Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QD22

Protein Details
Accession W1QD22    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
597-624EYLENGKKKRRTVKRPVKKIRKATVVEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
602-618GKKKRRTVKRPVKKIRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 15.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022712  Beta_Casp  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR035639  CPSF2_MBL  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
KEGG opa:HPODL_04115  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13299  CPSF100_C  
PF16661  Lactamase_B_6  
CDD cd16293  CPSF2-like_MBL-fold  
Amino Acid Sequences MFEFVSLAPPKQIAEAVEEPDEDSYDPFEDQEVKDEDEDDKKVLQLEQLKNTSKTQARLLTFDGQLNILADPGWDGVSDISYLEPHIPNIHLIILSQTTTEYLGAFAYLLYKYPILRKVKTYATLPVSKLGRLATIELYRSAGLVGPLKGAVLDVEDVENYFNSIITVNYSQSVSLTGNLSGITITAYNSGHTLGGSFWLLNKDAEKIVYAPTWNHSKDYFLKPGRLNLPNLLRATTLISGSDLGSSLSHKMRISKFMELVKLTLMNGTSILLPTSVTGRLLELLPLLDQNVPVDINFYLLSFTGKKSLEFSGNMLEWMSPDITKNWENQNQTPFESNRLKLISLRDLASLDHRPKIIFVDGTDLNEGSLSRDCFIELCSKHNTALIMTERPEVNTTAYDVYKEWESKVKNDNNLKDGALTILEKQMSLSATREEKLRGSELNAYKKSVEERRQRRKEQEVQERLNNDLLDTLIGEDEDDDDDDSEFSDGEDAGADAENGENGEVKTTTTSTALTQSTHSAKDEEEHITVDQILQMPMDFDVRNAKGRNRMFPFIVKKVSVDDYGEVIRHSDFMREEEKFPLNKPTYEEEVEEVVEEYLENGKKKRRTVKRPVKKIRKATVVEQVKEKDTVYNLDALADPKVRSIKPISVEIRCGLAFVDLSGLADLRSMRITFNSVKPRKVILLPNTTQAYMGGALDVMDAVMAQQKSKMLAIYQADDASGILGTDYILSKFNEKIDLGNVVTSYDLVISNELNNTLNWQAITGGYSIAHVYGEVVPVAPGDKHLKLVPPTNTNLMPVSNSISIGDIKLAELRRKLTELNHAVEFRGDGTLVVNNQLAVRKVTDGNLVIDGAMGQLFYQVRSLVQDMLAYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.25
4 0.26
5 0.25
6 0.24
7 0.23
8 0.23
9 0.16
10 0.13
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.13
16 0.16
17 0.16
18 0.22
19 0.23
20 0.24
21 0.24
22 0.26
23 0.27
24 0.28
25 0.29
26 0.25
27 0.22
28 0.22
29 0.23
30 0.23
31 0.25
32 0.3
33 0.35
34 0.42
35 0.48
36 0.52
37 0.53
38 0.54
39 0.57
40 0.53
41 0.5
42 0.49
43 0.49
44 0.47
45 0.47
46 0.49
47 0.47
48 0.43
49 0.42
50 0.36
51 0.28
52 0.26
53 0.23
54 0.19
55 0.12
56 0.1
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.15
74 0.16
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.13
79 0.12
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.12
100 0.18
101 0.26
102 0.31
103 0.34
104 0.38
105 0.42
106 0.48
107 0.51
108 0.48
109 0.48
110 0.48
111 0.5
112 0.46
113 0.47
114 0.42
115 0.38
116 0.37
117 0.3
118 0.25
119 0.2
120 0.21
121 0.2
122 0.21
123 0.22
124 0.21
125 0.22
126 0.19
127 0.18
128 0.16
129 0.12
130 0.11
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.14
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.08
169 0.08
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.06
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.14
199 0.17
200 0.24
201 0.24
202 0.25
203 0.23
204 0.26
205 0.32
206 0.38
207 0.43
208 0.39
209 0.45
210 0.45
211 0.51
212 0.54
213 0.51
214 0.47
215 0.44
216 0.46
217 0.44
218 0.43
219 0.37
220 0.3
221 0.26
222 0.27
223 0.21
224 0.16
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.1
235 0.11
236 0.14
237 0.14
238 0.21
239 0.23
240 0.3
241 0.33
242 0.34
243 0.36
244 0.37
245 0.4
246 0.34
247 0.32
248 0.26
249 0.23
250 0.18
251 0.15
252 0.12
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.08
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.16
295 0.19
296 0.2
297 0.19
298 0.2
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.16
303 0.13
304 0.1
305 0.11
306 0.1
307 0.06
308 0.07
309 0.08
310 0.12
311 0.13
312 0.17
313 0.22
314 0.28
315 0.32
316 0.35
317 0.39
318 0.38
319 0.38
320 0.39
321 0.32
322 0.34
323 0.35
324 0.31
325 0.3
326 0.29
327 0.28
328 0.26
329 0.29
330 0.26
331 0.23
332 0.23
333 0.2
334 0.19
335 0.19
336 0.21
337 0.23
338 0.2
339 0.2
340 0.2
341 0.19
342 0.19
343 0.21
344 0.19
345 0.13
346 0.12
347 0.14
348 0.14
349 0.15
350 0.15
351 0.13
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.07
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.16
364 0.14
365 0.17
366 0.2
367 0.21
368 0.21
369 0.22
370 0.21
371 0.14
372 0.17
373 0.16
374 0.14
375 0.15
376 0.17
377 0.15
378 0.16
379 0.17
380 0.14
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.1
389 0.12
390 0.12
391 0.11
392 0.15
393 0.16
394 0.2
395 0.28
396 0.31
397 0.37
398 0.43
399 0.45
400 0.41
401 0.42
402 0.37
403 0.29
404 0.25
405 0.17
406 0.11
407 0.09
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.09
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.14
424 0.15
425 0.12
426 0.13
427 0.2
428 0.24
429 0.31
430 0.3
431 0.3
432 0.28
433 0.29
434 0.32
435 0.32
436 0.36
437 0.38
438 0.48
439 0.59
440 0.67
441 0.72
442 0.75
443 0.76
444 0.76
445 0.76
446 0.77
447 0.74
448 0.69
449 0.67
450 0.61
451 0.53
452 0.46
453 0.36
454 0.25
455 0.16
456 0.12
457 0.08
458 0.07
459 0.06
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.03
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.03
480 0.04
481 0.04
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.04
489 0.04
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.12
503 0.15
504 0.17
505 0.17
506 0.17
507 0.14
508 0.14
509 0.14
510 0.16
511 0.15
512 0.13
513 0.14
514 0.13
515 0.12
516 0.12
517 0.11
518 0.09
519 0.08
520 0.07
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.08
526 0.07
527 0.06
528 0.12
529 0.14
530 0.19
531 0.2
532 0.23
533 0.3
534 0.32
535 0.41
536 0.4
537 0.42
538 0.39
539 0.44
540 0.47
541 0.44
542 0.44
543 0.36
544 0.31
545 0.31
546 0.31
547 0.25
548 0.2
549 0.16
550 0.15
551 0.15
552 0.15
553 0.12
554 0.11
555 0.09
556 0.1
557 0.09
558 0.1
559 0.1
560 0.13
561 0.17
562 0.18
563 0.2
564 0.23
565 0.27
566 0.26
567 0.26
568 0.33
569 0.31
570 0.31
571 0.33
572 0.33
573 0.33
574 0.34
575 0.33
576 0.25
577 0.24
578 0.22
579 0.19
580 0.15
581 0.1
582 0.08
583 0.07
584 0.06
585 0.09
586 0.12
587 0.13
588 0.16
589 0.24
590 0.29
591 0.36
592 0.46
593 0.53
594 0.61
595 0.71
596 0.79
597 0.83
598 0.89
599 0.93
600 0.94
601 0.93
602 0.92
603 0.89
604 0.87
605 0.8
606 0.74
607 0.73
608 0.69
609 0.62
610 0.57
611 0.51
612 0.43
613 0.41
614 0.36
615 0.28
616 0.21
617 0.23
618 0.18
619 0.19
620 0.17
621 0.16
622 0.17
623 0.15
624 0.16
625 0.16
626 0.15
627 0.14
628 0.19
629 0.18
630 0.21
631 0.24
632 0.26
633 0.27
634 0.35
635 0.37
636 0.35
637 0.38
638 0.35
639 0.34
640 0.28
641 0.25
642 0.17
643 0.13
644 0.11
645 0.08
646 0.09
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.05
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.08
656 0.08
657 0.09
658 0.1
659 0.15
660 0.18
661 0.26
662 0.36
663 0.38
664 0.4
665 0.42
666 0.44
667 0.43
668 0.44
669 0.45
670 0.42
671 0.48
672 0.46
673 0.5
674 0.49
675 0.45
676 0.4
677 0.31
678 0.25
679 0.16
680 0.14
681 0.08
682 0.06
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.04
687 0.03
688 0.03
689 0.03
690 0.08
691 0.08
692 0.08
693 0.1
694 0.11
695 0.13
696 0.14
697 0.15
698 0.1
699 0.16
700 0.19
701 0.2
702 0.2
703 0.19
704 0.18
705 0.17
706 0.16
707 0.11
708 0.08
709 0.06
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.09
717 0.1
718 0.12
719 0.14
720 0.16
721 0.19
722 0.18
723 0.19
724 0.19
725 0.22
726 0.2
727 0.2
728 0.18
729 0.15
730 0.14
731 0.13
732 0.1
733 0.08
734 0.08
735 0.07
736 0.08
737 0.08
738 0.1
739 0.11
740 0.12
741 0.11
742 0.11
743 0.13
744 0.13
745 0.14
746 0.12
747 0.12
748 0.11
749 0.11
750 0.12
751 0.09
752 0.09
753 0.08
754 0.08
755 0.08
756 0.08
757 0.07
758 0.06
759 0.08
760 0.08
761 0.09
762 0.08
763 0.08
764 0.08
765 0.08
766 0.1
767 0.08
768 0.11
769 0.15
770 0.16
771 0.18
772 0.21
773 0.27
774 0.3
775 0.38
776 0.41
777 0.41
778 0.44
779 0.47
780 0.45
781 0.41
782 0.38
783 0.31
784 0.26
785 0.22
786 0.23
787 0.18
788 0.18
789 0.16
790 0.17
791 0.16
792 0.15
793 0.15
794 0.11
795 0.1
796 0.15
797 0.19
798 0.23
799 0.26
800 0.29
801 0.31
802 0.34
803 0.36
804 0.35
805 0.42
806 0.43
807 0.43
808 0.45
809 0.42
810 0.4
811 0.38
812 0.34
813 0.24
814 0.19
815 0.15
816 0.1
817 0.11
818 0.14
819 0.14
820 0.15
821 0.14
822 0.14
823 0.16
824 0.19
825 0.19
826 0.17
827 0.18
828 0.2
829 0.21
830 0.23
831 0.26
832 0.25
833 0.25
834 0.25
835 0.23
836 0.19
837 0.17
838 0.15
839 0.1
840 0.08
841 0.06
842 0.04
843 0.08
844 0.09
845 0.09
846 0.11
847 0.11
848 0.12
849 0.15
850 0.18
851 0.15
852 0.15