Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1Q7W8

Protein Details
Accession W1Q7W8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-353DLTGMVKKRKQPGGKVVTKKTKTSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
335-353KKRKQPGGKVVTKKTKTSK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG opa:HPODL_03106  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MAEESSYSQELVKLLEKGAQAFAEKQYEKSVEYYSEACEKSNLLTGNDDPDLLFLYAKSLFENAVSKSEVLGGQNNQDEKAEETEDDNGMFQFNEQLAENEEDEEESEQELEQGQEEQSHEQEEEQGEESEEQTDFEVSWEILDLTRTLYEEKLSSLQDEQLKKPYLDSDKKDIKEISSPFVAIKKKLSEVYDLLGEISLETENFSQAAQDFTTLANLRTELYPFSSRLVSEAYYKLSLASEFNTGEAGSSATAVEAMEKSLKSIKERYELPDEERDESLLQEMEQRLDDLRKGDAAIQEEKKKIMMGILGESDGTEIKATPKTVPVNDLTGMVKKRKQPGGKVVTKKTKTSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.22
4 0.22
5 0.23
6 0.22
7 0.2
8 0.21
9 0.24
10 0.28
11 0.28
12 0.28
13 0.32
14 0.32
15 0.31
16 0.31
17 0.3
18 0.24
19 0.26
20 0.26
21 0.23
22 0.29
23 0.27
24 0.25
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.25
29 0.24
30 0.18
31 0.21
32 0.21
33 0.25
34 0.25
35 0.23
36 0.17
37 0.16
38 0.17
39 0.14
40 0.13
41 0.08
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.1
47 0.1
48 0.12
49 0.15
50 0.14
51 0.16
52 0.17
53 0.16
54 0.15
55 0.17
56 0.17
57 0.15
58 0.18
59 0.17
60 0.2
61 0.23
62 0.24
63 0.22
64 0.21
65 0.21
66 0.19
67 0.2
68 0.17
69 0.14
70 0.15
71 0.17
72 0.17
73 0.16
74 0.14
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.12
85 0.14
86 0.14
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.13
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.1
118 0.1
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.14
145 0.19
146 0.21
147 0.21
148 0.25
149 0.27
150 0.26
151 0.26
152 0.27
153 0.3
154 0.34
155 0.36
156 0.38
157 0.44
158 0.44
159 0.47
160 0.42
161 0.35
162 0.35
163 0.32
164 0.26
165 0.19
166 0.19
167 0.17
168 0.22
169 0.22
170 0.17
171 0.18
172 0.17
173 0.19
174 0.21
175 0.22
176 0.2
177 0.19
178 0.19
179 0.17
180 0.16
181 0.14
182 0.11
183 0.09
184 0.06
185 0.06
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.09
209 0.12
210 0.14
211 0.14
212 0.15
213 0.15
214 0.14
215 0.15
216 0.16
217 0.13
218 0.14
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.08
247 0.1
248 0.15
249 0.17
250 0.2
251 0.25
252 0.29
253 0.32
254 0.35
255 0.39
256 0.43
257 0.43
258 0.44
259 0.46
260 0.44
261 0.41
262 0.39
263 0.35
264 0.27
265 0.25
266 0.22
267 0.14
268 0.12
269 0.14
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.15
274 0.15
275 0.17
276 0.19
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.15
281 0.18
282 0.19
283 0.22
284 0.27
285 0.32
286 0.37
287 0.38
288 0.38
289 0.35
290 0.33
291 0.29
292 0.23
293 0.2
294 0.15
295 0.17
296 0.17
297 0.17
298 0.16
299 0.15
300 0.14
301 0.11
302 0.1
303 0.07
304 0.07
305 0.1
306 0.14
307 0.15
308 0.17
309 0.23
310 0.29
311 0.3
312 0.34
313 0.33
314 0.33
315 0.33
316 0.33
317 0.29
318 0.3
319 0.33
320 0.35
321 0.38
322 0.41
323 0.5
324 0.57
325 0.63
326 0.66
327 0.71
328 0.76
329 0.8
330 0.83
331 0.84
332 0.86
333 0.82