLGAK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG opa:HPODL_03712  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDSLATLFAQPSRIDNKELVARKRTLVELPKTEEEERALEAGQQPNKRTKRAADFAKSRKEESSATTSAPKYDPVAEKEKNKRTIFIGNLPTAIMASKKSTKELKALFKPFGKIESMRFRSFAVQSNLPRKAAYILHNVKDDDTTNCYMVFEKEEDSLKAVELNGTVFMDHHLRVDHVAQPLKHDNKLSVFVGNLDFEETEESLWRFFNETCSPDKSNVIANVRLVRDSKTNYGKGFAIVQFTDTNYVSKALLQNKKELTTSKKPRELRITRCRNQTVAPVKDRKLGSAVKAGKVVLEGERAKKGTRVKGIKNGGHAGGKKKPRNPEGRAARRSKEFRQKLGAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.27
4 0.31
5 0.37
6 0.44
7 0.47
8 0.47
9 0.47
10 0.47
11 0.49
12 0.47
13 0.46
14 0.47
15 0.49
16 0.49
17 0.53
18 0.54
19 0.56
20 0.54
21 0.48
22 0.41
23 0.35
24 0.3
25 0.24
26 0.2
27 0.18
28 0.22
29 0.27
30 0.31
31 0.34
32 0.36
33 0.45
34 0.5
35 0.52
36 0.51
37 0.52
38 0.56
39 0.6
40 0.66
41 0.66
42 0.71
43 0.75
44 0.8
45 0.75
46 0.67
47 0.6
48 0.54
49 0.46
50 0.41
51 0.41
52 0.32
53 0.31
54 0.35
55 0.33
56 0.33
57 0.32
58 0.27
59 0.22
60 0.26
61 0.29
62 0.29
63 0.36
64 0.38
65 0.47
66 0.56
67 0.62
68 0.65
69 0.61
70 0.59
71 0.55
72 0.57
73 0.53
74 0.51
75 0.48
76 0.39
77 0.38
78 0.36
79 0.32
80 0.24
81 0.2
82 0.12
83 0.08
84 0.11
85 0.16
86 0.17
87 0.22
88 0.27
89 0.29
90 0.36
91 0.42
92 0.47
93 0.5
94 0.54
95 0.54
96 0.52
97 0.52
98 0.45
99 0.4
100 0.34
101 0.27
102 0.29
103 0.35
104 0.37
105 0.36
106 0.36
107 0.34
108 0.35
109 0.35
110 0.36
111 0.3
112 0.31
113 0.35
114 0.42
115 0.43
116 0.4
117 0.37
118 0.31
119 0.29
120 0.27
121 0.26
122 0.28
123 0.3
124 0.33
125 0.35
126 0.34
127 0.32
128 0.29
129 0.27
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.12
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.1
164 0.12
165 0.14
166 0.17
167 0.16
168 0.2
169 0.27
170 0.28
171 0.29
172 0.26
173 0.24
174 0.23
175 0.26
176 0.23
177 0.16
178 0.14
179 0.13
180 0.14
181 0.12
182 0.1
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.13
197 0.16
198 0.18
199 0.21
200 0.26
201 0.27
202 0.27
203 0.28
204 0.24
205 0.24
206 0.27
207 0.27
208 0.23
209 0.24
210 0.27
211 0.26
212 0.27
213 0.23
214 0.2
215 0.21
216 0.23
217 0.29
218 0.31
219 0.34
220 0.33
221 0.34
222 0.33
223 0.3
224 0.3
225 0.24
226 0.2
227 0.16
228 0.18
229 0.16
230 0.16
231 0.18
232 0.14
233 0.14
234 0.12
235 0.13
236 0.11
237 0.13
238 0.18
239 0.24
240 0.31
241 0.32
242 0.38
243 0.39
244 0.41
245 0.41
246 0.4
247 0.4
248 0.44
249 0.53
250 0.56
251 0.62
252 0.64
253 0.7
254 0.76
255 0.76
256 0.76
257 0.76
258 0.78
259 0.76
260 0.82
261 0.77
262 0.69
263 0.62
264 0.61
265 0.6
266 0.57
267 0.59
268 0.57
269 0.55
270 0.6
271 0.58
272 0.5
273 0.46
274 0.41
275 0.36
276 0.39
277 0.41
278 0.36
279 0.38
280 0.36
281 0.3
282 0.27
283 0.26
284 0.18
285 0.21
286 0.22
287 0.24
288 0.29
289 0.3
290 0.3
291 0.34
292 0.4
293 0.42
294 0.48
295 0.54
296 0.56
297 0.65
298 0.73
299 0.71
300 0.69
301 0.65
302 0.58
303 0.56
304 0.53
305 0.5
306 0.49
307 0.56
308 0.58
309 0.6
310 0.67
311 0.7
312 0.76
313 0.76
314 0.78
315 0.79
316 0.82
317 0.86
318 0.83
319 0.79
320 0.79
321 0.8
322 0.79
323 0.79
324 0.76
325 0.74