Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QBI3

Protein Details
Accession W1QBI3    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MESERPRQKRDKLEGPKRDAILBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 13.833, nucl 11.5, mito_nucl 7.166, cyto_pero 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017132  Lsm7  
IPR044641  Lsm7/SmG-like  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
KEGG opa:HPODL_04033  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01729  LSm7  
Amino Acid Sequences MESERPRQKRDKLEGPKRDAILDLQKYQNQRLVITFLGGRKVTGVLKGFDQLMNLVLDNCFETLREECDSHTLSSQTRHLGLVVVRGPVLLTISPFGGSEVIENPYQTQNKVMH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.85
3 0.82
4 0.73
5 0.64
6 0.54
7 0.48
8 0.46
9 0.41
10 0.37
11 0.35
12 0.37
13 0.39
14 0.4
15 0.4
16 0.31
17 0.27
18 0.24
19 0.23
20 0.2
21 0.19
22 0.18
23 0.15
24 0.18
25 0.17
26 0.15
27 0.13
28 0.14
29 0.13
30 0.15
31 0.15
32 0.12
33 0.13
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.12
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.06
43 0.05
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.07
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.15
56 0.16
57 0.15
58 0.16
59 0.15
60 0.14
61 0.17
62 0.19
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.11
76 0.12
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.1
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.14
92 0.21
93 0.23
94 0.23