Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QGB1

Protein Details
Accession W1QGB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-211PLYLTKKEIKRLRKNERQMKLKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-213KKEIKRLRKNERQMKLKEKQ
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036046  Acylphosphatase-like_dom_sf  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG opa:HPODL_00998  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MAKRPVDHEAVDQPPKREKSSTSESSELEKVGIHPLLRGTTKVPANFNPLKQSRKREGFVVNPYIDQKDIKYSRPKREFHLNEKGKYIERANEIRRRLEEEKREQEEQKALAAQGLTPDETTGEQYFLPVRPPAVEWWDQPLLSERRYGDELKVKYNDKDDLKNPITEYIQHPVPVMAPWEKHLSPPKPLYLTKKEIKRLRKNERQMKLKEKQDRMKLGLDPTPAPKVKLKNLMNVLTNDAIKNPTEVEMRVRQEIEERRRQHEAANMERHANKEDKATKMARKFEKDLQKGYFSAVFAVESLENNQHRYKVNINAKQLELKGMCLNLENGQTLIIVEGGERSVSKYKRLILHRIQWGVKCELVWEGQLVDLHFSKWTMYDFTDEDEILALLAKFRLENYWTQAKNIINSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.57
3 0.56
4 0.52
5 0.49
6 0.48
7 0.54
8 0.57
9 0.55
10 0.55
11 0.52
12 0.53
13 0.51
14 0.43
15 0.34
16 0.27
17 0.21
18 0.22
19 0.23
20 0.18
21 0.17
22 0.19
23 0.23
24 0.23
25 0.24
26 0.21
27 0.26
28 0.31
29 0.34
30 0.36
31 0.35
32 0.43
33 0.47
34 0.48
35 0.51
36 0.52
37 0.57
38 0.6
39 0.66
40 0.67
41 0.69
42 0.69
43 0.65
44 0.66
45 0.65
46 0.65
47 0.64
48 0.54
49 0.48
50 0.48
51 0.44
52 0.38
53 0.31
54 0.23
55 0.26
56 0.28
57 0.33
58 0.42
59 0.49
60 0.59
61 0.67
62 0.68
63 0.64
64 0.72
65 0.73
66 0.71
67 0.74
68 0.71
69 0.64
70 0.65
71 0.62
72 0.53
73 0.49
74 0.43
75 0.38
76 0.37
77 0.42
78 0.47
79 0.51
80 0.52
81 0.53
82 0.52
83 0.53
84 0.53
85 0.54
86 0.55
87 0.58
88 0.64
89 0.64
90 0.67
91 0.61
92 0.6
93 0.55
94 0.46
95 0.39
96 0.31
97 0.25
98 0.22
99 0.2
100 0.16
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.12
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.1
113 0.12
114 0.12
115 0.14
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.15
121 0.18
122 0.2
123 0.18
124 0.24
125 0.25
126 0.23
127 0.22
128 0.28
129 0.25
130 0.24
131 0.26
132 0.21
133 0.22
134 0.25
135 0.26
136 0.23
137 0.28
138 0.29
139 0.31
140 0.35
141 0.34
142 0.33
143 0.35
144 0.37
145 0.33
146 0.36
147 0.33
148 0.38
149 0.37
150 0.37
151 0.35
152 0.31
153 0.28
154 0.26
155 0.26
156 0.21
157 0.2
158 0.18
159 0.18
160 0.15
161 0.15
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.12
167 0.16
168 0.16
169 0.2
170 0.27
171 0.27
172 0.31
173 0.33
174 0.34
175 0.34
176 0.37
177 0.41
178 0.4
179 0.45
180 0.45
181 0.49
182 0.54
183 0.57
184 0.64
185 0.67
186 0.71
187 0.74
188 0.78
189 0.82
190 0.83
191 0.84
192 0.83
193 0.79
194 0.78
195 0.75
196 0.73
197 0.72
198 0.7
199 0.69
200 0.67
201 0.65
202 0.59
203 0.55
204 0.49
205 0.43
206 0.38
207 0.32
208 0.27
209 0.24
210 0.26
211 0.23
212 0.23
213 0.24
214 0.26
215 0.29
216 0.38
217 0.37
218 0.38
219 0.43
220 0.44
221 0.42
222 0.39
223 0.36
224 0.27
225 0.26
226 0.19
227 0.15
228 0.13
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.15
236 0.2
237 0.22
238 0.23
239 0.23
240 0.21
241 0.27
242 0.35
243 0.38
244 0.41
245 0.43
246 0.45
247 0.49
248 0.49
249 0.45
250 0.42
251 0.41
252 0.4
253 0.43
254 0.4
255 0.4
256 0.41
257 0.39
258 0.37
259 0.32
260 0.25
261 0.27
262 0.31
263 0.3
264 0.34
265 0.38
266 0.42
267 0.47
268 0.55
269 0.53
270 0.54
271 0.56
272 0.59
273 0.64
274 0.61
275 0.61
276 0.56
277 0.52
278 0.46
279 0.44
280 0.38
281 0.27
282 0.23
283 0.17
284 0.14
285 0.11
286 0.12
287 0.1
288 0.08
289 0.1
290 0.15
291 0.16
292 0.19
293 0.2
294 0.22
295 0.23
296 0.26
297 0.29
298 0.33
299 0.42
300 0.46
301 0.51
302 0.51
303 0.52
304 0.53
305 0.49
306 0.45
307 0.35
308 0.31
309 0.27
310 0.23
311 0.22
312 0.18
313 0.19
314 0.16
315 0.17
316 0.15
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.07
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.09
330 0.17
331 0.18
332 0.23
333 0.27
334 0.33
335 0.41
336 0.47
337 0.53
338 0.54
339 0.62
340 0.66
341 0.68
342 0.67
343 0.63
344 0.61
345 0.55
346 0.47
347 0.38
348 0.3
349 0.26
350 0.22
351 0.19
352 0.15
353 0.12
354 0.13
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.13
363 0.13
364 0.15
365 0.14
366 0.15
367 0.18
368 0.18
369 0.21
370 0.23
371 0.22
372 0.19
373 0.17
374 0.16
375 0.12
376 0.12
377 0.09
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.14
384 0.15
385 0.2
386 0.26
387 0.35
388 0.35
389 0.37
390 0.42
391 0.41