FuNGI

W1QJW0

Protein Details

Accession

W1QJW0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MIRRDRTKVKPYDKIEPKSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034432 Nup60
Gene Ontology	GO:0044615 C:nuclear pore nuclear basket GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore
KEGG	opa:HPODL_04877 -

Amino Acid Sequences

MIRRDRTKVKPYDKIEPKSSGSQGLMGRLRRIFSRSPQPSRDNTVADVSNLSNVSNLSVLSDANPNKTLSEFFKSKGDAPLNDIEVEGVLSLINKVHQQNQSQLETYRQSQTESQFLSSSGLKPNESSFFGNSTILRPASVKPTAKVDVPTYTPKEDKITRHPQPFPTTIKKRVVQYSSLPSPYRMRLETPVKPRVEKRQIRSRTANKVLSIIENPEALEEEDKVLDEQTTPGAKFKPNSSNAEQKQLPKENKVLKEEPEIIEIDSEDDVPEQKSEPKPEAVKPVQPVQIVQPQKPEENKLAADAPSTALPPITASQGAEPVEQYKAKIEELPQDTPVEPAVVSKPEAVPEELQKPKFTFRPAEAQPFAPNVPPKPSSLEIIEKFTFPEVETPSSPETPFLPLPQPTVIDHFSFPDVEMLDPEALNSINPEAVKLYSSVFTF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.77
3	0.73
4	0.68
5	0.65
6	0.62
7	0.56
8	0.46
9	0.44
10	0.39
11	0.41
12	0.42
13	0.37
14	0.4
15	0.38
16	0.38
17	0.36
18	0.39
19	0.37
20	0.4
21	0.49
22	0.53
23	0.6
24	0.66
25	0.69
26	0.7
27	0.72
28	0.69
29	0.6
30	0.53
31	0.49
32	0.42
33	0.36
34	0.33
35	0.25
36	0.23
37	0.21
38	0.18
39	0.14
40	0.13
41	0.13
42	0.11
43	0.11
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.09
48	0.17
49	0.17
50	0.2
51	0.23
52	0.22
53	0.22
54	0.23
55	0.25
56	0.22
57	0.28
58	0.27
59	0.26
60	0.31
61	0.33
62	0.34
63	0.39
64	0.4
65	0.33
66	0.36
67	0.39
68	0.35
69	0.33
70	0.3
71	0.22
72	0.17
73	0.16
74	0.11
75	0.06
76	0.04
77	0.04
78	0.05
79	0.05
80	0.06
81	0.1
82	0.12
83	0.19
84	0.25
85	0.27
86	0.34
87	0.4
88	0.42
89	0.4
90	0.39
91	0.37
92	0.35
93	0.35
94	0.33
95	0.28
96	0.28
97	0.3
98	0.32
99	0.33
100	0.31
101	0.3
102	0.24
103	0.24
104	0.24
105	0.21
106	0.21
107	0.21
108	0.21
109	0.2
110	0.21
111	0.23
112	0.23
113	0.25
114	0.24
115	0.19
116	0.2
117	0.21
118	0.21
119	0.19
120	0.18
121	0.18
122	0.16
123	0.15
124	0.15
125	0.15
126	0.19
127	0.25
128	0.25
129	0.23
130	0.28
131	0.3
132	0.3
133	0.31
134	0.27
135	0.24
136	0.25
137	0.3
138	0.28
139	0.3
140	0.29
141	0.28
142	0.31
143	0.34
144	0.35
145	0.39
146	0.46
147	0.5
148	0.57
149	0.6
150	0.59
151	0.6
152	0.6
153	0.57
154	0.58
155	0.57
156	0.57
157	0.59
158	0.57
159	0.56
160	0.58
161	0.54
162	0.47
163	0.45
164	0.45
165	0.42
166	0.42
167	0.38
168	0.33
169	0.34
170	0.33
171	0.32
172	0.25
173	0.23
174	0.27
175	0.33
176	0.38
177	0.42
178	0.47
179	0.45
180	0.47
181	0.49
182	0.52
183	0.56
184	0.56
185	0.56
186	0.59
187	0.63
188	0.67
189	0.73
190	0.69
191	0.68
192	0.69
193	0.64
194	0.54
195	0.5
196	0.44
197	0.36
198	0.3
199	0.22
200	0.15
201	0.13
202	0.12
203	0.1
204	0.09
205	0.08
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.1
220	0.12
221	0.13
222	0.15
223	0.19
224	0.26
225	0.28
226	0.34
227	0.37
228	0.45
229	0.45
230	0.5
231	0.48
232	0.44
233	0.47
234	0.49
235	0.47
236	0.41
237	0.47
238	0.47
239	0.5
240	0.52
241	0.47
242	0.41
243	0.44
244	0.44
245	0.37
246	0.32
247	0.27
248	0.21
249	0.18
250	0.16
251	0.12
252	0.08
253	0.08
254	0.06
255	0.05
256	0.06
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.13
261	0.16
262	0.19
263	0.22
264	0.25
265	0.29
266	0.31
267	0.39
268	0.37
269	0.38
270	0.38
271	0.41
272	0.4
273	0.37
274	0.35
275	0.3
276	0.34
277	0.33
278	0.31
279	0.32
280	0.3
281	0.35
282	0.36
283	0.36
284	0.31
285	0.32
286	0.31
287	0.27
288	0.27
289	0.23
290	0.21
291	0.18
292	0.15
293	0.12
294	0.12
295	0.1
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.13
305	0.14
306	0.13
307	0.12
308	0.12
309	0.15
310	0.15
311	0.15
312	0.15
313	0.16
314	0.17
315	0.19
316	0.19
317	0.25
318	0.3
319	0.32
320	0.29
321	0.29
322	0.29
323	0.27
324	0.25
325	0.17
326	0.12
327	0.11
328	0.12
329	0.12
330	0.13
331	0.14
332	0.14
333	0.16
334	0.18
335	0.18
336	0.18
337	0.21
338	0.29
339	0.34
340	0.35
341	0.35
342	0.36
343	0.39
344	0.41
345	0.42
346	0.39
347	0.36
348	0.44
349	0.46
350	0.53
351	0.49
352	0.47
353	0.44
354	0.42
355	0.39
356	0.34
357	0.34
358	0.28
359	0.32
360	0.31
361	0.3
362	0.34
363	0.34
364	0.33
365	0.33
366	0.39
367	0.35
368	0.4
369	0.39
370	0.34
371	0.33
372	0.31
373	0.27
374	0.19
375	0.22
376	0.2
377	0.23
378	0.24
379	0.27
380	0.3
381	0.32
382	0.31
383	0.27
384	0.24
385	0.25
386	0.26
387	0.25
388	0.27
389	0.26
390	0.29
391	0.3
392	0.3
393	0.26
394	0.3
395	0.29
396	0.26
397	0.25
398	0.24
399	0.24
400	0.22
401	0.21
402	0.19
403	0.17
404	0.15
405	0.15
406	0.16
407	0.15
408	0.14
409	0.14
410	0.12
411	0.11
412	0.11
413	0.11
414	0.1
415	0.11
416	0.11
417	0.12
418	0.13
419	0.13
420	0.14
421	0.13
422	0.15

W1QJW0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer