Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QCP6

Protein Details
Accession W1QCP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-410LCNSCGLRYKKTRARCLNSHCLRIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
215-234KPSKPVSKVSKPPRSRKPAK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 15, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG opa:HPODL_01599  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSTLAAELNHSRSHSDSTNTKSSAYYQMSRPRSEECTLIHDSQLKRSFAEMSDSFTLVSDSTSSPSAKRSRTAPSSPVPETPKLNFADLPLTPPSNSVVLASLSISTPISASQHTLAQSPATPPASASSSPRQLPLPLKPSTKLRSFESESCFYFPDTCYSFNLLGSAAPESNVRGCLLEQQNEEWRDFYSNKCKHENTELFKKYREYCTSMRLKPSKPVSKVSKPPRSRKPAKIAAFVESQYQKYNGLVDYPYSNNYTYQTTGYLKDVQMLTSSAKLYAQGPKQSYVAESTDNFKLPPMPSSMLMSTQHDHRDYARVGISKFINTSLDTPASPQTHLRTTANVPDEAAHAPAAAQYTGGSRKCISCHSAQSPCWRPSWSSSEGQLCNSCGLRYKKTRARCLNSHCLRIPAKGEWTLMKNKGKVLVNDHYAYRCLHCDGEVEVDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.34
4 0.39
5 0.47
6 0.46
7 0.44
8 0.4
9 0.41
10 0.44
11 0.43
12 0.4
13 0.4
14 0.49
15 0.53
16 0.55
17 0.54
18 0.49
19 0.49
20 0.47
21 0.43
22 0.36
23 0.37
24 0.39
25 0.38
26 0.37
27 0.38
28 0.37
29 0.42
30 0.47
31 0.41
32 0.36
33 0.36
34 0.36
35 0.31
36 0.37
37 0.28
38 0.27
39 0.28
40 0.28
41 0.26
42 0.23
43 0.22
44 0.15
45 0.15
46 0.11
47 0.09
48 0.11
49 0.13
50 0.14
51 0.15
52 0.22
53 0.28
54 0.3
55 0.32
56 0.35
57 0.41
58 0.48
59 0.53
60 0.52
61 0.52
62 0.56
63 0.55
64 0.57
65 0.53
66 0.49
67 0.48
68 0.44
69 0.43
70 0.38
71 0.37
72 0.31
73 0.27
74 0.29
75 0.24
76 0.26
77 0.22
78 0.22
79 0.2
80 0.2
81 0.2
82 0.16
83 0.16
84 0.13
85 0.11
86 0.1
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.1
99 0.1
100 0.13
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.15
106 0.14
107 0.18
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.16
112 0.19
113 0.18
114 0.22
115 0.23
116 0.27
117 0.28
118 0.3
119 0.28
120 0.29
121 0.33
122 0.36
123 0.36
124 0.35
125 0.37
126 0.38
127 0.45
128 0.46
129 0.48
130 0.43
131 0.41
132 0.43
133 0.46
134 0.49
135 0.48
136 0.46
137 0.41
138 0.39
139 0.36
140 0.29
141 0.26
142 0.2
143 0.19
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.2
148 0.2
149 0.18
150 0.18
151 0.14
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.08
164 0.15
165 0.18
166 0.21
167 0.21
168 0.23
169 0.29
170 0.3
171 0.3
172 0.22
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.22
177 0.26
178 0.3
179 0.34
180 0.39
181 0.39
182 0.38
183 0.47
184 0.5
185 0.46
186 0.52
187 0.53
188 0.49
189 0.5
190 0.51
191 0.45
192 0.44
193 0.42
194 0.37
195 0.33
196 0.4
197 0.46
198 0.45
199 0.5
200 0.49
201 0.46
202 0.48
203 0.55
204 0.54
205 0.49
206 0.54
207 0.54
208 0.56
209 0.64
210 0.67
211 0.69
212 0.69
213 0.75
214 0.77
215 0.79
216 0.79
217 0.79
218 0.78
219 0.77
220 0.73
221 0.71
222 0.63
223 0.56
224 0.49
225 0.41
226 0.36
227 0.28
228 0.25
229 0.18
230 0.18
231 0.15
232 0.13
233 0.15
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.17
252 0.19
253 0.17
254 0.2
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.16
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.17
267 0.2
268 0.24
269 0.25
270 0.26
271 0.27
272 0.27
273 0.25
274 0.22
275 0.19
276 0.16
277 0.15
278 0.17
279 0.18
280 0.19
281 0.18
282 0.15
283 0.18
284 0.16
285 0.17
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.21
290 0.21
291 0.2
292 0.21
293 0.22
294 0.19
295 0.22
296 0.25
297 0.23
298 0.23
299 0.22
300 0.26
301 0.24
302 0.26
303 0.26
304 0.25
305 0.24
306 0.28
307 0.28
308 0.23
309 0.23
310 0.21
311 0.18
312 0.17
313 0.18
314 0.17
315 0.17
316 0.15
317 0.17
318 0.21
319 0.21
320 0.21
321 0.22
322 0.23
323 0.25
324 0.29
325 0.28
326 0.26
327 0.28
328 0.34
329 0.34
330 0.3
331 0.27
332 0.24
333 0.25
334 0.22
335 0.2
336 0.12
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.1
345 0.17
346 0.18
347 0.19
348 0.19
349 0.22
350 0.24
351 0.28
352 0.29
353 0.28
354 0.36
355 0.41
356 0.47
357 0.48
358 0.56
359 0.6
360 0.59
361 0.55
362 0.49
363 0.45
364 0.44
365 0.47
366 0.42
367 0.38
368 0.41
369 0.46
370 0.45
371 0.46
372 0.42
373 0.36
374 0.35
375 0.31
376 0.27
377 0.27
378 0.31
379 0.37
380 0.43
381 0.53
382 0.57
383 0.66
384 0.76
385 0.79
386 0.82
387 0.83
388 0.83
389 0.84
390 0.82
391 0.81
392 0.72
393 0.69
394 0.63
395 0.58
396 0.53
397 0.47
398 0.45
399 0.41
400 0.41
401 0.38
402 0.42
403 0.45
404 0.49
405 0.52
406 0.49
407 0.48
408 0.53
409 0.54
410 0.53
411 0.53
412 0.52
413 0.51
414 0.51
415 0.51
416 0.46
417 0.42
418 0.39
419 0.34
420 0.29
421 0.26
422 0.24
423 0.22
424 0.22
425 0.22