Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QIR6

Protein Details
Accession W1QIR6    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-126QEQRAQRLEKRTKKRKSTLQTPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-138LEKRTKKRKSTLQTPTMAKKRKIPGARA
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG opa:HPODL_04554  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSICTLYVRNLNERLSHQKLRSALEQLFSELGIPIQEIKLFKNLQLRGQAFITLKSHEDCVRAIEHLNTKVIFDKPMDMYIAKTNSDLAVQEHMEQSAYEQYLQEQRAQRLEKRTKKRKSTLQTPTMAKKRKIPGARAAEPHKILLVTNVPSSATRDQVESIFEKFTGFLNVNIVHIRNLALVEFRSDLESARCLESLGTSIKINDTDCYLQFAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.48
3 0.52
4 0.48
5 0.49
6 0.5
7 0.51
8 0.5
9 0.47
10 0.4
11 0.37
12 0.35
13 0.32
14 0.28
15 0.23
16 0.19
17 0.14
18 0.12
19 0.08
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.18
27 0.18
28 0.21
29 0.28
30 0.3
31 0.32
32 0.4
33 0.39
34 0.36
35 0.36
36 0.37
37 0.29
38 0.3
39 0.27
40 0.2
41 0.2
42 0.18
43 0.2
44 0.18
45 0.19
46 0.16
47 0.17
48 0.17
49 0.16
50 0.16
51 0.17
52 0.2
53 0.2
54 0.22
55 0.2
56 0.19
57 0.21
58 0.21
59 0.19
60 0.15
61 0.16
62 0.15
63 0.16
64 0.17
65 0.14
66 0.14
67 0.17
68 0.18
69 0.16
70 0.15
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.13
90 0.14
91 0.18
92 0.19
93 0.2
94 0.25
95 0.27
96 0.3
97 0.35
98 0.44
99 0.49
100 0.57
101 0.66
102 0.7
103 0.77
104 0.81
105 0.81
106 0.8
107 0.81
108 0.79
109 0.76
110 0.74
111 0.69
112 0.69
113 0.68
114 0.66
115 0.57
116 0.55
117 0.54
118 0.55
119 0.57
120 0.53
121 0.54
122 0.57
123 0.6
124 0.58
125 0.56
126 0.53
127 0.48
128 0.44
129 0.35
130 0.26
131 0.21
132 0.18
133 0.17
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.16
144 0.17
145 0.17
146 0.2
147 0.17
148 0.17
149 0.15
150 0.14
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.14
155 0.13
156 0.12
157 0.15
158 0.15
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.14
177 0.16
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.14
182 0.15
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.14
188 0.15
189 0.17
190 0.19
191 0.19
192 0.17
193 0.2
194 0.21
195 0.21
196 0.27