Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QFN5

Protein Details
Accession W1QFN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-164LERAIERKRRHKDEINEERKRQBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008409  SPF27  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG opa:HPODL_04340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05700  BCAS2  
Amino Acid Sequences MSSATESSASPHEEIVFDYLPYIDQEPSNDVLAVVDDLIQEELMNFNLHQLHPMLRNDSSDLDNESRSLPVTNEGIGGISLSSYSNLLNEYNEPDIDKMKTALSYTQLRYRTLLLNSQESAQEINKNKWMTHLDNLKQHQEVLERAIERKRRHKDEINEERKRQCTDFEPMNEYLGTRWTEKMEELIDIGVEAALQELEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.17
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.12
8 0.13
9 0.14
10 0.11
11 0.11
12 0.13
13 0.16
14 0.17
15 0.18
16 0.16
17 0.14
18 0.13
19 0.13
20 0.11
21 0.08
22 0.06
23 0.05
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.05
28 0.05
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.06
33 0.08
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.12
38 0.15
39 0.19
40 0.21
41 0.22
42 0.21
43 0.22
44 0.22
45 0.23
46 0.21
47 0.18
48 0.19
49 0.17
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.13
54 0.13
55 0.12
56 0.09
57 0.1
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.03
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.12
91 0.16
92 0.17
93 0.22
94 0.24
95 0.24
96 0.24
97 0.25
98 0.25
99 0.22
100 0.25
101 0.21
102 0.22
103 0.22
104 0.22
105 0.2
106 0.17
107 0.17
108 0.13
109 0.17
110 0.17
111 0.19
112 0.24
113 0.25
114 0.24
115 0.27
116 0.31
117 0.29
118 0.33
119 0.39
120 0.38
121 0.45
122 0.48
123 0.47
124 0.42
125 0.38
126 0.33
127 0.27
128 0.24
129 0.19
130 0.2
131 0.18
132 0.21
133 0.27
134 0.32
135 0.36
136 0.45
137 0.52
138 0.56
139 0.63
140 0.69
141 0.72
142 0.77
143 0.82
144 0.83
145 0.82
146 0.8
147 0.78
148 0.73
149 0.68
150 0.58
151 0.51
152 0.45
153 0.43
154 0.46
155 0.43
156 0.44
157 0.4
158 0.41
159 0.37
160 0.32
161 0.25
162 0.22
163 0.2
164 0.16
165 0.17
166 0.18
167 0.19
168 0.2
169 0.22
170 0.19
171 0.18
172 0.17
173 0.15
174 0.13
175 0.11
176 0.11
177 0.07
178 0.05
179 0.04
180 0.04