Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QJV3

Protein Details
Accession W1QJV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-155LPPSLAPKRERKPKKTAQRSAASSASGKTKKKSKAKAKTESKPSGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-151APKRERKPKKTAQRSAASSASGKTKKKSKAKAKTESK
184-193KKARKPVLSK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG opa:HPODL_02288  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSASEVESAQPVTEQSPSPVEETDPNKVFVGNLPYDTTEDQLKALTPELEVVSVELPTRTVTKKTDQTTVELQKGHGFIVYKSSEDAAKAIELIGGKTVGEREVYARAALPPSLAPKRERKPKKTAQRSAASSASGKTKKKSKAKAKTESKPSGSESDAKSDSKEASPADQSESTSAESAAPVKKARKPVLSKEEKQKKLSEGVPSKTTLFLGNLDKSVTSKDLKELFAEYEPVWIRVPRRELPKNLYLKLKARNVQIDNKGIAFVRFKSEEDQQKALKEFENKEYKNRKLNVTVAIDSAVEAAAQASSEGKENE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.18
4 0.19
5 0.21
6 0.21
7 0.21
8 0.25
9 0.29
10 0.35
11 0.34
12 0.34
13 0.33
14 0.32
15 0.3
16 0.28
17 0.3
18 0.23
19 0.23
20 0.23
21 0.23
22 0.26
23 0.26
24 0.23
25 0.19
26 0.17
27 0.16
28 0.15
29 0.15
30 0.14
31 0.15
32 0.14
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.12
37 0.11
38 0.11
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.07
43 0.07
44 0.08
45 0.12
46 0.13
47 0.16
48 0.2
49 0.27
50 0.35
51 0.38
52 0.44
53 0.42
54 0.45
55 0.5
56 0.52
57 0.48
58 0.41
59 0.39
60 0.35
61 0.34
62 0.3
63 0.22
64 0.18
65 0.14
66 0.19
67 0.19
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.14
100 0.18
101 0.19
102 0.22
103 0.31
104 0.39
105 0.49
106 0.58
107 0.6
108 0.66
109 0.74
110 0.81
111 0.83
112 0.84
113 0.81
114 0.79
115 0.76
116 0.7
117 0.61
118 0.51
119 0.41
120 0.33
121 0.33
122 0.3
123 0.28
124 0.28
125 0.35
126 0.43
127 0.51
128 0.59
129 0.62
130 0.68
131 0.76
132 0.83
133 0.84
134 0.83
135 0.84
136 0.8
137 0.72
138 0.63
139 0.56
140 0.48
141 0.4
142 0.36
143 0.27
144 0.26
145 0.25
146 0.23
147 0.21
148 0.19
149 0.19
150 0.15
151 0.16
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.13
160 0.14
161 0.13
162 0.11
163 0.11
164 0.08
165 0.07
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.14
170 0.17
171 0.21
172 0.28
173 0.33
174 0.39
175 0.43
176 0.5
177 0.58
178 0.63
179 0.66
180 0.69
181 0.75
182 0.72
183 0.7
184 0.64
185 0.56
186 0.53
187 0.5
188 0.49
189 0.45
190 0.44
191 0.43
192 0.4
193 0.38
194 0.33
195 0.3
196 0.21
197 0.16
198 0.15
199 0.17
200 0.17
201 0.17
202 0.16
203 0.16
204 0.15
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.13
209 0.18
210 0.21
211 0.22
212 0.22
213 0.22
214 0.22
215 0.21
216 0.22
217 0.17
218 0.19
219 0.19
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.2
224 0.24
225 0.3
226 0.3
227 0.39
228 0.45
229 0.5
230 0.55
231 0.61
232 0.62
233 0.6
234 0.62
235 0.58
236 0.57
237 0.59
238 0.6
239 0.56
240 0.55
241 0.6
242 0.57
243 0.61
244 0.6
245 0.57
246 0.5
247 0.45
248 0.41
249 0.33
250 0.3
251 0.24
252 0.2
253 0.21
254 0.21
255 0.22
256 0.25
257 0.32
258 0.4
259 0.43
260 0.47
261 0.44
262 0.47
263 0.48
264 0.47
265 0.44
266 0.42
267 0.4
268 0.44
269 0.52
270 0.49
271 0.57
272 0.64
273 0.67
274 0.68
275 0.69
276 0.66
277 0.62
278 0.66
279 0.64
280 0.6
281 0.54
282 0.45
283 0.41
284 0.34
285 0.28
286 0.23
287 0.14
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.07