Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QA03

Protein Details
Accession W1QA03    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-113KDNRRQDTKIKDRQIRERIABasic
390-418WENRGDLNRYFRRRRRDVLRQAKKGGRAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-167RLRRTPRKTSLAKLSMRANIKGTLKIVRARK
401-417RRRRRDVLRQAKKGGRA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG opa:HPODL_01723  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MADDKRRIYVGSMSKSLAENPRDLEQRFEKFGKVVRGFEIHHKEVLDYYYGYITLQIPEDQLKKLKRSFNGVTYKGSKLAIQEAKPDYKERWLKDNRRQDTKIKDRQIRERIAQCRLERIAQRDTNPFELSNTEKGRLRRTPRKTSLAKLSMRANIKGTLKIVRARKTKVWGYNKNKHPVDLVWRYIDGEWRDGNDHTVEKVKTDFTMGETEKEIIEEKERTTKMLESWMDSFDFNKPVDLSDDEELKNMSVSRDRENQAMDEPVDKEPAVVVFDEEDTVPQASNEQKDEDEDVDTEFLPSFLQKAKPVEQKEEPSASNKTTEVLRTLLNPTEPVKEPEYMEPEMAAPVTSSKKYGLFFSHSKSPFLSAQTQLATLKTVEIGEEYDKWFWENRGDLNRYFRRRRRDVLRQAKKGGRAPLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.43
4 0.42
5 0.36
6 0.33
7 0.33
8 0.39
9 0.43
10 0.42
11 0.44
12 0.43
13 0.46
14 0.49
15 0.48
16 0.42
17 0.4
18 0.45
19 0.48
20 0.44
21 0.41
22 0.38
23 0.41
24 0.41
25 0.48
26 0.5
27 0.42
28 0.41
29 0.39
30 0.36
31 0.34
32 0.33
33 0.25
34 0.17
35 0.16
36 0.15
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.13
43 0.12
44 0.13
45 0.18
46 0.21
47 0.22
48 0.28
49 0.32
50 0.38
51 0.44
52 0.5
53 0.48
54 0.55
55 0.57
56 0.59
57 0.63
58 0.59
59 0.59
60 0.56
61 0.54
62 0.47
63 0.42
64 0.34
65 0.27
66 0.33
67 0.33
68 0.3
69 0.35
70 0.38
71 0.42
72 0.42
73 0.43
74 0.36
75 0.39
76 0.45
77 0.41
78 0.47
79 0.53
80 0.61
81 0.68
82 0.77
83 0.75
84 0.77
85 0.78
86 0.75
87 0.76
88 0.77
89 0.76
90 0.75
91 0.76
92 0.73
93 0.79
94 0.81
95 0.76
96 0.73
97 0.71
98 0.68
99 0.67
100 0.67
101 0.57
102 0.55
103 0.5
104 0.49
105 0.44
106 0.43
107 0.45
108 0.42
109 0.45
110 0.44
111 0.46
112 0.43
113 0.4
114 0.35
115 0.27
116 0.26
117 0.27
118 0.28
119 0.26
120 0.26
121 0.28
122 0.31
123 0.37
124 0.43
125 0.49
126 0.51
127 0.58
128 0.66
129 0.7
130 0.77
131 0.74
132 0.72
133 0.73
134 0.71
135 0.64
136 0.57
137 0.53
138 0.5
139 0.48
140 0.43
141 0.35
142 0.32
143 0.31
144 0.29
145 0.26
146 0.25
147 0.25
148 0.3
149 0.34
150 0.37
151 0.41
152 0.43
153 0.46
154 0.49
155 0.52
156 0.56
157 0.6
158 0.63
159 0.67
160 0.72
161 0.75
162 0.78
163 0.71
164 0.63
165 0.55
166 0.46
167 0.45
168 0.41
169 0.35
170 0.27
171 0.27
172 0.27
173 0.25
174 0.27
175 0.19
176 0.17
177 0.15
178 0.14
179 0.16
180 0.15
181 0.16
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.13
192 0.12
193 0.09
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.13
202 0.08
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.2
211 0.18
212 0.23
213 0.23
214 0.18
215 0.19
216 0.19
217 0.19
218 0.17
219 0.18
220 0.13
221 0.15
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.13
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.14
240 0.18
241 0.25
242 0.26
243 0.28
244 0.28
245 0.28
246 0.25
247 0.25
248 0.21
249 0.16
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.14
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.09
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.08
270 0.11
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.15
275 0.16
276 0.18
277 0.17
278 0.15
279 0.13
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.1
290 0.13
291 0.16
292 0.21
293 0.29
294 0.36
295 0.4
296 0.45
297 0.47
298 0.5
299 0.52
300 0.51
301 0.44
302 0.41
303 0.41
304 0.35
305 0.32
306 0.27
307 0.23
308 0.21
309 0.21
310 0.19
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.2
315 0.21
316 0.19
317 0.2
318 0.2
319 0.23
320 0.25
321 0.26
322 0.26
323 0.26
324 0.27
325 0.3
326 0.34
327 0.3
328 0.28
329 0.24
330 0.22
331 0.2
332 0.18
333 0.13
334 0.08
335 0.1
336 0.14
337 0.14
338 0.15
339 0.16
340 0.2
341 0.21
342 0.24
343 0.25
344 0.28
345 0.31
346 0.36
347 0.43
348 0.41
349 0.42
350 0.4
351 0.39
352 0.36
353 0.36
354 0.36
355 0.29
356 0.32
357 0.31
358 0.32
359 0.29
360 0.26
361 0.23
362 0.18
363 0.16
364 0.13
365 0.12
366 0.1
367 0.1
368 0.12
369 0.13
370 0.15
371 0.17
372 0.17
373 0.17
374 0.19
375 0.21
376 0.2
377 0.23
378 0.24
379 0.29
380 0.38
381 0.42
382 0.45
383 0.52
384 0.6
385 0.64
386 0.71
387 0.71
388 0.73
389 0.76
390 0.82
391 0.82
392 0.84
393 0.85
394 0.86
395 0.9
396 0.88
397 0.89
398 0.86
399 0.83
400 0.79