Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1Q8G8

Protein Details
Accession W1Q8G8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-320AELTRRCKKTREAEVSKLKRLEHydrophilic
344-371NADEQRKLEKKQLERKQRRQMGKQKIRQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
330-371AKKLEDQKKQKAGLNADEQRKLEKKQLERKQRRQMGKQKIRQ
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10, nucl 5, E.R. 4, extr 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG opa:HPODL_02958  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MFSLAIFALVGTCFAEQESKSFSEYSWPELAEMSLLERLKLYPWKLEMISVGFIAAYVLTFFIGSKYNDKLVNNFLKGNLDLLKEQFSQVGVTRSKLLAKDDSEHYAFYATGRLNIESLTAKFKLQPRQNVFVWFLELVFDFFTGTVAPPQDVVDLTFQIDSQASSNYDDFIWAIVSKDNMNQLRKDNYFLSLTKTSESNKLPVEFVFMNEVPEMNEILHHKKFNAVLEKCKAILKFVAVTDQSSEKPETVSDTTPSKKIVVQLRIPKSSTELEAAHELLKFLLNDYIDYVVSKASFRAELTRRCKKTREAEVSKLKRLEEDLKKEQLAAKKLEDQKKQKAGLNADEQRKLEKKQLERKQRRQMGKQKIRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.11
3 0.1
4 0.13
5 0.18
6 0.18
7 0.2
8 0.21
9 0.2
10 0.25
11 0.27
12 0.3
13 0.28
14 0.27
15 0.25
16 0.25
17 0.25
18 0.17
19 0.16
20 0.12
21 0.14
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.18
27 0.24
28 0.24
29 0.25
30 0.27
31 0.32
32 0.31
33 0.32
34 0.3
35 0.26
36 0.25
37 0.19
38 0.17
39 0.12
40 0.11
41 0.1
42 0.07
43 0.05
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.06
50 0.09
51 0.11
52 0.15
53 0.17
54 0.21
55 0.25
56 0.26
57 0.28
58 0.33
59 0.39
60 0.38
61 0.36
62 0.33
63 0.32
64 0.32
65 0.31
66 0.25
67 0.2
68 0.19
69 0.19
70 0.22
71 0.2
72 0.2
73 0.18
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.21
78 0.18
79 0.18
80 0.2
81 0.21
82 0.23
83 0.23
84 0.25
85 0.23
86 0.24
87 0.27
88 0.28
89 0.31
90 0.29
91 0.28
92 0.24
93 0.2
94 0.18
95 0.14
96 0.15
97 0.11
98 0.14
99 0.15
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.15
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.19
110 0.25
111 0.32
112 0.37
113 0.45
114 0.48
115 0.53
116 0.54
117 0.53
118 0.5
119 0.41
120 0.37
121 0.27
122 0.2
123 0.15
124 0.13
125 0.1
126 0.08
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.07
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.08
166 0.13
167 0.17
168 0.19
169 0.2
170 0.23
171 0.28
172 0.28
173 0.3
174 0.25
175 0.23
176 0.23
177 0.22
178 0.24
179 0.21
180 0.21
181 0.19
182 0.2
183 0.19
184 0.23
185 0.23
186 0.21
187 0.2
188 0.21
189 0.21
190 0.19
191 0.22
192 0.16
193 0.15
194 0.16
195 0.14
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.06
203 0.08
204 0.09
205 0.14
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.19
210 0.21
211 0.24
212 0.32
213 0.29
214 0.33
215 0.36
216 0.37
217 0.35
218 0.36
219 0.31
220 0.23
221 0.21
222 0.17
223 0.16
224 0.15
225 0.18
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.17
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.17
240 0.21
241 0.23
242 0.24
243 0.25
244 0.22
245 0.21
246 0.26
247 0.31
248 0.33
249 0.39
250 0.47
251 0.52
252 0.54
253 0.53
254 0.48
255 0.43
256 0.39
257 0.33
258 0.27
259 0.21
260 0.19
261 0.2
262 0.21
263 0.18
264 0.16
265 0.15
266 0.11
267 0.13
268 0.1
269 0.09
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.13
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.2
286 0.26
287 0.35
288 0.43
289 0.53
290 0.58
291 0.62
292 0.67
293 0.67
294 0.7
295 0.72
296 0.74
297 0.71
298 0.75
299 0.81
300 0.82
301 0.81
302 0.74
303 0.63
304 0.54
305 0.51
306 0.51
307 0.5
308 0.52
309 0.52
310 0.55
311 0.54
312 0.54
313 0.54
314 0.51
315 0.48
316 0.43
317 0.4
318 0.43
319 0.52
320 0.6
321 0.64
322 0.66
323 0.7
324 0.75
325 0.76
326 0.72
327 0.7
328 0.68
329 0.66
330 0.67
331 0.66
332 0.64
333 0.64
334 0.59
335 0.59
336 0.58
337 0.53
338 0.51
339 0.51
340 0.55
341 0.6
342 0.7
343 0.74
344 0.8
345 0.87
346 0.9
347 0.92
348 0.91
349 0.92
350 0.91
351 0.91