Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QJX6

Protein Details
Accession W1QJX6    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-65EKPVKEPGKADQKPKKNVIKIBasic
379-399DYEKERAKWTKPKYMGKIDSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-88KPVKEPGKADQKPKKNVIKIVRPGAKASTPKKAAEESKGRPEK
320-327KRRTGRGK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 9.333, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG opa:HPODL_04919  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MVDYAVKELKTPEAASQHFINLLGESPDALEFISEFSKTLEKPQEKPVKEPGKADQKPKKNVIKIVRPGAKASTPKKAAEESKGRPEKNLKLDNLKELDDALIELEAQRGGRVCNCNATRHPLFEMFPNCLNCGKIICVKEGLQPCSFCGQDLLSSEERRQIAQVLQKEKDELNGVKHVVKEKEKPKKNSKITISVSSAGQNNFKVQDQLFKRIERKKELERENMAKSKKEQEELAEAVKQIEYLEATKGKDQELLQAEQRLDKLLEFQANGAQRTRIIDQASDFEVPANSLSPWASPVERALQLKKQQREMKRLEDEEKRRTGRGKKVLDMSIRDGKVIMREVATPETGSDGEIEELEQQMNRHSLEQLEKNAQTVWDYEKERAKWTKPKYMGKIDSDEVAEEVHGGVVQLGEDAEEMLFGLGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.35
4 0.33
5 0.3
6 0.29
7 0.24
8 0.17
9 0.16
10 0.14
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.1
15 0.09
16 0.09
17 0.07
18 0.06
19 0.08
20 0.09
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.15
25 0.16
26 0.24
27 0.32
28 0.35
29 0.39
30 0.5
31 0.58
32 0.56
33 0.61
34 0.63
35 0.63
36 0.61
37 0.61
38 0.6
39 0.61
40 0.65
41 0.7
42 0.69
43 0.69
44 0.74
45 0.8
46 0.81
47 0.76
48 0.8
49 0.79
50 0.8
51 0.78
52 0.79
53 0.77
54 0.69
55 0.64
56 0.59
57 0.56
58 0.54
59 0.5
60 0.5
61 0.46
62 0.47
63 0.48
64 0.5
65 0.48
66 0.49
67 0.54
68 0.5
69 0.57
70 0.63
71 0.6
72 0.6
73 0.62
74 0.62
75 0.62
76 0.64
77 0.58
78 0.59
79 0.62
80 0.63
81 0.58
82 0.5
83 0.41
84 0.33
85 0.29
86 0.19
87 0.17
88 0.1
89 0.07
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.13
99 0.17
100 0.18
101 0.26
102 0.28
103 0.33
104 0.34
105 0.42
106 0.38
107 0.36
108 0.39
109 0.32
110 0.31
111 0.32
112 0.32
113 0.27
114 0.3
115 0.28
116 0.27
117 0.25
118 0.25
119 0.19
120 0.18
121 0.17
122 0.18
123 0.19
124 0.19
125 0.2
126 0.21
127 0.26
128 0.31
129 0.32
130 0.29
131 0.28
132 0.27
133 0.28
134 0.27
135 0.21
136 0.16
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.17
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.22
145 0.22
146 0.21
147 0.2
148 0.17
149 0.18
150 0.23
151 0.28
152 0.29
153 0.3
154 0.3
155 0.31
156 0.29
157 0.27
158 0.25
159 0.21
160 0.18
161 0.2
162 0.21
163 0.21
164 0.22
165 0.25
166 0.26
167 0.29
168 0.34
169 0.4
170 0.49
171 0.56
172 0.63
173 0.69
174 0.75
175 0.78
176 0.78
177 0.74
178 0.73
179 0.68
180 0.64
181 0.57
182 0.47
183 0.41
184 0.34
185 0.32
186 0.23
187 0.21
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.12
194 0.19
195 0.19
196 0.27
197 0.28
198 0.3
199 0.38
200 0.42
201 0.47
202 0.46
203 0.49
204 0.49
205 0.56
206 0.59
207 0.59
208 0.58
209 0.58
210 0.56
211 0.57
212 0.5
213 0.43
214 0.39
215 0.41
216 0.38
217 0.35
218 0.3
219 0.27
220 0.3
221 0.29
222 0.28
223 0.2
224 0.18
225 0.16
226 0.15
227 0.13
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.1
234 0.11
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.18
239 0.17
240 0.21
241 0.23
242 0.24
243 0.23
244 0.26
245 0.25
246 0.23
247 0.23
248 0.18
249 0.15
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.15
254 0.13
255 0.13
256 0.16
257 0.18
258 0.19
259 0.17
260 0.15
261 0.14
262 0.17
263 0.18
264 0.17
265 0.16
266 0.16
267 0.16
268 0.18
269 0.2
270 0.17
271 0.16
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.15
287 0.18
288 0.21
289 0.23
290 0.29
291 0.36
292 0.44
293 0.48
294 0.53
295 0.57
296 0.62
297 0.68
298 0.67
299 0.68
300 0.68
301 0.68
302 0.65
303 0.67
304 0.67
305 0.65
306 0.67
307 0.6
308 0.56
309 0.59
310 0.6
311 0.61
312 0.63
313 0.61
314 0.59
315 0.63
316 0.66
317 0.63
318 0.59
319 0.55
320 0.53
321 0.47
322 0.42
323 0.35
324 0.3
325 0.29
326 0.28
327 0.22
328 0.15
329 0.16
330 0.19
331 0.21
332 0.21
333 0.17
334 0.14
335 0.15
336 0.14
337 0.13
338 0.11
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.12
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.16
353 0.19
354 0.25
355 0.31
356 0.33
357 0.38
358 0.37
359 0.37
360 0.37
361 0.33
362 0.27
363 0.24
364 0.24
365 0.24
366 0.26
367 0.31
368 0.37
369 0.39
370 0.46
371 0.52
372 0.55
373 0.57
374 0.63
375 0.68
376 0.69
377 0.77
378 0.78
379 0.81
380 0.8
381 0.77
382 0.75
383 0.66
384 0.59
385 0.5
386 0.42
387 0.31
388 0.24
389 0.18
390 0.12
391 0.11
392 0.08
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05