Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QIS7

Protein Details
Accession W1QIS7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23LQDQTQKHSHPRQLSKNPSLTLHydrophilic
667-699IAYGKDRCANPPKSKKNKNRNRKKNLNDSRESFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
677-690PPKSKKNKNRNRKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR018835  RNA-binding_domain_put  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG opa:HPODL_04958  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10378  RRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MLQDQTQKHSHPRQLSKNPSLTLVTGQSHTHGPPPPLFAPPYASYTHQLPNGAQIINVPMTQQVPMSPTTPFDVNYAKGMLPRQLLVSSPFIQSPMAHSQAPPQSAHVDRGSARNPQSSVPAENSAHHQTPHRTGFRRGSFSKQLKSKLTQVARAPKTTESSESSEHEHEPDEFETRSLRFINLRPDIGLSDFLDLIEYGPIENCSFELTPHSSNNKAIILSFVKNETAFKCYSKLRTILDELRSVLESPEMELLPAKNVPLLPVVQWAIENDGATRAVCLSNIPSGLPLRVVYQELEVMGPIEHIKYIPNKNAAFVHFTSISTAIKCVEQLSLSESILSTAKVFYSKEKNASVLQSNGTANIEYDCEDNQYSDFYSTPSTSFSSPQNANIPLHKPSSRHATENTVYGPHYVQSMPTPVLHSPYPPQGEFVDSYNGMVYSQQSLPDLTDLTLYSNGSVTNISLPAGDSAEASSIQSKTLFRQSNFGNRTIYLGNIHPETTAEEICNTVRGGLLESIKLIPDRHICFLTFIDSGSAAQFFATGTKEKVIIHGRRVKVDWGKHPGPVSSRVLEAIEKHSASRNLYIGTEPVSEETQEEDRPKIPDIDTLRRDFSIFGEIEQINFFRDGQCAFVNFLNIVSSINAVEDFNGEGRDAVHASFENRYKAFKIAYGKDRCANPPKSKKNKNRNRKKNLNDSRESFKQSSEDVSATDDDTLRKVPALKSIGISSKMYEEKHAIVSPVIEETFNEAGETMDDSSSHSNDSNVEIITSKVDALKLSEETSKINNSLPGCNLSNSSSESIPKAAPGSSRKSNSSGNRYRVQNNFSRSSSNNSINYFNHSDHYPSQPPVQFHPYYQQPSPMYQQHYAFSYPQPPTAGLIRQNSSSSRKTLYHEPTSPIAQQFVYLQQPTRSQQIYYNYPDYYSYHPQASFYMESRDDVSEQGPRDESYNEENAQY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.85
3 0.85
4 0.83
5 0.76
6 0.69
7 0.61
8 0.52
9 0.45
10 0.4
11 0.33
12 0.28
13 0.27
14 0.26
15 0.26
16 0.26
17 0.28
18 0.28
19 0.29
20 0.3
21 0.36
22 0.36
23 0.38
24 0.38
25 0.34
26 0.35
27 0.34
28 0.34
29 0.3
30 0.31
31 0.3
32 0.32
33 0.36
34 0.32
35 0.32
36 0.29
37 0.33
38 0.34
39 0.31
40 0.26
41 0.22
42 0.23
43 0.23
44 0.22
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.15
49 0.15
50 0.12
51 0.13
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.15
56 0.18
57 0.19
58 0.18
59 0.2
60 0.22
61 0.22
62 0.24
63 0.24
64 0.21
65 0.23
66 0.25
67 0.26
68 0.24
69 0.23
70 0.23
71 0.22
72 0.22
73 0.23
74 0.26
75 0.24
76 0.23
77 0.23
78 0.21
79 0.21
80 0.2
81 0.22
82 0.24
83 0.24
84 0.23
85 0.23
86 0.31
87 0.35
88 0.38
89 0.33
90 0.28
91 0.31
92 0.33
93 0.37
94 0.3
95 0.28
96 0.28
97 0.33
98 0.34
99 0.35
100 0.37
101 0.37
102 0.37
103 0.35
104 0.39
105 0.36
106 0.37
107 0.33
108 0.36
109 0.32
110 0.32
111 0.36
112 0.36
113 0.35
114 0.33
115 0.35
116 0.34
117 0.41
118 0.49
119 0.51
120 0.49
121 0.54
122 0.62
123 0.64
124 0.67
125 0.62
126 0.61
127 0.64
128 0.67
129 0.69
130 0.66
131 0.66
132 0.64
133 0.65
134 0.65
135 0.64
136 0.62
137 0.6
138 0.61
139 0.64
140 0.62
141 0.6
142 0.55
143 0.48
144 0.47
145 0.43
146 0.39
147 0.33
148 0.33
149 0.34
150 0.33
151 0.35
152 0.33
153 0.32
154 0.28
155 0.25
156 0.22
157 0.22
158 0.21
159 0.19
160 0.17
161 0.17
162 0.18
163 0.17
164 0.2
165 0.17
166 0.18
167 0.19
168 0.23
169 0.32
170 0.33
171 0.34
172 0.31
173 0.31
174 0.31
175 0.28
176 0.26
177 0.17
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.08
189 0.07
190 0.08
191 0.07
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.15
196 0.17
197 0.2
198 0.25
199 0.29
200 0.28
201 0.29
202 0.32
203 0.29
204 0.25
205 0.22
206 0.21
207 0.21
208 0.2
209 0.2
210 0.19
211 0.18
212 0.18
213 0.21
214 0.18
215 0.18
216 0.18
217 0.18
218 0.21
219 0.24
220 0.29
221 0.31
222 0.34
223 0.33
224 0.36
225 0.41
226 0.43
227 0.42
228 0.39
229 0.35
230 0.32
231 0.3
232 0.26
233 0.2
234 0.15
235 0.12
236 0.11
237 0.13
238 0.11
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.1
251 0.13
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.08
286 0.08
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.06
293 0.08
294 0.14
295 0.19
296 0.24
297 0.3
298 0.3
299 0.32
300 0.35
301 0.34
302 0.32
303 0.28
304 0.27
305 0.21
306 0.21
307 0.2
308 0.19
309 0.18
310 0.13
311 0.13
312 0.1
313 0.09
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.1
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.08
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.13
333 0.21
334 0.24
335 0.28
336 0.29
337 0.31
338 0.31
339 0.34
340 0.31
341 0.25
342 0.23
343 0.21
344 0.2
345 0.19
346 0.17
347 0.14
348 0.11
349 0.1
350 0.09
351 0.07
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.12
369 0.14
370 0.15
371 0.19
372 0.19
373 0.21
374 0.24
375 0.25
376 0.25
377 0.26
378 0.27
379 0.23
380 0.26
381 0.26
382 0.23
383 0.24
384 0.32
385 0.31
386 0.31
387 0.3
388 0.33
389 0.32
390 0.33
391 0.31
392 0.22
393 0.2
394 0.19
395 0.17
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.09
400 0.08
401 0.1
402 0.1
403 0.11
404 0.12
405 0.11
406 0.14
407 0.13
408 0.13
409 0.14
410 0.18
411 0.2
412 0.18
413 0.2
414 0.17
415 0.19
416 0.19
417 0.18
418 0.15
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.09
424 0.08
425 0.07
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.06
435 0.07
436 0.06
437 0.07
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.07
460 0.06
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.1
465 0.18
466 0.22
467 0.2
468 0.25
469 0.27
470 0.35
471 0.37
472 0.37
473 0.29
474 0.26
475 0.28
476 0.23
477 0.22
478 0.14
479 0.12
480 0.12
481 0.12
482 0.12
483 0.09
484 0.09
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.08
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.08
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.09
499 0.09
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.1
505 0.09
506 0.09
507 0.14
508 0.17
509 0.18
510 0.19
511 0.19
512 0.19
513 0.19
514 0.19
515 0.14
516 0.12
517 0.1
518 0.09
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.05
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.05
527 0.06
528 0.07
529 0.08
530 0.08
531 0.1
532 0.1
533 0.15
534 0.22
535 0.24
536 0.3
537 0.37
538 0.38
539 0.39
540 0.4
541 0.41
542 0.39
543 0.41
544 0.4
545 0.41
546 0.41
547 0.41
548 0.41
549 0.37
550 0.33
551 0.33
552 0.3
553 0.22
554 0.21
555 0.2
556 0.2
557 0.18
558 0.17
559 0.16
560 0.15
561 0.14
562 0.15
563 0.18
564 0.19
565 0.2
566 0.21
567 0.19
568 0.17
569 0.17
570 0.17
571 0.14
572 0.13
573 0.12
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.09
578 0.09
579 0.11
580 0.11
581 0.13
582 0.14
583 0.14
584 0.16
585 0.18
586 0.18
587 0.19
588 0.17
589 0.21
590 0.26
591 0.33
592 0.35
593 0.36
594 0.36
595 0.34
596 0.34
597 0.29
598 0.23
599 0.2
600 0.16
601 0.14
602 0.17
603 0.17
604 0.17
605 0.17
606 0.16
607 0.12
608 0.12
609 0.12
610 0.07
611 0.09
612 0.08
613 0.1
614 0.11
615 0.11
616 0.12
617 0.12
618 0.12
619 0.11
620 0.11
621 0.09
622 0.09
623 0.08
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.07
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.08
643 0.09
644 0.14
645 0.16
646 0.19
647 0.19
648 0.21
649 0.21
650 0.23
651 0.22
652 0.22
653 0.27
654 0.3
655 0.39
656 0.43
657 0.44
658 0.47
659 0.49
660 0.51
661 0.53
662 0.54
663 0.55
664 0.6
665 0.69
666 0.75
667 0.82
668 0.87
669 0.89
670 0.92
671 0.93
672 0.93
673 0.94
674 0.94
675 0.94
676 0.92
677 0.92
678 0.92
679 0.9
680 0.86
681 0.79
682 0.76
683 0.7
684 0.67
685 0.57
686 0.47
687 0.4
688 0.34
689 0.33
690 0.28
691 0.23
692 0.17
693 0.18
694 0.17
695 0.16
696 0.16
697 0.13
698 0.11
699 0.12
700 0.13
701 0.11
702 0.12
703 0.15
704 0.15
705 0.21
706 0.24
707 0.24
708 0.24
709 0.27
710 0.3
711 0.29
712 0.29
713 0.22
714 0.24
715 0.26
716 0.25
717 0.24
718 0.23
719 0.23
720 0.25
721 0.25
722 0.21
723 0.18
724 0.18
725 0.16
726 0.15
727 0.13
728 0.1
729 0.09
730 0.13
731 0.14
732 0.13
733 0.12
734 0.1
735 0.1
736 0.11
737 0.12
738 0.08
739 0.07
740 0.07
741 0.09
742 0.12
743 0.12
744 0.13
745 0.12
746 0.12
747 0.13
748 0.15
749 0.15
750 0.12
751 0.12
752 0.11
753 0.12
754 0.12
755 0.11
756 0.1
757 0.09
758 0.1
759 0.1
760 0.11
761 0.13
762 0.13
763 0.15
764 0.17
765 0.17
766 0.19
767 0.22
768 0.23
769 0.21
770 0.22
771 0.24
772 0.23
773 0.26
774 0.25
775 0.27
776 0.26
777 0.26
778 0.26
779 0.23
780 0.23
781 0.23
782 0.23
783 0.2
784 0.2
785 0.2
786 0.21
787 0.19
788 0.18
789 0.17
790 0.16
791 0.21
792 0.24
793 0.3
794 0.36
795 0.4
796 0.42
797 0.45
798 0.52
799 0.55
800 0.6
801 0.62
802 0.6
803 0.64
804 0.66
805 0.69
806 0.67
807 0.64
808 0.61
809 0.58
810 0.58
811 0.52
812 0.52
813 0.47
814 0.49
815 0.5
816 0.49
817 0.47
818 0.44
819 0.47
820 0.43
821 0.48
822 0.43
823 0.37
824 0.33
825 0.29
826 0.31
827 0.3
828 0.37
829 0.34
830 0.33
831 0.39
832 0.41
833 0.42
834 0.44
835 0.49
836 0.42
837 0.4
838 0.45
839 0.45
840 0.47
841 0.46
842 0.47
843 0.42
844 0.44
845 0.5
846 0.48
847 0.46
848 0.45
849 0.46
850 0.41
851 0.42
852 0.4
853 0.36
854 0.33
855 0.35
856 0.32
857 0.33
858 0.32
859 0.3
860 0.3
861 0.32
862 0.33
863 0.32
864 0.36
865 0.35
866 0.36
867 0.38
868 0.4
869 0.42
870 0.4
871 0.37
872 0.36
873 0.38
874 0.4
875 0.48
876 0.52
877 0.54
878 0.55
879 0.56
880 0.54
881 0.55
882 0.54
883 0.46
884 0.39
885 0.3
886 0.27
887 0.24
888 0.25
889 0.27
890 0.25
891 0.26
892 0.28
893 0.34
894 0.36
895 0.41
896 0.38
897 0.33
898 0.37
899 0.42
900 0.46
901 0.47
902 0.49
903 0.42
904 0.42
905 0.42
906 0.39
907 0.38
908 0.39
909 0.36
910 0.36
911 0.36
912 0.36
913 0.36
914 0.39
915 0.35
916 0.29
917 0.31
918 0.27
919 0.28
920 0.3
921 0.31
922 0.26
923 0.23
924 0.24
925 0.23
926 0.24
927 0.26
928 0.25
929 0.23
930 0.25
931 0.25
932 0.26
933 0.27
934 0.31