Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1Q820

Protein Details
Accession W1Q820    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-82EITSSPLPAKRKRRPEQPSSLSNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-71RKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 11.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG opa:HPODL_02784  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
Amino Acid Sequences MDIIDLESSDPPGPRSAHLFVSSSPTPTRRRLLSVKTSAPKLSRSAARSSPSSLPSIIEITSSPLPAKRKRRPEQPSSLSNAIVLESGSESDSEPAERKKKIALPSSPTGAGDESVLEIDPVGPSDDIQLGSIFDISTKTAITPSKPKQPASAVTPASTTEGPEGDLDALLEHAKKFKSKELKQVNKMQRTKDELLAEMSVEIETRLHAKLAGINADFESFLAPIKVYTASLYLPLIQFKRQVEAVYHEQKGTYVPIDKYMKTESTVVLYYDAAELVDKIRDDTLRTIILKVKRMRQDANVVLMINGYQQHLQTLRAQHNRAFVSQVMRKMDHDKTQRVLGPANNTVSAETVRKKLVELEVFFGIHIFPIKGLRELVDWIRSFSYTMAQKNYDPHERNRELANIGNIRCGQTPEECYQESLKQLKYLVTSSARTLAKKYPTLVQLADKLQTGVPSLIRTDVEQNLRKVFTSTDPNELLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.28
3 0.28
4 0.3
5 0.32
6 0.33
7 0.29
8 0.35
9 0.34
10 0.31
11 0.32
12 0.34
13 0.37
14 0.41
15 0.47
16 0.43
17 0.5
18 0.55
19 0.6
20 0.64
21 0.67
22 0.7
23 0.69
24 0.7
25 0.67
26 0.62
27 0.56
28 0.5
29 0.48
30 0.46
31 0.44
32 0.46
33 0.47
34 0.48
35 0.47
36 0.49
37 0.47
38 0.42
39 0.41
40 0.35
41 0.3
42 0.27
43 0.26
44 0.21
45 0.16
46 0.14
47 0.16
48 0.17
49 0.17
50 0.16
51 0.19
52 0.26
53 0.35
54 0.45
55 0.5
56 0.6
57 0.68
58 0.78
59 0.83
60 0.86
61 0.87
62 0.85
63 0.82
64 0.78
65 0.72
66 0.61
67 0.52
68 0.42
69 0.31
70 0.23
71 0.16
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.13
82 0.2
83 0.26
84 0.27
85 0.28
86 0.33
87 0.39
88 0.45
89 0.51
90 0.51
91 0.52
92 0.55
93 0.57
94 0.52
95 0.46
96 0.39
97 0.3
98 0.23
99 0.16
100 0.12
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.1
128 0.12
129 0.15
130 0.24
131 0.29
132 0.38
133 0.43
134 0.43
135 0.45
136 0.48
137 0.49
138 0.45
139 0.48
140 0.39
141 0.35
142 0.34
143 0.3
144 0.28
145 0.23
146 0.18
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.09
161 0.1
162 0.13
163 0.15
164 0.22
165 0.32
166 0.36
167 0.46
168 0.54
169 0.63
170 0.67
171 0.76
172 0.78
173 0.77
174 0.77
175 0.7
176 0.65
177 0.63
178 0.59
179 0.53
180 0.45
181 0.36
182 0.33
183 0.3
184 0.24
185 0.16
186 0.13
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.04
191 0.04
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.09
198 0.1
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.08
206 0.08
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.14
226 0.14
227 0.16
228 0.15
229 0.15
230 0.14
231 0.18
232 0.24
233 0.26
234 0.26
235 0.24
236 0.24
237 0.23
238 0.23
239 0.19
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.18
244 0.21
245 0.21
246 0.22
247 0.24
248 0.23
249 0.2
250 0.21
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.08
269 0.1
270 0.12
271 0.13
272 0.15
273 0.16
274 0.17
275 0.21
276 0.25
277 0.31
278 0.33
279 0.38
280 0.42
281 0.46
282 0.47
283 0.45
284 0.49
285 0.44
286 0.43
287 0.37
288 0.3
289 0.26
290 0.23
291 0.19
292 0.12
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.1
299 0.12
300 0.15
301 0.21
302 0.28
303 0.34
304 0.36
305 0.37
306 0.42
307 0.42
308 0.39
309 0.34
310 0.28
311 0.28
312 0.3
313 0.32
314 0.3
315 0.29
316 0.3
317 0.34
318 0.37
319 0.38
320 0.41
321 0.41
322 0.4
323 0.44
324 0.45
325 0.41
326 0.4
327 0.35
328 0.34
329 0.33
330 0.32
331 0.28
332 0.25
333 0.23
334 0.21
335 0.19
336 0.18
337 0.17
338 0.18
339 0.19
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.27
344 0.29
345 0.27
346 0.28
347 0.28
348 0.28
349 0.27
350 0.23
351 0.16
352 0.11
353 0.1
354 0.07
355 0.06
356 0.1
357 0.11
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.14
362 0.17
363 0.19
364 0.22
365 0.21
366 0.22
367 0.22
368 0.22
369 0.21
370 0.19
371 0.22
372 0.21
373 0.25
374 0.27
375 0.29
376 0.31
377 0.36
378 0.41
379 0.45
380 0.44
381 0.48
382 0.54
383 0.54
384 0.55
385 0.52
386 0.5
387 0.42
388 0.42
389 0.42
390 0.37
391 0.35
392 0.37
393 0.35
394 0.34
395 0.33
396 0.31
397 0.25
398 0.24
399 0.29
400 0.27
401 0.31
402 0.29
403 0.3
404 0.32
405 0.32
406 0.34
407 0.35
408 0.33
409 0.31
410 0.32
411 0.32
412 0.32
413 0.3
414 0.3
415 0.29
416 0.29
417 0.28
418 0.35
419 0.35
420 0.33
421 0.36
422 0.37
423 0.4
424 0.42
425 0.43
426 0.42
427 0.43
428 0.45
429 0.44
430 0.42
431 0.4
432 0.39
433 0.39
434 0.32
435 0.3
436 0.27
437 0.25
438 0.22
439 0.19
440 0.18
441 0.17
442 0.18
443 0.19
444 0.19
445 0.2
446 0.23
447 0.27
448 0.34
449 0.39
450 0.42
451 0.44
452 0.45
453 0.43
454 0.4
455 0.36
456 0.33
457 0.37
458 0.37
459 0.39