Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QCF3

Protein Details
Accession W1QCF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1173-1206GTAKTGASRRTAKNRRREERKKARGKKGTIYEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1178-1199GASRRTAKNRRREERKKARGKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.833, nucl 12.5, cyto 11, mito_nucl 7.166, cyto_pero 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006849  Elp1  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
KEGG opa:HPODL_03895  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04762  IKI3  
Amino Acid Sequences MKNLRILNIGQVAPESRTYPDLEVVDSVFDVVSDSLTIVMGSEESQTLEVQQFMKTGQINILASLPVREFDKMVSFVHFADSCQLVVIFEQGDILSAVYDAASPDPDSTVVEIVGSIDSGIKCARWSPDEETLAVLTGENNLVLLTRTFEPIAEKYLNPNDVNASTQVSVGWGKKETQFKGKGAKQLERERLALKNAGLNIDSDNAILHDPTVAEVQHGHLSSYETYKCYISWRGDSQYLSLSTVEEIEPGHERRVIRVYSRDGELDSCSEAVDGQEEPLSWKPQGSLIASTRRRFEEEINEQVLELIFFERNGLRHGEFNTRLEENARVLSLDWSCNSEMLAFRLSDRILVWTTKNYHWYLKEEIYTAAGEEIQFMKFHPENPMRLMFGSNKRIEIVDMAYSMGLGPTCPPTDVGMVLVADGTECKITPLGMANVPPPVSLREVWIEENLVDVASARSNSVFALLSNNSVSFATVDLENIIKSSEPKLRSTVTKGAFAGPHDRPRQVCCAGDNMAAVLFDTARCSKIAIFDVSNTDEPLLASVVDAGPPKPVLMKPTVDFEHLAYETADGSVYIFDLGTFEASKITQFPQLCTDFWVTDVDGTRVCFGLSSTGKLYVNSLLACSGVTSFLVTESHLLYTTAKHQLKFVHLDSNIDQQPFSEDEDDERTRMIERGALLVTAIPSKASVVLQAPRGNLETIHPRIMILTEVRHFIKNRKYAEAFVACRTHRIALDILHDYDSELFFNNVEHFIKEIKRPDYIELFMSTLLEEDVVETKYKETEKSATSAFEQLRVSNYVKPRGKEKISRICEALLAVLLTPPYKSKYLQTIITAYACQHPPKTTQALELIGTFKNESEIEKTVQHLCFLLDVNMLYDEALGIYNVPLALVIAQQSQKDPKEYLPFLQKLHVQPELRKKFMIDSYLKKYEKALDWLVQISPEDSPDIDAEIVDFVIEHSLYTHALGLYRYKKDKFDAIMRAYADYLHENRDYADAALAYETLSQKQEALENYVLARKWQQAVTLAIHDKQLLTDTCTRLVSLLTDNHEYSAAAYLELKFLDNIEEALKLYCKNHQYEQAIMLCYQENKKQLVESVVDPALGEGFGVIAELLADCKGQINSQLSRLRELRSKKQEDPYAYYGEMGEADAPDNVSIAASETSTRESFFTRYTGKTQGTAKTGASRRTAKNRRREERKKARGKKGTIYEEEYLVNSIGRLVERLNQTEPEALRLIEGLVRRSMMAQAYEIQKNFVEVRELLKLHIQEIYNISEKDRERVDDNGMVYLVPEIPVPEIKSFPKRKLLDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.2
3 0.17
4 0.19
5 0.21
6 0.21
7 0.25
8 0.24
9 0.23
10 0.23
11 0.21
12 0.2
13 0.17
14 0.15
15 0.1
16 0.08
17 0.08
18 0.07
19 0.07
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.05
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.12
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.19
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.23
49 0.19
50 0.17
51 0.18
52 0.16
53 0.12
54 0.14
55 0.14
56 0.13
57 0.15
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.23
62 0.22
63 0.21
64 0.26
65 0.24
66 0.19
67 0.21
68 0.21
69 0.18
70 0.17
71 0.17
72 0.12
73 0.12
74 0.13
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.09
105 0.08
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.11
110 0.15
111 0.19
112 0.19
113 0.24
114 0.29
115 0.38
116 0.39
117 0.39
118 0.37
119 0.33
120 0.31
121 0.25
122 0.19
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.1
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.18
138 0.18
139 0.23
140 0.23
141 0.22
142 0.27
143 0.33
144 0.37
145 0.33
146 0.33
147 0.31
148 0.29
149 0.31
150 0.26
151 0.22
152 0.18
153 0.18
154 0.16
155 0.15
156 0.17
157 0.17
158 0.19
159 0.17
160 0.2
161 0.26
162 0.34
163 0.37
164 0.43
165 0.47
166 0.49
167 0.57
168 0.6
169 0.61
170 0.59
171 0.62
172 0.62
173 0.65
174 0.69
175 0.63
176 0.6
177 0.56
178 0.53
179 0.5
180 0.44
181 0.36
182 0.31
183 0.29
184 0.28
185 0.25
186 0.21
187 0.19
188 0.17
189 0.16
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.16
209 0.17
210 0.21
211 0.21
212 0.18
213 0.19
214 0.2
215 0.19
216 0.21
217 0.26
218 0.26
219 0.3
220 0.34
221 0.37
222 0.4
223 0.4
224 0.37
225 0.36
226 0.32
227 0.27
228 0.23
229 0.18
230 0.15
231 0.16
232 0.14
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.14
237 0.15
238 0.16
239 0.19
240 0.19
241 0.22
242 0.28
243 0.29
244 0.28
245 0.33
246 0.37
247 0.37
248 0.39
249 0.37
250 0.31
251 0.3
252 0.27
253 0.23
254 0.18
255 0.14
256 0.12
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.11
266 0.14
267 0.17
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.18
272 0.22
273 0.21
274 0.23
275 0.25
276 0.35
277 0.4
278 0.42
279 0.43
280 0.42
281 0.43
282 0.4
283 0.39
284 0.4
285 0.4
286 0.44
287 0.43
288 0.41
289 0.37
290 0.35
291 0.3
292 0.2
293 0.14
294 0.09
295 0.06
296 0.06
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.12
301 0.15
302 0.14
303 0.17
304 0.21
305 0.27
306 0.28
307 0.29
308 0.31
309 0.29
310 0.28
311 0.27
312 0.26
313 0.19
314 0.18
315 0.16
316 0.13
317 0.13
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.15
325 0.15
326 0.13
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.12
336 0.13
337 0.13
338 0.15
339 0.16
340 0.19
341 0.23
342 0.24
343 0.29
344 0.29
345 0.32
346 0.33
347 0.36
348 0.35
349 0.35
350 0.34
351 0.3
352 0.28
353 0.24
354 0.21
355 0.17
356 0.13
357 0.1
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.14
365 0.14
366 0.16
367 0.24
368 0.27
369 0.28
370 0.32
371 0.34
372 0.29
373 0.29
374 0.3
375 0.27
376 0.31
377 0.36
378 0.33
379 0.32
380 0.31
381 0.31
382 0.29
383 0.24
384 0.18
385 0.12
386 0.11
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.05
393 0.04
394 0.05
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.12
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.13
425 0.12
426 0.11
427 0.13
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.16
432 0.17
433 0.17
434 0.15
435 0.13
436 0.13
437 0.11
438 0.08
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.11
455 0.12
456 0.11
457 0.11
458 0.11
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.06
471 0.1
472 0.15
473 0.17
474 0.19
475 0.22
476 0.24
477 0.27
478 0.32
479 0.36
480 0.32
481 0.33
482 0.32
483 0.31
484 0.3
485 0.28
486 0.29
487 0.25
488 0.31
489 0.3
490 0.32
491 0.31
492 0.33
493 0.38
494 0.33
495 0.31
496 0.24
497 0.25
498 0.24
499 0.24
500 0.21
501 0.15
502 0.12
503 0.11
504 0.1
505 0.06
506 0.04
507 0.04
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.12
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.16
520 0.18
521 0.18
522 0.15
523 0.13
524 0.11
525 0.1
526 0.1
527 0.08
528 0.05
529 0.04
530 0.05
531 0.05
532 0.06
533 0.07
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.09
540 0.11
541 0.13
542 0.15
543 0.15
544 0.2
545 0.21
546 0.2
547 0.2
548 0.18
549 0.18
550 0.16
551 0.16
552 0.11
553 0.1
554 0.09
555 0.09
556 0.08
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.06
573 0.08
574 0.12
575 0.12
576 0.13
577 0.18
578 0.19
579 0.19
580 0.21
581 0.21
582 0.16
583 0.17
584 0.16
585 0.11
586 0.11
587 0.12
588 0.1
589 0.09
590 0.1
591 0.09
592 0.08
593 0.08
594 0.06
595 0.06
596 0.11
597 0.11
598 0.12
599 0.13
600 0.15
601 0.16
602 0.16
603 0.17
604 0.12
605 0.12
606 0.11
607 0.1
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.06
612 0.05
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.03
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.05
621 0.05
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.07
627 0.11
628 0.19
629 0.2
630 0.2
631 0.22
632 0.23
633 0.26
634 0.29
635 0.27
636 0.24
637 0.22
638 0.24
639 0.24
640 0.28
641 0.26
642 0.22
643 0.21
644 0.15
645 0.17
646 0.15
647 0.15
648 0.1
649 0.09
650 0.1
651 0.16
652 0.16
653 0.14
654 0.13
655 0.13
656 0.12
657 0.13
658 0.11
659 0.08
660 0.08
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.06
668 0.06
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.05
673 0.05
674 0.06
675 0.07
676 0.1
677 0.13
678 0.15
679 0.15
680 0.16
681 0.17
682 0.15
683 0.14
684 0.13
685 0.17
686 0.17
687 0.18
688 0.17
689 0.16
690 0.16
691 0.16
692 0.15
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.11
697 0.13
698 0.15
699 0.16
700 0.21
701 0.28
702 0.33
703 0.34
704 0.37
705 0.38
706 0.37
707 0.41
708 0.41
709 0.35
710 0.32
711 0.33
712 0.28
713 0.28
714 0.27
715 0.23
716 0.17
717 0.18
718 0.16
719 0.13
720 0.16
721 0.16
722 0.16
723 0.15
724 0.15
725 0.13
726 0.12
727 0.11
728 0.08
729 0.07
730 0.06
731 0.06
732 0.06
733 0.07
734 0.08
735 0.08
736 0.08
737 0.08
738 0.11
739 0.13
740 0.17
741 0.22
742 0.22
743 0.24
744 0.25
745 0.27
746 0.28
747 0.26
748 0.24
749 0.19
750 0.18
751 0.15
752 0.14
753 0.11
754 0.08
755 0.06
756 0.05
757 0.04
758 0.04
759 0.06
760 0.06
761 0.07
762 0.07
763 0.07
764 0.1
765 0.11
766 0.12
767 0.13
768 0.16
769 0.17
770 0.19
771 0.19
772 0.18
773 0.18
774 0.23
775 0.21
776 0.21
777 0.2
778 0.18
779 0.19
780 0.21
781 0.22
782 0.21
783 0.25
784 0.3
785 0.34
786 0.34
787 0.38
788 0.42
789 0.46
790 0.49
791 0.55
792 0.56
793 0.57
794 0.58
795 0.54
796 0.47
797 0.41
798 0.33
799 0.24
800 0.14
801 0.09
802 0.07
803 0.06
804 0.06
805 0.05
806 0.05
807 0.06
808 0.09
809 0.1
810 0.11
811 0.14
812 0.21
813 0.25
814 0.27
815 0.28
816 0.27
817 0.27
818 0.27
819 0.24
820 0.18
821 0.19
822 0.18
823 0.18
824 0.17
825 0.18
826 0.2
827 0.24
828 0.28
829 0.24
830 0.25
831 0.26
832 0.25
833 0.24
834 0.22
835 0.2
836 0.15
837 0.15
838 0.13
839 0.1
840 0.11
841 0.1
842 0.11
843 0.12
844 0.14
845 0.16
846 0.16
847 0.19
848 0.22
849 0.22
850 0.21
851 0.18
852 0.16
853 0.15
854 0.15
855 0.13
856 0.09
857 0.08
858 0.09
859 0.08
860 0.08
861 0.07
862 0.06
863 0.05
864 0.04
865 0.04
866 0.04
867 0.03
868 0.03
869 0.04
870 0.04
871 0.04
872 0.03
873 0.03
874 0.04
875 0.04
876 0.05
877 0.07
878 0.09
879 0.09
880 0.12
881 0.17
882 0.18
883 0.2
884 0.21
885 0.23
886 0.29
887 0.31
888 0.33
889 0.37
890 0.38
891 0.36
892 0.38
893 0.39
894 0.34
895 0.36
896 0.38
897 0.32
898 0.35
899 0.46
900 0.49
901 0.46
902 0.43
903 0.4
904 0.39
905 0.4
906 0.41
907 0.36
908 0.36
909 0.42
910 0.51
911 0.5
912 0.46
913 0.45
914 0.43
915 0.4
916 0.39
917 0.35
918 0.28
919 0.29
920 0.3
921 0.29
922 0.23
923 0.2
924 0.16
925 0.12
926 0.1
927 0.09
928 0.07
929 0.09
930 0.08
931 0.09
932 0.08
933 0.07
934 0.07
935 0.07
936 0.06
937 0.05
938 0.04
939 0.03
940 0.05
941 0.05
942 0.04
943 0.05
944 0.06
945 0.06
946 0.07
947 0.08
948 0.07
949 0.08
950 0.09
951 0.15
952 0.2
953 0.26
954 0.31
955 0.33
956 0.35
957 0.37
958 0.43
959 0.41
960 0.43
961 0.46
962 0.44
963 0.46
964 0.43
965 0.41
966 0.35
967 0.3
968 0.24
969 0.19
970 0.17
971 0.17
972 0.17
973 0.16
974 0.17
975 0.18
976 0.17
977 0.13
978 0.13
979 0.09
980 0.09
981 0.09
982 0.08
983 0.07
984 0.09
985 0.1
986 0.1
987 0.11
988 0.11
989 0.11
990 0.12
991 0.16
992 0.14
993 0.19
994 0.18
995 0.18
996 0.19
997 0.22
998 0.21
999 0.19
1000 0.21
1001 0.18
1002 0.21
1003 0.21
1004 0.22
1005 0.22
1006 0.25
1007 0.26
1008 0.29
1009 0.28
1010 0.26
1011 0.26
1012 0.24
1013 0.2
1014 0.17
1015 0.19
1016 0.14
1017 0.17
1018 0.22
1019 0.23
1020 0.25
1021 0.25
1022 0.25
1023 0.21
1024 0.21
1025 0.18
1026 0.16
1027 0.18
1028 0.19
1029 0.22
1030 0.22
1031 0.22
1032 0.22
1033 0.2
1034 0.17
1035 0.18
1036 0.14
1037 0.11
1038 0.12
1039 0.12
1040 0.13
1041 0.13
1042 0.13
1043 0.08
1044 0.09
1045 0.1
1046 0.09
1047 0.1
1048 0.09
1049 0.1
1050 0.1
1051 0.11
1052 0.12
1053 0.12
1054 0.13
1055 0.18
1056 0.23
1057 0.26
1058 0.31
1059 0.38
1060 0.4
1061 0.41
1062 0.45
1063 0.43
1064 0.39
1065 0.35
1066 0.32
1067 0.25
1068 0.25
1069 0.26
1070 0.25
1071 0.26
1072 0.26
1073 0.27
1074 0.27
1075 0.28
1076 0.29
1077 0.28
1078 0.24
1079 0.25
1080 0.23
1081 0.22
1082 0.2
1083 0.18
1084 0.14
1085 0.11
1086 0.09
1087 0.04
1088 0.03
1089 0.03
1090 0.03
1091 0.03
1092 0.02
1093 0.03
1094 0.03
1095 0.04
1096 0.04
1097 0.04
1098 0.04
1099 0.07
1100 0.08
1101 0.08
1102 0.14
1103 0.19
1104 0.21
1105 0.29
1106 0.35
1107 0.33
1108 0.39
1109 0.41
1110 0.4
1111 0.42
1112 0.48
1113 0.51
1114 0.56
1115 0.62
1116 0.64
1117 0.7
1118 0.74
1119 0.73
1120 0.73
1121 0.66
1122 0.6
1123 0.53
1124 0.46
1125 0.36
1126 0.29
1127 0.23
1128 0.15
1129 0.12
1130 0.08
1131 0.08
1132 0.08
1133 0.08
1134 0.08
1135 0.08
1136 0.07
1137 0.06
1138 0.06
1139 0.07
1140 0.07
1141 0.07
1142 0.08
1143 0.09
1144 0.13
1145 0.14
1146 0.15
1147 0.14
1148 0.16
1149 0.18
1150 0.19
1151 0.23
1152 0.24
1153 0.27
1154 0.31
1155 0.37
1156 0.36
1157 0.39
1158 0.42
1159 0.43
1160 0.42
1161 0.41
1162 0.38
1163 0.4
1164 0.44
1165 0.45
1166 0.47
1167 0.49
1168 0.53
1169 0.62
1170 0.7
1171 0.7
1172 0.75
1173 0.81
1174 0.84
1175 0.88
1176 0.9
1177 0.91
1178 0.92
1179 0.94
1180 0.95
1181 0.94
1182 0.95
1183 0.93
1184 0.9
1185 0.88
1186 0.87
1187 0.85
1188 0.79
1189 0.74
1190 0.65
1191 0.57
1192 0.51
1193 0.42
1194 0.33
1195 0.24
1196 0.19
1197 0.12
1198 0.11
1199 0.11
1200 0.1
1201 0.11
1202 0.11
1203 0.17
1204 0.22
1205 0.25
1206 0.27
1207 0.28
1208 0.29
1209 0.34
1210 0.33
1211 0.31
1212 0.28
1213 0.24
1214 0.21
1215 0.19
1216 0.18
1217 0.15
1218 0.17
1219 0.16
1220 0.16
1221 0.16
1222 0.16
1223 0.17
1224 0.19
1225 0.19
1226 0.18
1227 0.17
1228 0.21
1229 0.27
1230 0.32
1231 0.31
1232 0.3
1233 0.28
1234 0.3
1235 0.29
1236 0.25
1237 0.24
1238 0.19
1239 0.23
1240 0.28
1241 0.28
1242 0.27
1243 0.31
1244 0.3
1245 0.26
1246 0.31
1247 0.27
1248 0.23
1249 0.26
1250 0.29
1251 0.3
1252 0.29
1253 0.3
1254 0.31
1255 0.32
1256 0.34
1257 0.35
1258 0.34
1259 0.31
1260 0.34
1261 0.39
1262 0.37
1263 0.37
1264 0.33
1265 0.3
1266 0.26
1267 0.23
1268 0.2
1269 0.15
1270 0.1
1271 0.09
1272 0.08
1273 0.1
1274 0.14
1275 0.17
1276 0.18
1277 0.21
1278 0.27
1279 0.37
1280 0.44
1281 0.48
1282 0.55