Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QDA4

Protein Details
Accession W1QDA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-136LEKFNLRKEHKKKKKDEINEPDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-127RKEHKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.333, cyto 8.5, cyto_pero 5.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0003887  F:DNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
KEGG opa:HPODL_03329  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MPAKGWKKDGDDSNFETAADNEKVSIESMLFPKATVHKVAKHVLSQSETNMILAKESQTVLQRGSVLFVNYLYHHAKQVAKEQGRKVVNANDVLAGLERAQFAGFVPALSEELEKFNLRKEHKKKKKDEINEPDDEQENENKRAKVDVDEAMTEDVPDTTQDDATAEATEAGEDTEEAEEDAEGDEAPTLTASQRLQQEMKELEGDEPTETAESENEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.45
3 0.39
4 0.31
5 0.29
6 0.24
7 0.19
8 0.14
9 0.15
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.09
14 0.11
15 0.13
16 0.15
17 0.14
18 0.14
19 0.16
20 0.2
21 0.22
22 0.25
23 0.27
24 0.3
25 0.36
26 0.41
27 0.4
28 0.39
29 0.4
30 0.37
31 0.37
32 0.33
33 0.29
34 0.27
35 0.25
36 0.22
37 0.2
38 0.16
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.1
43 0.1
44 0.12
45 0.14
46 0.15
47 0.15
48 0.16
49 0.16
50 0.14
51 0.16
52 0.15
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.14
59 0.15
60 0.14
61 0.15
62 0.18
63 0.2
64 0.2
65 0.28
66 0.33
67 0.35
68 0.4
69 0.41
70 0.46
71 0.45
72 0.44
73 0.39
74 0.35
75 0.33
76 0.28
77 0.27
78 0.19
79 0.18
80 0.17
81 0.14
82 0.09
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.12
104 0.18
105 0.21
106 0.31
107 0.4
108 0.5
109 0.6
110 0.7
111 0.74
112 0.79
113 0.85
114 0.84
115 0.85
116 0.84
117 0.8
118 0.74
119 0.67
120 0.58
121 0.49
122 0.41
123 0.32
124 0.28
125 0.25
126 0.26
127 0.3
128 0.28
129 0.27
130 0.28
131 0.28
132 0.25
133 0.24
134 0.22
135 0.19
136 0.19
137 0.2
138 0.19
139 0.18
140 0.14
141 0.11
142 0.08
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.09
179 0.1
180 0.15
181 0.19
182 0.24
183 0.25
184 0.26
185 0.32
186 0.31
187 0.32
188 0.29
189 0.26
190 0.23
191 0.23
192 0.23
193 0.17
194 0.15
195 0.14
196 0.12
197 0.11
198 0.11