Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QIT4

Protein Details
Accession W1QIT4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
502-531AVEPAKPQKQQQQKKKKGEEKSQPQKQETEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
485-521RKKQVPGAIPAKKAIPGAVEPAKPQKQQQQKKKKGEE
Subcellular Location(s) mito 18, cyto_nucl 5.5, nucl 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
KEGG opa:HPODL_00274  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MSKVPQIYCRQPRTVQLIQAQPVFKPVENFEAPTLETRCSAYSPDGTLFAYTQPSCVTICEADTGRVLFTIPVGDVFDFQFSPKGTFLTTWSKPTKLDDESGNWANNVTVWKLDLASSAGVSIQSYLNKSQSGWKAQFTSDESIFCRMINMHQIDFFKSHEPGQKAIYSINVKDLGQIQSFKMSPGKNPSLALFVPGSKGKQSYIQVYSLPNVKTPTSQKQFFNGESCQFTWNDLGTSILALVSTDVDSSNKSYYGQTTLYLLGISGAFDQRIALDKEGPIHDITWSPTSREFAVIYGYMPSQTTFFDARGNAIHSLPQNSSNTILFSPHAKFILVAGFGNLQGNVDILDRQNKFAKVASFKASNTSVCKWSPDGRYILTATTSPRLRVDNCVKIWYANGSLCYVKEFPELYSVDWRFQPLSDFPPIKGLDECCTPDVSAVEYLAKRAKISSAADKPAGAYRPPHARNQPSEPVRTLAQREALQRKKQVPGAIPAKKAIPGAVEPAKPQKQQQQKKKKGEEKSQPQKQETEAGVIGGVISYEEKKIRNLLKKLRAIEQLKVKKENGEFLEDTQVLKIQTERQVRKELASLGWSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.62
3 0.6
4 0.6
5 0.57
6 0.59
7 0.53
8 0.44
9 0.43
10 0.39
11 0.33
12 0.3
13 0.28
14 0.3
15 0.31
16 0.33
17 0.29
18 0.28
19 0.28
20 0.31
21 0.3
22 0.23
23 0.23
24 0.22
25 0.22
26 0.21
27 0.23
28 0.21
29 0.22
30 0.24
31 0.24
32 0.24
33 0.23
34 0.23
35 0.21
36 0.18
37 0.21
38 0.18
39 0.18
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.13
46 0.14
47 0.17
48 0.18
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.16
53 0.15
54 0.15
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.08
59 0.08
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.11
66 0.12
67 0.15
68 0.14
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.15
73 0.16
74 0.21
75 0.26
76 0.27
77 0.33
78 0.36
79 0.37
80 0.37
81 0.41
82 0.43
83 0.38
84 0.38
85 0.35
86 0.35
87 0.4
88 0.43
89 0.39
90 0.32
91 0.28
92 0.25
93 0.22
94 0.2
95 0.14
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.1
112 0.13
113 0.15
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.25
118 0.29
119 0.35
120 0.36
121 0.37
122 0.38
123 0.38
124 0.41
125 0.37
126 0.36
127 0.29
128 0.28
129 0.26
130 0.27
131 0.26
132 0.22
133 0.19
134 0.15
135 0.16
136 0.22
137 0.23
138 0.2
139 0.23
140 0.25
141 0.26
142 0.26
143 0.26
144 0.21
145 0.2
146 0.23
147 0.27
148 0.28
149 0.27
150 0.29
151 0.29
152 0.27
153 0.26
154 0.28
155 0.24
156 0.22
157 0.24
158 0.23
159 0.21
160 0.22
161 0.25
162 0.22
163 0.21
164 0.22
165 0.18
166 0.2
167 0.21
168 0.2
169 0.22
170 0.2
171 0.22
172 0.29
173 0.33
174 0.3
175 0.31
176 0.31
177 0.29
178 0.28
179 0.26
180 0.18
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.14
186 0.15
187 0.13
188 0.18
189 0.2
190 0.24
191 0.25
192 0.26
193 0.26
194 0.26
195 0.28
196 0.27
197 0.25
198 0.21
199 0.21
200 0.2
201 0.22
202 0.27
203 0.35
204 0.36
205 0.4
206 0.4
207 0.44
208 0.47
209 0.44
210 0.43
211 0.35
212 0.31
213 0.29
214 0.29
215 0.25
216 0.21
217 0.2
218 0.18
219 0.15
220 0.13
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.08
225 0.06
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.15
279 0.13
280 0.1
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.12
300 0.11
301 0.13
302 0.12
303 0.14
304 0.14
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.17
309 0.15
310 0.15
311 0.13
312 0.13
313 0.1
314 0.12
315 0.13
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.13
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.13
337 0.13
338 0.16
339 0.2
340 0.2
341 0.21
342 0.23
343 0.26
344 0.24
345 0.26
346 0.28
347 0.27
348 0.26
349 0.29
350 0.28
351 0.26
352 0.26
353 0.25
354 0.25
355 0.23
356 0.25
357 0.24
358 0.28
359 0.29
360 0.29
361 0.29
362 0.26
363 0.28
364 0.27
365 0.24
366 0.19
367 0.17
368 0.15
369 0.18
370 0.18
371 0.17
372 0.18
373 0.2
374 0.21
375 0.28
376 0.34
377 0.36
378 0.37
379 0.38
380 0.36
381 0.34
382 0.33
383 0.27
384 0.22
385 0.15
386 0.15
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.17
391 0.15
392 0.14
393 0.15
394 0.15
395 0.14
396 0.18
397 0.19
398 0.18
399 0.26
400 0.26
401 0.25
402 0.25
403 0.26
404 0.21
405 0.2
406 0.22
407 0.16
408 0.19
409 0.24
410 0.25
411 0.24
412 0.3
413 0.3
414 0.28
415 0.28
416 0.26
417 0.21
418 0.23
419 0.25
420 0.2
421 0.2
422 0.18
423 0.17
424 0.16
425 0.15
426 0.12
427 0.11
428 0.14
429 0.13
430 0.15
431 0.18
432 0.18
433 0.16
434 0.16
435 0.17
436 0.18
437 0.22
438 0.29
439 0.32
440 0.35
441 0.36
442 0.35
443 0.35
444 0.35
445 0.33
446 0.25
447 0.21
448 0.23
449 0.33
450 0.35
451 0.42
452 0.46
453 0.51
454 0.56
455 0.61
456 0.66
457 0.6
458 0.62
459 0.56
460 0.5
461 0.45
462 0.43
463 0.39
464 0.33
465 0.33
466 0.33
467 0.39
468 0.46
469 0.52
470 0.55
471 0.59
472 0.6
473 0.61
474 0.61
475 0.59
476 0.53
477 0.54
478 0.58
479 0.57
480 0.54
481 0.49
482 0.46
483 0.43
484 0.39
485 0.3
486 0.23
487 0.18
488 0.23
489 0.27
490 0.27
491 0.27
492 0.36
493 0.42
494 0.41
495 0.45
496 0.48
497 0.53
498 0.62
499 0.71
500 0.73
501 0.77
502 0.86
503 0.92
504 0.91
505 0.9
506 0.91
507 0.91
508 0.9
509 0.91
510 0.89
511 0.87
512 0.81
513 0.74
514 0.66
515 0.63
516 0.53
517 0.47
518 0.37
519 0.29
520 0.26
521 0.22
522 0.19
523 0.11
524 0.09
525 0.04
526 0.06
527 0.06
528 0.1
529 0.13
530 0.15
531 0.17
532 0.26
533 0.34
534 0.43
535 0.51
536 0.59
537 0.66
538 0.72
539 0.74
540 0.73
541 0.74
542 0.68
543 0.66
544 0.66
545 0.65
546 0.65
547 0.67
548 0.61
549 0.59
550 0.58
551 0.58
552 0.51
553 0.49
554 0.44
555 0.4
556 0.46
557 0.39
558 0.37
559 0.3
560 0.29
561 0.22
562 0.21
563 0.22
564 0.21
565 0.29
566 0.39
567 0.44
568 0.47
569 0.56
570 0.56
571 0.57
572 0.55
573 0.5
574 0.43