Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QE64

Protein Details
Accession W1QE64    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
396-427VVLVKKHYVRSNKRMKHRNWKLKRMANEHKDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-418NKRMKHRNWKLK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG opa:HPODL_03853  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MSNYTQLTPQAAQPQATVLCCNCGVPMDGSTGLVMCYDCIKLNVDITAGIPREANISFCRNCERFLQPPQQWMRAELESRELLAICLRRLKGLNKVRLIDASFIWTEPHSRRIRIKLTVQGEALTNTIIQQSFEVEYVVVAMQCPDCAKSYTANTWRAAVQIRQKVQHKRTFLYLEQLILKHNAHMDTISIKESKDGLDFYYSQRNHAAKMIDFLNSVVPIKSKKSEELISQDIHSGTSQYKFTFSVEIVPICKDDLVVLPKKLAKSMGDMSRLVLCSKVSNMVQFIDPVSLQTGDLLAQVFWRTPFVALADVTQMVEFIVLDVEPTGQRNGRWLLADVTVARASDMGSNDQEYYVRSHLGGILHPGDSALGYFLTNSNFNNELFDELNTDTIPDVVLVKKHYVRSNKRMKHRNWKLKRMANEHKDLVADEIVDSRQARQEAEKAERDYELFLQELEEDQELRKTVNLYRAENKPVEEDDMEEEDDAPQIDIDELLDELDEMNLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.3
4 0.29
5 0.21
6 0.22
7 0.22
8 0.22
9 0.17
10 0.16
11 0.17
12 0.16
13 0.16
14 0.16
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.15
19 0.12
20 0.11
21 0.1
22 0.07
23 0.08
24 0.09
25 0.1
26 0.11
27 0.14
28 0.15
29 0.16
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.15
34 0.19
35 0.17
36 0.16
37 0.15
38 0.14
39 0.17
40 0.17
41 0.18
42 0.16
43 0.23
44 0.24
45 0.26
46 0.35
47 0.33
48 0.34
49 0.37
50 0.4
51 0.4
52 0.47
53 0.55
54 0.5
55 0.58
56 0.62
57 0.63
58 0.58
59 0.53
60 0.49
61 0.43
62 0.43
63 0.34
64 0.34
65 0.27
66 0.27
67 0.25
68 0.2
69 0.16
70 0.18
71 0.19
72 0.16
73 0.22
74 0.21
75 0.24
76 0.28
77 0.31
78 0.37
79 0.44
80 0.51
81 0.5
82 0.52
83 0.5
84 0.5
85 0.48
86 0.4
87 0.31
88 0.26
89 0.21
90 0.19
91 0.18
92 0.15
93 0.19
94 0.19
95 0.28
96 0.27
97 0.32
98 0.38
99 0.45
100 0.52
101 0.53
102 0.57
103 0.56
104 0.56
105 0.55
106 0.49
107 0.42
108 0.36
109 0.3
110 0.24
111 0.16
112 0.12
113 0.08
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.06
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.09
134 0.11
135 0.12
136 0.14
137 0.18
138 0.26
139 0.32
140 0.36
141 0.35
142 0.35
143 0.34
144 0.32
145 0.31
146 0.28
147 0.3
148 0.32
149 0.35
150 0.4
151 0.47
152 0.54
153 0.6
154 0.62
155 0.58
156 0.53
157 0.56
158 0.54
159 0.48
160 0.45
161 0.37
162 0.32
163 0.3
164 0.28
165 0.24
166 0.21
167 0.2
168 0.15
169 0.16
170 0.14
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.12
186 0.13
187 0.15
188 0.23
189 0.22
190 0.23
191 0.28
192 0.28
193 0.26
194 0.28
195 0.28
196 0.19
197 0.22
198 0.21
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.15
210 0.15
211 0.17
212 0.2
213 0.22
214 0.24
215 0.27
216 0.28
217 0.25
218 0.24
219 0.23
220 0.2
221 0.18
222 0.15
223 0.11
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.07
242 0.06
243 0.08
244 0.12
245 0.14
246 0.14
247 0.16
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.17
252 0.13
253 0.15
254 0.2
255 0.23
256 0.24
257 0.24
258 0.24
259 0.25
260 0.25
261 0.2
262 0.16
263 0.11
264 0.09
265 0.1
266 0.12
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.05
313 0.06
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.13
318 0.15
319 0.16
320 0.16
321 0.17
322 0.17
323 0.17
324 0.18
325 0.14
326 0.14
327 0.13
328 0.12
329 0.11
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.11
341 0.14
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.1
355 0.09
356 0.08
357 0.06
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.06
362 0.08
363 0.1
364 0.1
365 0.13
366 0.14
367 0.15
368 0.16
369 0.15
370 0.16
371 0.15
372 0.15
373 0.14
374 0.13
375 0.14
376 0.12
377 0.12
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.1
385 0.12
386 0.17
387 0.21
388 0.26
389 0.33
390 0.42
391 0.5
392 0.58
393 0.67
394 0.71
395 0.77
396 0.82
397 0.85
398 0.86
399 0.88
400 0.89
401 0.88
402 0.9
403 0.9
404 0.88
405 0.88
406 0.86
407 0.86
408 0.83
409 0.8
410 0.71
411 0.62
412 0.55
413 0.46
414 0.39
415 0.28
416 0.21
417 0.14
418 0.13
419 0.12
420 0.14
421 0.14
422 0.13
423 0.17
424 0.18
425 0.19
426 0.21
427 0.27
428 0.31
429 0.38
430 0.43
431 0.41
432 0.42
433 0.41
434 0.38
435 0.35
436 0.31
437 0.25
438 0.19
439 0.16
440 0.14
441 0.14
442 0.14
443 0.13
444 0.12
445 0.11
446 0.11
447 0.14
448 0.14
449 0.14
450 0.15
451 0.16
452 0.2
453 0.27
454 0.32
455 0.35
456 0.42
457 0.47
458 0.52
459 0.52
460 0.49
461 0.45
462 0.41
463 0.4
464 0.33
465 0.3
466 0.28
467 0.28
468 0.27
469 0.23
470 0.21
471 0.17
472 0.17
473 0.16
474 0.11
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06