FuNGI

W1Q6T4

Protein Details

Accession

W1Q6T4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MSEPCERRKQLRDLNQKAWGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 9.833, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	opa:HPODL_02482 -
Pfam	View protein in Pfam PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MSEPCERRKQLRDLNQKAWGGELLVVDSPDTSLKSNMAVLKKLSSAITAETQSSLIDSIKRVSLEKYLDELIPATADGLLSLKKKDTTAAVEVLSVLHQRFSSRFTLKLALYFFRSVEDFREPEHLSVLGTLMRLYCEMYLVDLIRLDDSVDKSKLPRYLLKSDRPLLLAYISQLLSQHANNIKLLPIVSGFVKKFEDVLFCENELLGPSERLSLIKLFTKYSEHICKLTENTHREISSLVDQVNEISRKTGKVPESLESELKEKKDEFAKLEAYSEFAHEVFSIEKPSLAREAEPTAKITAISGLSESNRWESEEQRKFYEEVPDISEMVDPSLLLKRGPDVEEKKARKDELSTFIEQLDAATTAEEVDNKAREFWQQEMYTKSAESRLYRHAYSQNINSKAFARFLCINRNVFKALIQKIENKADTILKDHLTMSHIDYNMVRLYCEMANFNLVSGTKFLDILRVLVVSVGEGAGLDLLTLFFDYSRFTILYRPEYAESVNNILHLLQSVISRLHGDRQKAAQAFLSSLAVAEEKVQVDTAKPKIQFLDYMLKRALQNQAFFPALLEFEWDPESYSKIVEFFTHPESITYDEIPALVSFLKWLGERDPVLITVVVDSLVEEFQSGFELNDFRQNRKRMAIASYLAQLAIKRLITATLFRNIVKYAIFESVHGDPSNWFWAKMVCLFFELSKKDMPLELMLFDYHLLLQGEPPLDLNLRVVKCFESRGVKRSNSAAEAAKRISEISKAARQTPEPEQEDDEELDQEADELSDSEDTEDIGDSETEDESDEDDDIESELDENMINEQLEMSIQSEFDSMLAASLKTSSSANPRPRVRQPVGAIVRKEQTEDGANKFTFLTKSGNKIAARKIEVPDHVDFVAEQLTNAELWEQERDRIKDFVLSQHE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.82
3	0.76
4	0.65
5	0.57
6	0.46
7	0.36
8	0.3
9	0.23
10	0.16
11	0.15
12	0.15
13	0.13
14	0.12
15	0.12
16	0.11
17	0.12
18	0.12
19	0.12
20	0.13
21	0.14
22	0.19
23	0.24
24	0.26
25	0.28
26	0.29
27	0.3
28	0.3
29	0.31
30	0.27
31	0.23
32	0.2
33	0.2
34	0.22
35	0.21
36	0.21
37	0.19
38	0.19
39	0.17
40	0.17
41	0.14
42	0.12
43	0.13
44	0.13
45	0.15
46	0.18
47	0.2
48	0.2
49	0.22
50	0.26
51	0.28
52	0.28
53	0.29
54	0.29
55	0.27
56	0.27
57	0.25
58	0.19
59	0.16
60	0.13
61	0.1
62	0.08
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.1
67	0.12
68	0.14
69	0.17
70	0.18
71	0.19
72	0.21
73	0.25
74	0.27
75	0.3
76	0.31
77	0.28
78	0.27
79	0.26
80	0.24
81	0.21
82	0.17
83	0.13
84	0.12
85	0.12
86	0.14
87	0.15
88	0.19
89	0.25
90	0.25
91	0.27
92	0.29
93	0.35
94	0.33
95	0.37
96	0.36
97	0.31
98	0.32
99	0.31
100	0.27
101	0.24
102	0.25
103	0.21
104	0.22
105	0.25
106	0.22
107	0.22
108	0.29
109	0.28
110	0.27
111	0.28
112	0.24
113	0.18
114	0.18
115	0.17
116	0.12
117	0.1
118	0.1
119	0.08
120	0.09
121	0.09
122	0.09
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.09
127	0.11
128	0.11
129	0.11
130	0.11
131	0.12
132	0.11
133	0.11
134	0.1
135	0.12
136	0.14
137	0.19
138	0.19
139	0.2
140	0.22
141	0.27
142	0.31
143	0.31
144	0.36
145	0.37
146	0.46
147	0.53
148	0.6
149	0.62
150	0.62
151	0.61
152	0.54
153	0.48
154	0.39
155	0.33
156	0.25
157	0.18
158	0.17
159	0.15
160	0.14
161	0.14
162	0.14
163	0.15
164	0.14
165	0.2
166	0.2
167	0.22
168	0.22
169	0.22
170	0.21
171	0.2
172	0.2
173	0.14
174	0.11
175	0.1
176	0.12
177	0.16
178	0.16
179	0.17
180	0.18
181	0.17
182	0.18
183	0.18
184	0.2
185	0.18
186	0.21
187	0.21
188	0.2
189	0.2
190	0.19
191	0.17
192	0.15
193	0.15
194	0.12
195	0.1
196	0.1
197	0.11
198	0.12
199	0.12
200	0.13
201	0.11
202	0.13
203	0.18
204	0.19
205	0.18
206	0.2
207	0.23
208	0.24
209	0.3
210	0.36
211	0.33
212	0.33
213	0.33
214	0.34
215	0.33
216	0.39
217	0.39
218	0.35
219	0.37
220	0.4
221	0.38
222	0.36
223	0.34
224	0.3
225	0.25
226	0.23
227	0.19
228	0.15
229	0.15
230	0.16
231	0.21
232	0.19
233	0.15
234	0.15
235	0.16
236	0.17
237	0.2
238	0.26
239	0.23
240	0.27
241	0.3
242	0.31
243	0.34
244	0.36
245	0.35
246	0.3
247	0.31
248	0.29
249	0.27
250	0.26
251	0.22
252	0.23
253	0.27
254	0.29
255	0.28
256	0.29
257	0.32
258	0.29
259	0.3
260	0.27
261	0.23
262	0.2
263	0.17
264	0.14
265	0.11
266	0.1
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.1
274	0.1
275	0.11
276	0.13
277	0.13
278	0.13
279	0.14
280	0.18
281	0.21
282	0.21
283	0.21
284	0.19
285	0.18
286	0.18
287	0.15
288	0.13
289	0.1
290	0.09
291	0.08
292	0.09
293	0.09
294	0.1
295	0.11
296	0.11
297	0.11
298	0.13
299	0.14
300	0.18
301	0.28
302	0.35
303	0.36
304	0.36
305	0.37
306	0.37
307	0.38
308	0.4
309	0.31
310	0.25
311	0.26
312	0.25
313	0.23
314	0.22
315	0.21
316	0.13
317	0.11
318	0.09
319	0.06
320	0.06
321	0.09
322	0.09
323	0.08
324	0.09
325	0.1
326	0.12
327	0.14
328	0.21
329	0.22
330	0.3
331	0.39
332	0.42
333	0.46
334	0.48
335	0.47
336	0.4
337	0.41
338	0.38
339	0.36
340	0.39
341	0.34
342	0.31
343	0.3
344	0.29
345	0.24
346	0.19
347	0.12
348	0.07
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.09
358	0.09
359	0.1
360	0.1
361	0.13
362	0.15
363	0.16
364	0.21
365	0.2
366	0.23
367	0.25
368	0.26
369	0.24
370	0.22
371	0.2
372	0.17
373	0.18
374	0.17
375	0.18
376	0.23
377	0.26
378	0.26
379	0.29
380	0.3
381	0.31
382	0.33
383	0.37
384	0.38
385	0.38
386	0.37
387	0.35
388	0.33
389	0.3
390	0.3
391	0.22
392	0.19
393	0.2
394	0.22
395	0.29
396	0.3
397	0.32
398	0.31
399	0.33
400	0.29
401	0.24
402	0.25
403	0.24
404	0.23
405	0.24
406	0.24
407	0.27
408	0.3
409	0.33
410	0.31
411	0.25
412	0.24
413	0.22
414	0.21
415	0.19
416	0.18
417	0.14
418	0.15
419	0.14
420	0.14
421	0.13
422	0.13
423	0.13
424	0.14
425	0.14
426	0.14
427	0.14
428	0.14
429	0.15
430	0.14
431	0.11
432	0.08
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.08
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.07
454	0.07
455	0.06
456	0.06
457	0.04
458	0.04
459	0.03
460	0.03
461	0.02
462	0.02
463	0.02
464	0.02
465	0.02
466	0.02
467	0.02
468	0.02
469	0.02
470	0.02
471	0.02
472	0.03
473	0.04
474	0.04
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.1
479	0.13
480	0.16
481	0.17
482	0.19
483	0.18
484	0.19
485	0.19
486	0.18
487	0.16
488	0.15
489	0.13
490	0.12
491	0.11
492	0.1
493	0.09
494	0.07
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.08
502	0.08
503	0.15
504	0.17
505	0.18
506	0.2
507	0.22
508	0.28
509	0.27
510	0.27
511	0.22
512	0.2
513	0.19
514	0.16
515	0.15
516	0.09
517	0.08
518	0.08
519	0.06
520	0.05
521	0.06
522	0.07
523	0.06
524	0.07
525	0.07
526	0.07
527	0.08
528	0.13
529	0.16
530	0.19
531	0.19
532	0.2
533	0.21
534	0.22
535	0.22
536	0.21
537	0.28
538	0.23
539	0.26
540	0.26
541	0.26
542	0.26
543	0.28
544	0.31
545	0.24
546	0.25
547	0.23
548	0.25
549	0.24
550	0.23
551	0.21
552	0.14
553	0.11
554	0.09
555	0.11
556	0.07
557	0.08
558	0.1
559	0.09
560	0.1
561	0.1
562	0.12
563	0.1
564	0.1
565	0.09
566	0.09
567	0.09
568	0.09
569	0.11
570	0.12
571	0.15
572	0.16
573	0.16
574	0.16
575	0.16
576	0.18
577	0.17
578	0.15
579	0.12
580	0.11
581	0.1
582	0.1
583	0.09
584	0.07
585	0.06
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.06
590	0.06
591	0.08
592	0.09
593	0.12
594	0.13
595	0.14
596	0.14
597	0.13
598	0.14
599	0.13
600	0.11
601	0.08
602	0.08
603	0.06
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.06
613	0.06
614	0.05
615	0.06
616	0.07
617	0.08
618	0.17
619	0.18
620	0.22
621	0.3
622	0.34
623	0.36
624	0.38
625	0.4
626	0.34
627	0.37
628	0.37
629	0.3
630	0.28
631	0.27
632	0.24
633	0.21
634	0.19
635	0.15
636	0.11
637	0.13
638	0.11
639	0.09
640	0.09
641	0.1
642	0.11
643	0.14
644	0.16
645	0.18
646	0.2
647	0.2
648	0.21
649	0.2
650	0.2
651	0.17
652	0.15
653	0.12
654	0.15
655	0.15
656	0.14
657	0.17
658	0.18
659	0.2
660	0.19
661	0.18
662	0.14
663	0.16
664	0.23
665	0.2
666	0.18
667	0.16
668	0.17
669	0.19
670	0.23
671	0.22
672	0.15
673	0.16
674	0.17
675	0.18
676	0.22
677	0.22
678	0.19
679	0.2
680	0.2
681	0.19
682	0.2
683	0.2
684	0.17
685	0.16
686	0.14
687	0.14
688	0.13
689	0.12
690	0.11
691	0.1
692	0.07
693	0.09
694	0.09
695	0.08
696	0.08
697	0.11
698	0.12
699	0.11
700	0.12
701	0.11
702	0.11
703	0.11
704	0.13
705	0.17
706	0.17
707	0.18
708	0.18
709	0.19
710	0.2
711	0.22
712	0.25
713	0.28
714	0.31
715	0.38
716	0.44
717	0.44
718	0.45
719	0.48
720	0.47
721	0.39
722	0.39
723	0.38
724	0.34
725	0.36
726	0.34
727	0.3
728	0.26
729	0.25
730	0.22
731	0.18
732	0.19
733	0.21
734	0.27
735	0.28
736	0.33
737	0.35
738	0.36
739	0.39
740	0.43
741	0.47
742	0.44
743	0.43
744	0.41
745	0.4
746	0.41
747	0.37
748	0.3
749	0.21
750	0.18
751	0.16
752	0.12
753	0.1
754	0.08
755	0.06
756	0.05
757	0.05
758	0.06
759	0.06
760	0.06
761	0.07
762	0.07
763	0.07
764	0.08
765	0.08
766	0.07
767	0.07
768	0.07
769	0.07
770	0.08
771	0.08
772	0.08
773	0.08
774	0.08
775	0.08
776	0.09
777	0.08
778	0.08
779	0.08
780	0.08
781	0.08
782	0.08
783	0.07
784	0.06
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.07
790	0.08
791	0.08
792	0.07
793	0.08
794	0.07
795	0.08
796	0.08
797	0.08
798	0.07
799	0.07
800	0.08
801	0.08
802	0.08
803	0.07
804	0.08
805	0.06
806	0.07
807	0.08
808	0.08
809	0.08
810	0.08
811	0.09
812	0.09
813	0.1
814	0.12
815	0.21
816	0.3
817	0.39
818	0.47
819	0.54
820	0.61
821	0.69
822	0.76
823	0.71
824	0.71
825	0.66
826	0.68
827	0.7
828	0.69
829	0.63
830	0.58
831	0.58
832	0.49
833	0.47
834	0.37
835	0.32
836	0.33
837	0.34
838	0.35
839	0.37
840	0.36
841	0.35
842	0.34
843	0.34
844	0.27
845	0.26
846	0.28
847	0.26
848	0.33
849	0.37
850	0.44
851	0.44
852	0.49
853	0.54
854	0.54
855	0.56
856	0.54
857	0.53
858	0.53
859	0.54
860	0.53
861	0.48
862	0.42
863	0.36
864	0.31
865	0.27
866	0.21
867	0.21
868	0.16
869	0.13
870	0.11
871	0.12
872	0.11
873	0.12
874	0.11
875	0.08
876	0.1
877	0.17
878	0.18
879	0.24
880	0.32
881	0.35
882	0.38
883	0.39
884	0.38
885	0.38
886	0.38

W1Q6T4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer