FuNGI

Q2HCM6

Protein Details

Accession

Q2HCM6

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-127	LGGDKKKPRTAGARKKKGKTETIE	Basic
140-162	PVAVAPPKKSGRKPRAKKDATLA	Hydrophilic
305-327	IPQASPTKPKVVKKKPRTITELA	Hydrophilic
369-396	ASAKPKAAKKAPKPRATKKKQSPPEPIL	Hydrophilic
758-779	DEPQVEKRSRGRPKKDATTSPA	Hydrophilic
798-820	CTTQPAPTTPRRRKAPAKQIFEI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
107-122	DKKKPRTAGARKKKGK
145-157	PPKKSGRKPRAKK
369-389	ASAKPKAAKKAPKPRATKKKQ
698-706	AKKGRKKAG
720-727	KWPRGRPR
764-796	KRSRGRPKKDATTSPATRATRAKAPPSPKRAKS
809-811	RRK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization
Pfam	View protein in Pfam PF02178 AT_hook PF09494 Slx4
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MAHHDSVLVISSSPDFPSICDLLPKATRQPSLRSGSNAAPVSNDAPAAFTSAANIWQSSRARHLEGAEISNIGPSQSATTAADLATVPAESPIKSGVEGPTLPLGGDKKKPRTAGARKKKGKTETIEPPLALDMAVADGPVAVAPPKKSGRKPRAKKDATLAQTTLPKGKVTKTAAREITKAQKKAETVSRHFTPHTSAPPELVAGPIDDSPSVFEPAMARRMDWTPPRESASVHCLADSSMEKEVSSSALSLQDHVFKNLQDTYGRTMEASGYIGAALPLTSMDVLGKRKLVEMVSCVGHRQEIPQASPTKPKVVKKKPRTITELATAAYRRPEEAERSTLSRQQDTHIPSGNLELPSEQLTAASKSASAKPKAAKKAPKPRATKKKQSPPEPILLSPTSAMRQVSNQDFVFGTASQLATEDDPVLLRALHEAMKVSNQADSDPFATPSPGNSNLAIRRRSGAGLWAAGARYGDGDLLDAEVLDLTRSSPLTLAQFAQNPPPPCPEAVLADKPPVESAYIEIEMSDDTLDLTISPPVGSPKTLPPCPPRPGGQAVRHKDSNLAVSGRPQTPPQEADFDPPPSNQEQHQLLLSQSNTPQQPQPAPPPPPSFELYTDARLAKEVASYGFKVVKKRTAMIALLNRCWESRNKTALGSTAAQAAMSTSAPNQAASPSRPRGRPRKDSLTATTEVVQAPSPAKKGRKKAGVVSGAGSEVPQPEKWPRGRPRKDSAASVSSITAPAATNPRRRSAAISDVDSDEPQVEKRSRGRPKKDATTSPATRATRAKAPPSPKRAKSPCTTQPAPTTPRRRKAPAKQIFEIPDSGSDDPFASSAPSSPDQHSDLFSSPPAVDLSVTEDTEASLIASPTTQDVSLFGYITRAVASAPPTKDPANPSWHEKMLMYDPIILEDLTAWLNAGRLDQVGFDGEVAPGDVKKWCESKSVCCLWRVNLRGKERKRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.13
3	0.13
4	0.19
5	0.2
6	0.18
7	0.21
8	0.21
9	0.25
10	0.3
11	0.33
12	0.35
13	0.4
14	0.46
15	0.46
16	0.52
17	0.55
18	0.58
19	0.58
20	0.55
21	0.53
22	0.5
23	0.54
24	0.48
25	0.4
26	0.34
27	0.32
28	0.29
29	0.26
30	0.22
31	0.14
32	0.14
33	0.14
34	0.15
35	0.14
36	0.11
37	0.12
38	0.13
39	0.16
40	0.16
41	0.16
42	0.14
43	0.2
44	0.23
45	0.24
46	0.31
47	0.32
48	0.34
49	0.36
50	0.37
51	0.37
52	0.38
53	0.38
54	0.31
55	0.28
56	0.25
57	0.23
58	0.21
59	0.14
60	0.11
61	0.09
62	0.1
63	0.1
64	0.12
65	0.11
66	0.13
67	0.13
68	0.13
69	0.14
70	0.11
71	0.11
72	0.1
73	0.09
74	0.07
75	0.09
76	0.11
77	0.1
78	0.11
79	0.12
80	0.12
81	0.13
82	0.16
83	0.15
84	0.18
85	0.18
86	0.19
87	0.2
88	0.19
89	0.18
90	0.19
91	0.21
92	0.21
93	0.3
94	0.37
95	0.43
96	0.49
97	0.52
98	0.55
99	0.62
100	0.68
101	0.71
102	0.74
103	0.77
104	0.8
105	0.86
106	0.88
107	0.85
108	0.83
109	0.78
110	0.76
111	0.75
112	0.74
113	0.69
114	0.6
115	0.53
116	0.45
117	0.38
118	0.28
119	0.17
120	0.09
121	0.07
122	0.07
123	0.06
124	0.04
125	0.04
126	0.04
127	0.04
128	0.05
129	0.05
130	0.08
131	0.1
132	0.17
133	0.25
134	0.32
135	0.41
136	0.52
137	0.62
138	0.7
139	0.8
140	0.84
141	0.88
142	0.86
143	0.82
144	0.8
145	0.78
146	0.72
147	0.67
148	0.57
149	0.49
150	0.49
151	0.46
152	0.42
153	0.33
154	0.31
155	0.27
156	0.3
157	0.34
158	0.36
159	0.42
160	0.42
161	0.49
162	0.54
163	0.55
164	0.54
165	0.52
166	0.56
167	0.57
168	0.55
169	0.49
170	0.47
171	0.45
172	0.49
173	0.52
174	0.5
175	0.47
176	0.51
177	0.51
178	0.49
179	0.49
180	0.44
181	0.41
182	0.37
183	0.39
184	0.36
185	0.33
186	0.31
187	0.31
188	0.3
189	0.25
190	0.2
191	0.13
192	0.09
193	0.1
194	0.09
195	0.09
196	0.08
197	0.08
198	0.1
199	0.11
200	0.12
201	0.11
202	0.11
203	0.13
204	0.16
205	0.22
206	0.19
207	0.18
208	0.19
209	0.21
210	0.27
211	0.31
212	0.33
213	0.32
214	0.34
215	0.38
216	0.36
217	0.35
218	0.32
219	0.32
220	0.33
221	0.28
222	0.25
223	0.21
224	0.2
225	0.23
226	0.21
227	0.16
228	0.14
229	0.14
230	0.14
231	0.14
232	0.14
233	0.12
234	0.11
235	0.09
236	0.08
237	0.11
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.19
242	0.2
243	0.22
244	0.22
245	0.19
246	0.22
247	0.22
248	0.22
249	0.17
250	0.19
251	0.21
252	0.22
253	0.21
254	0.18
255	0.17
256	0.16
257	0.15
258	0.14
259	0.08
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.04
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.04
272	0.08
273	0.1
274	0.12
275	0.13
276	0.13
277	0.14
278	0.16
279	0.17
280	0.15
281	0.15
282	0.17
283	0.17
284	0.17
285	0.17
286	0.15
287	0.15
288	0.14
289	0.13
290	0.16
291	0.17
292	0.18
293	0.24
294	0.27
295	0.28
296	0.36
297	0.35
298	0.38
299	0.42
300	0.47
301	0.52
302	0.6
303	0.69
304	0.72
305	0.81
306	0.8
307	0.81
308	0.82
309	0.75
310	0.68
311	0.63
312	0.54
313	0.44
314	0.38
315	0.31
316	0.25
317	0.23
318	0.19
319	0.14
320	0.15
321	0.17
322	0.2
323	0.23
324	0.26
325	0.25
326	0.29
327	0.31
328	0.32
329	0.32
330	0.3
331	0.27
332	0.25
333	0.29
334	0.29
335	0.31
336	0.3
337	0.28
338	0.25
339	0.27
340	0.28
341	0.22
342	0.19
343	0.15
344	0.12
345	0.13
346	0.13
347	0.11
348	0.07
349	0.08
350	0.09
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.09
355	0.16
356	0.22
357	0.23
358	0.26
359	0.31
360	0.39
361	0.46
362	0.52
363	0.55
364	0.59
365	0.69
366	0.74
367	0.77
368	0.78
369	0.81
370	0.85
371	0.85
372	0.86
373	0.85
374	0.86
375	0.86
376	0.86
377	0.84
378	0.77
379	0.75
380	0.67
381	0.57
382	0.5
383	0.42
384	0.33
385	0.24
386	0.21
387	0.14
388	0.13
389	0.13
390	0.09
391	0.11
392	0.14
393	0.16
394	0.19
395	0.18
396	0.18
397	0.17
398	0.17
399	0.17
400	0.13
401	0.11
402	0.08
403	0.08
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.07
422	0.08
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.11
431	0.1
432	0.11
433	0.09
434	0.1
435	0.1
436	0.1
437	0.13
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.16
442	0.21
443	0.26
444	0.26
445	0.23
446	0.22
447	0.22
448	0.22
449	0.19
450	0.17
451	0.12
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.06
459	0.05
460	0.04
461	0.04
462	0.03
463	0.04
464	0.03
465	0.04
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.06
479	0.07
480	0.08
481	0.09
482	0.1
483	0.12
484	0.13
485	0.17
486	0.2
487	0.2
488	0.21
489	0.23
490	0.22
491	0.19
492	0.2
493	0.17
494	0.16
495	0.19
496	0.2
497	0.18
498	0.19
499	0.19
500	0.18
501	0.17
502	0.14
503	0.11
504	0.08
505	0.08
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.08
510	0.08
511	0.08
512	0.08
513	0.06
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.07
525	0.07
526	0.08
527	0.09
528	0.16
529	0.22
530	0.24
531	0.29
532	0.33
533	0.4
534	0.44
535	0.45
536	0.4
537	0.39
538	0.44
539	0.47
540	0.49
541	0.51
542	0.52
543	0.55
544	0.52
545	0.48
546	0.43
547	0.37
548	0.31
549	0.23
550	0.2
551	0.15
552	0.18
553	0.22
554	0.21
555	0.21
556	0.19
557	0.2
558	0.21
559	0.23
560	0.21
561	0.22
562	0.21
563	0.24
564	0.26
565	0.26
566	0.24
567	0.22
568	0.23
569	0.2
570	0.21
571	0.18
572	0.21
573	0.19
574	0.19
575	0.2
576	0.18
577	0.16
578	0.18
579	0.18
580	0.14
581	0.13
582	0.17
583	0.17
584	0.18
585	0.2
586	0.2
587	0.23
588	0.25
589	0.32
590	0.35
591	0.38
592	0.42
593	0.45
594	0.44
595	0.43
596	0.42
597	0.36
598	0.31
599	0.31
600	0.28
601	0.25
602	0.26
603	0.23
604	0.2
605	0.19
606	0.17
607	0.13
608	0.11
609	0.1
610	0.09
611	0.11
612	0.11
613	0.12
614	0.17
615	0.19
616	0.24
617	0.26
618	0.31
619	0.31
620	0.32
621	0.33
622	0.32
623	0.31
624	0.32
625	0.37
626	0.33
627	0.33
628	0.32
629	0.3
630	0.26
631	0.27
632	0.26
633	0.25
634	0.29
635	0.33
636	0.33
637	0.33
638	0.34
639	0.34
640	0.33
641	0.27
642	0.2
643	0.17
644	0.16
645	0.14
646	0.13
647	0.11
648	0.09
649	0.07
650	0.07
651	0.05
652	0.09
653	0.09
654	0.09
655	0.09
656	0.11
657	0.14
658	0.17
659	0.24
660	0.28
661	0.34
662	0.4
663	0.48
664	0.56
665	0.63
666	0.69
667	0.71
668	0.73
669	0.74
670	0.74
671	0.71
672	0.66
673	0.58
674	0.49
675	0.42
676	0.34
677	0.28
678	0.23
679	0.17
680	0.13
681	0.14
682	0.14
683	0.16
684	0.21
685	0.29
686	0.35
687	0.44
688	0.52
689	0.58
690	0.6
691	0.64
692	0.68
693	0.64
694	0.58
695	0.51
696	0.43
697	0.34
698	0.3
699	0.23
700	0.14
701	0.11
702	0.12
703	0.11
704	0.13
705	0.17
706	0.25
707	0.3
708	0.39
709	0.47
710	0.57
711	0.66
712	0.71
713	0.75
714	0.78
715	0.76
716	0.72
717	0.68
718	0.6
719	0.52
720	0.45
721	0.37
722	0.27
723	0.25
724	0.19
725	0.13
726	0.09
727	0.1
728	0.18
729	0.24
730	0.31
731	0.33
732	0.39
733	0.41
734	0.42
735	0.44
736	0.41
737	0.44
738	0.41
739	0.4
740	0.38
741	0.37
742	0.37
743	0.32
744	0.27
745	0.19
746	0.15
747	0.14
748	0.18
749	0.17
750	0.22
751	0.29
752	0.39
753	0.48
754	0.58
755	0.66
756	0.7
757	0.77
758	0.82
759	0.84
760	0.81
761	0.78
762	0.77
763	0.71
764	0.67
765	0.66
766	0.57
767	0.52
768	0.49
769	0.46
770	0.44
771	0.46
772	0.48
773	0.47
774	0.55
775	0.61
776	0.67
777	0.73
778	0.7
779	0.76
780	0.76
781	0.76
782	0.74
783	0.74
784	0.72
785	0.72
786	0.69
787	0.63
788	0.64
789	0.64
790	0.64
791	0.64
792	0.66
793	0.66
794	0.73
795	0.75
796	0.76
797	0.79
798	0.83
799	0.84
800	0.83
801	0.82
802	0.76
803	0.76
804	0.71
805	0.63
806	0.54
807	0.44
808	0.37
809	0.33
810	0.3
811	0.23
812	0.19
813	0.17
814	0.16
815	0.15
816	0.12
817	0.09
818	0.08
819	0.1
820	0.14
821	0.18
822	0.2
823	0.22
824	0.26
825	0.28
826	0.29
827	0.29
828	0.27
829	0.25
830	0.23
831	0.22
832	0.2
833	0.17
834	0.17
835	0.16
836	0.13
837	0.12
838	0.1
839	0.16
840	0.16
841	0.16
842	0.15
843	0.14
844	0.14
845	0.14
846	0.13
847	0.08
848	0.07
849	0.07
850	0.07
851	0.07
852	0.08
853	0.09
854	0.1
855	0.1
856	0.08
857	0.09
858	0.13
859	0.14
860	0.13
861	0.12
862	0.12
863	0.12
864	0.12
865	0.12
866	0.08
867	0.08
868	0.1
869	0.14
870	0.21
871	0.23
872	0.25
873	0.28
874	0.3
875	0.34
876	0.37
877	0.39
878	0.4
879	0.42
880	0.47
881	0.5
882	0.5
883	0.48
884	0.42
885	0.41
886	0.37
887	0.38
888	0.32
889	0.28
890	0.26
891	0.26
892	0.27
893	0.21
894	0.16
895	0.12
896	0.12
897	0.09
898	0.09
899	0.08
900	0.07
901	0.08
902	0.08
903	0.09
904	0.08
905	0.09
906	0.09
907	0.09
908	0.1
909	0.11
910	0.11
911	0.1
912	0.1
913	0.09
914	0.09
915	0.1
916	0.1
917	0.08
918	0.09
919	0.12
920	0.14
921	0.2
922	0.24
923	0.25
924	0.33
925	0.37
926	0.44
927	0.5
928	0.57
929	0.55
930	0.56
931	0.58
932	0.55
933	0.61
934	0.59
935	0.59
936	0.59
937	0.66
938	0.71

Q2HCM6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer