Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1Q6W4

Protein Details
Accession W1Q6W4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-301RKVHVDFSQSTKRKRNRDDFIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, nucl 14, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035542  CRIP  
IPR029000  Cyclophilin-like_dom_sf  
IPR002130  Cyclophilin-type_PPIase_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003755  F:peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000413  P:protein peptidyl-prolyl isomerization  
KEGG opa:HPODL_05333  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00160  Pro_isomerase  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50072  CSA_PPIASE_2  
PS50102  RRM  
CDD cd12235  RRM_PPIL4  
Amino Acid Sequences MSVLLETNAGNLVIDLFVDSAPNESRTFIALCLSKFYHYSPFVNVRKNVAVDSGNPCYPDPLAAPQPDKNINYTPSSHLSPEKLGQVLFTSKGDEFSPEFSICLGPVTDISGHVFGTIGEGFTTLEYINDCVLDEAGRPLKDIRILHTFVLDDPFSLLFEAPPSPYPTQKQIDSFRLLLDESALEDIKAESHALTLEVLGDLPSAKIQPSEKVLFICKLNPVTAEDDLRLIFQRFGEITSVEVIRDRRTGHSLCYGFIEFTNKSAVERAYHKMEGAIIDDRKVHVDFSQSTKRKRNRDDFI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.09
8 0.11
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.16
14 0.17
15 0.15
16 0.18
17 0.19
18 0.19
19 0.23
20 0.23
21 0.23
22 0.23
23 0.25
24 0.28
25 0.28
26 0.3
27 0.31
28 0.4
29 0.44
30 0.5
31 0.5
32 0.47
33 0.47
34 0.46
35 0.4
36 0.34
37 0.3
38 0.26
39 0.3
40 0.29
41 0.27
42 0.27
43 0.26
44 0.24
45 0.23
46 0.2
47 0.16
48 0.17
49 0.22
50 0.24
51 0.28
52 0.29
53 0.34
54 0.38
55 0.37
56 0.35
57 0.34
58 0.33
59 0.32
60 0.32
61 0.31
62 0.3
63 0.31
64 0.29
65 0.28
66 0.27
67 0.27
68 0.27
69 0.25
70 0.22
71 0.2
72 0.18
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.13
83 0.15
84 0.17
85 0.15
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.07
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.19
132 0.2
133 0.2
134 0.2
135 0.19
136 0.15
137 0.17
138 0.13
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.11
151 0.12
152 0.15
153 0.17
154 0.22
155 0.25
156 0.26
157 0.3
158 0.31
159 0.35
160 0.35
161 0.34
162 0.28
163 0.25
164 0.23
165 0.18
166 0.13
167 0.09
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.09
195 0.11
196 0.17
197 0.19
198 0.2
199 0.21
200 0.23
201 0.24
202 0.24
203 0.23
204 0.21
205 0.21
206 0.2
207 0.19
208 0.19
209 0.2
210 0.21
211 0.21
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.14
218 0.12
219 0.11
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.12
225 0.12
226 0.14
227 0.14
228 0.11
229 0.14
230 0.15
231 0.16
232 0.19
233 0.2
234 0.21
235 0.27
236 0.28
237 0.28
238 0.36
239 0.34
240 0.32
241 0.34
242 0.31
243 0.26
244 0.26
245 0.27
246 0.18
247 0.19
248 0.22
249 0.18
250 0.18
251 0.21
252 0.21
253 0.2
254 0.24
255 0.28
256 0.31
257 0.31
258 0.31
259 0.28
260 0.28
261 0.25
262 0.24
263 0.26
264 0.21
265 0.22
266 0.23
267 0.23
268 0.25
269 0.24
270 0.21
271 0.16
272 0.21
273 0.24
274 0.3
275 0.4
276 0.45
277 0.53
278 0.62
279 0.69
280 0.73
281 0.8