Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QCA3

Protein Details
Accession W1QCA3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-62QQSDSWTKRPRRALLPREVELHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
KEGG opa:HPODL_01438  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MEEPPHKRKRSVSDDEGYEPSLAASSELPGRPLPEVPSGAYQQSDSWTKRPRRALLPREVELAKNICAEIGKIGEYPQQLSLDLENVSNSIAQEIDTDDFLRNSLLEFLLALTVEQPQKVFIVGALVQLTNFKNPKAGQYVLEYLHSQVQSLFEHIKVASDDVLESSECGVITRLKLILRLVAVLSPMMVSDDPITKTYEQLLELAVEIQEKSAQRVAVAQLLYFNVLVSVPYHFAVQKDEGFWDRVLEIARKFKLVDVSEESQTTYRHFKSPNRPYEAKEPVKLILPALEAVDKELPFLVDLHQIIKSHEPEDVERHQFQQFNIPSSEYWASYDLQGNIDSLWKYPRYVLECFLPSVTGFDTVPPVDSYLSIILRDVTQDIVQNMEFNRVTVSRQILSLNVFFNEKLFSKPNSSIDKLTILNNLNSGVDLISSLENNEELDPQIKASMIQSATYVQQEFDQGYTSTWKMEQVVTEAVLDLMFHLPEAPTPSVYYQMLLADTCGRDWANVRRAPDSEDKVTFAKVLGTAIRFFYSNFKYLDFELRERFVLWMTAQLSNFGFDWQWTEWVDDLNTLDKLFYHPTIYLFRNIIGREIRLSTPRTIKATLPPEFHRFLRLSLWDKRQVINFDSKLFGTKLAESAYEANYAAEENIEAITEDAGNAEIYHIVDQYLFNNEEHPYHELCHSIYTNIQEGESLQQFNDLIVLLKEQIAKESSEHPGAEEYLIGNIDCYIVTLVIQSTCIIGSRSLSVVESGALELCGAKLRKVLGLPAAEGEHEDLENDQFPLLKAEEVAERQKWLIDGVLRLWNNEPRIGYLILERIKNKGFISATQLVDSFFANNESLTMISQVYASELFDRMVTSSASEAEAKDLLQTFYSKIIEHIDLLIEKLGDDREEMILGTVETEESADQDTELRWGLHGCFEIMRSKARKFASLTNFEQLGDKIEGGVRSEVARKYVAAIVNGICTSAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.7
3 0.64
4 0.55
5 0.45
6 0.35
7 0.27
8 0.19
9 0.15
10 0.11
11 0.09
12 0.1
13 0.16
14 0.16
15 0.18
16 0.18
17 0.2
18 0.21
19 0.23
20 0.25
21 0.24
22 0.26
23 0.26
24 0.3
25 0.31
26 0.3
27 0.28
28 0.26
29 0.21
30 0.25
31 0.3
32 0.29
33 0.34
34 0.43
35 0.5
36 0.58
37 0.66
38 0.68
39 0.71
40 0.78
41 0.8
42 0.81
43 0.81
44 0.74
45 0.71
46 0.65
47 0.55
48 0.5
49 0.43
50 0.34
51 0.27
52 0.25
53 0.2
54 0.19
55 0.18
56 0.15
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.14
61 0.18
62 0.19
63 0.2
64 0.21
65 0.2
66 0.2
67 0.21
68 0.2
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.11
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.13
108 0.08
109 0.11
110 0.11
111 0.13
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.16
116 0.17
117 0.2
118 0.21
119 0.19
120 0.24
121 0.24
122 0.3
123 0.33
124 0.34
125 0.29
126 0.33
127 0.37
128 0.33
129 0.34
130 0.28
131 0.24
132 0.27
133 0.25
134 0.2
135 0.16
136 0.18
137 0.16
138 0.19
139 0.19
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.17
144 0.15
145 0.15
146 0.13
147 0.11
148 0.12
149 0.1
150 0.11
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.13
161 0.15
162 0.14
163 0.16
164 0.17
165 0.18
166 0.16
167 0.17
168 0.15
169 0.13
170 0.13
171 0.11
172 0.1
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.18
183 0.16
184 0.18
185 0.2
186 0.2
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.1
198 0.1
199 0.13
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.17
204 0.18
205 0.19
206 0.19
207 0.16
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.13
212 0.11
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.14
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.21
230 0.2
231 0.17
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.17
236 0.18
237 0.23
238 0.24
239 0.24
240 0.24
241 0.25
242 0.29
243 0.27
244 0.29
245 0.28
246 0.31
247 0.31
248 0.31
249 0.3
250 0.25
251 0.24
252 0.22
253 0.22
254 0.21
255 0.25
256 0.29
257 0.37
258 0.46
259 0.56
260 0.63
261 0.65
262 0.65
263 0.64
264 0.69
265 0.7
266 0.64
267 0.56
268 0.49
269 0.41
270 0.42
271 0.38
272 0.29
273 0.21
274 0.17
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.1
279 0.11
280 0.14
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.14
292 0.14
293 0.15
294 0.19
295 0.19
296 0.16
297 0.18
298 0.18
299 0.18
300 0.24
301 0.28
302 0.28
303 0.28
304 0.3
305 0.32
306 0.32
307 0.31
308 0.34
309 0.31
310 0.29
311 0.29
312 0.27
313 0.24
314 0.26
315 0.27
316 0.18
317 0.17
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.18
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.14
328 0.12
329 0.1
330 0.13
331 0.12
332 0.13
333 0.15
334 0.19
335 0.21
336 0.22
337 0.23
338 0.24
339 0.25
340 0.25
341 0.23
342 0.19
343 0.14
344 0.14
345 0.12
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.14
374 0.13
375 0.11
376 0.13
377 0.12
378 0.13
379 0.14
380 0.16
381 0.13
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.15
386 0.16
387 0.13
388 0.11
389 0.12
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.1
394 0.12
395 0.14
396 0.15
397 0.18
398 0.22
399 0.27
400 0.31
401 0.32
402 0.31
403 0.29
404 0.3
405 0.28
406 0.26
407 0.24
408 0.2
409 0.18
410 0.18
411 0.17
412 0.14
413 0.12
414 0.11
415 0.06
416 0.05
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.12
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.08
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.04
468 0.04
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.04
474 0.08
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.1
494 0.16
495 0.22
496 0.24
497 0.25
498 0.26
499 0.27
500 0.31
501 0.35
502 0.32
503 0.28
504 0.26
505 0.27
506 0.25
507 0.25
508 0.21
509 0.15
510 0.11
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.09
517 0.1
518 0.09
519 0.09
520 0.14
521 0.15
522 0.17
523 0.17
524 0.18
525 0.18
526 0.19
527 0.25
528 0.22
529 0.22
530 0.21
531 0.22
532 0.21
533 0.21
534 0.2
535 0.14
536 0.12
537 0.1
538 0.12
539 0.12
540 0.14
541 0.14
542 0.15
543 0.14
544 0.14
545 0.14
546 0.11
547 0.09
548 0.06
549 0.09
550 0.08
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.11
556 0.11
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.08
562 0.08
563 0.07
564 0.09
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.13
570 0.17
571 0.19
572 0.19
573 0.18
574 0.18
575 0.2
576 0.2
577 0.21
578 0.18
579 0.17
580 0.16
581 0.18
582 0.18
583 0.19
584 0.21
585 0.22
586 0.26
587 0.28
588 0.3
589 0.3
590 0.3
591 0.33
592 0.38
593 0.38
594 0.37
595 0.38
596 0.4
597 0.4
598 0.39
599 0.36
600 0.29
601 0.26
602 0.26
603 0.27
604 0.28
605 0.33
606 0.38
607 0.41
608 0.41
609 0.42
610 0.43
611 0.41
612 0.38
613 0.39
614 0.35
615 0.29
616 0.29
617 0.27
618 0.25
619 0.23
620 0.21
621 0.14
622 0.13
623 0.13
624 0.13
625 0.13
626 0.11
627 0.13
628 0.13
629 0.12
630 0.12
631 0.1
632 0.09
633 0.09
634 0.08
635 0.06
636 0.05
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.04
650 0.05
651 0.05
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.07
657 0.07
658 0.11
659 0.12
660 0.11
661 0.13
662 0.14
663 0.14
664 0.16
665 0.18
666 0.15
667 0.15
668 0.16
669 0.15
670 0.15
671 0.18
672 0.16
673 0.14
674 0.15
675 0.16
676 0.18
677 0.17
678 0.16
679 0.13
680 0.13
681 0.16
682 0.16
683 0.15
684 0.11
685 0.12
686 0.12
687 0.12
688 0.12
689 0.08
690 0.06
691 0.06
692 0.07
693 0.06
694 0.08
695 0.1
696 0.1
697 0.12
698 0.12
699 0.13
700 0.14
701 0.17
702 0.19
703 0.2
704 0.2
705 0.18
706 0.18
707 0.18
708 0.17
709 0.13
710 0.1
711 0.09
712 0.09
713 0.08
714 0.07
715 0.06
716 0.06
717 0.05
718 0.06
719 0.05
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.06
724 0.06
725 0.07
726 0.06
727 0.06
728 0.06
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.08
733 0.09
734 0.1
735 0.1
736 0.1
737 0.1
738 0.09
739 0.09
740 0.08
741 0.07
742 0.07
743 0.06
744 0.06
745 0.05
746 0.05
747 0.11
748 0.11
749 0.11
750 0.13
751 0.14
752 0.17
753 0.17
754 0.2
755 0.19
756 0.2
757 0.2
758 0.19
759 0.19
760 0.16
761 0.16
762 0.15
763 0.11
764 0.09
765 0.09
766 0.08
767 0.09
768 0.1
769 0.1
770 0.09
771 0.08
772 0.09
773 0.12
774 0.11
775 0.1
776 0.1
777 0.11
778 0.15
779 0.17
780 0.22
781 0.2
782 0.21
783 0.21
784 0.22
785 0.2
786 0.18
787 0.17
788 0.15
789 0.15
790 0.17
791 0.25
792 0.24
793 0.25
794 0.28
795 0.3
796 0.29
797 0.3
798 0.28
799 0.23
800 0.26
801 0.25
802 0.22
803 0.2
804 0.25
805 0.25
806 0.29
807 0.27
808 0.28
809 0.3
810 0.32
811 0.3
812 0.29
813 0.27
814 0.25
815 0.33
816 0.35
817 0.34
818 0.32
819 0.32
820 0.26
821 0.25
822 0.23
823 0.16
824 0.1
825 0.11
826 0.1
827 0.09
828 0.09
829 0.09
830 0.09
831 0.09
832 0.1
833 0.08
834 0.08
835 0.08
836 0.08
837 0.08
838 0.08
839 0.09
840 0.09
841 0.1
842 0.1
843 0.1
844 0.11
845 0.1
846 0.11
847 0.1
848 0.1
849 0.1
850 0.1
851 0.12
852 0.13
853 0.12
854 0.13
855 0.13
856 0.12
857 0.14
858 0.15
859 0.14
860 0.14
861 0.15
862 0.14
863 0.18
864 0.19
865 0.17
866 0.17
867 0.2
868 0.2
869 0.2
870 0.19
871 0.17
872 0.16
873 0.17
874 0.17
875 0.12
876 0.11
877 0.12
878 0.12
879 0.1
880 0.1
881 0.11
882 0.11
883 0.12
884 0.12
885 0.11
886 0.1
887 0.1
888 0.09
889 0.08
890 0.07
891 0.06
892 0.07
893 0.06
894 0.07
895 0.09
896 0.08
897 0.08
898 0.1
899 0.1
900 0.11
901 0.13
902 0.12
903 0.11
904 0.13
905 0.14
906 0.17
907 0.17
908 0.17
909 0.16
910 0.18
911 0.22
912 0.23
913 0.3
914 0.32
915 0.33
916 0.39
917 0.4
918 0.44
919 0.44
920 0.52
921 0.53
922 0.56
923 0.57
924 0.56
925 0.54
926 0.49
927 0.46
928 0.37
929 0.32
930 0.26
931 0.22
932 0.17
933 0.19
934 0.2
935 0.2
936 0.21
937 0.17
938 0.18
939 0.24
940 0.24
941 0.24
942 0.24
943 0.21
944 0.24
945 0.28
946 0.28
947 0.24
948 0.25
949 0.24
950 0.26
951 0.25