Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QCL9

Protein Details
Accession W1QCL9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-363PSRTIRSDRFERPNAKRPKYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
316-335KKRTGPARALPRPVSSRGRG
355-361RPNAKRP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040132  Tex1/THOC3  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
KEGG opa:HPODL_03914  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
Amino Acid Sequences MTITFSYPREFDTLSLDPPHFRSSLLAWDADGTRIACARTDKSIKVAKFDHIRQKFDDPVVITAAHESPVAVLIWECSRNARLTAISTDCTLKVWEIKTKAHKLVRSLKLANTAPKLAKYSPDGRYLAIADKEANLILLDSSTLQLSTAISIKMSSQIGDMDWDADSETLICGLTDGSLQLYRVQNNNNLHAIELIQSLHLSDSPIVSIKYIADRNQILAAGLDGQLLVVDVQLLICTKSLYNLDDAPVCIDILAPAVAISYQNNNVRIFDMDGGEEVHEVKNSKGDNALAKFHPQFREILAYIDGSGKATVMVAKKRTGPARALPRPVSSRGRGSGLSASSGPSRTIRSDRFERPNAKRPKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.3
4 0.29
5 0.31
6 0.33
7 0.26
8 0.24
9 0.23
10 0.21
11 0.28
12 0.28
13 0.25
14 0.22
15 0.24
16 0.24
17 0.23
18 0.23
19 0.15
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.19
25 0.21
26 0.27
27 0.32
28 0.32
29 0.38
30 0.45
31 0.43
32 0.46
33 0.46
34 0.45
35 0.48
36 0.55
37 0.58
38 0.57
39 0.6
40 0.57
41 0.61
42 0.58
43 0.51
44 0.47
45 0.38
46 0.33
47 0.31
48 0.27
49 0.22
50 0.19
51 0.18
52 0.14
53 0.12
54 0.1
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.14
66 0.16
67 0.17
68 0.17
69 0.16
70 0.17
71 0.21
72 0.22
73 0.2
74 0.2
75 0.21
76 0.19
77 0.19
78 0.17
79 0.14
80 0.16
81 0.17
82 0.23
83 0.25
84 0.31
85 0.39
86 0.45
87 0.52
88 0.53
89 0.53
90 0.54
91 0.61
92 0.61
93 0.59
94 0.55
95 0.49
96 0.51
97 0.51
98 0.49
99 0.41
100 0.39
101 0.33
102 0.32
103 0.34
104 0.27
105 0.27
106 0.27
107 0.31
108 0.31
109 0.36
110 0.35
111 0.31
112 0.32
113 0.3
114 0.29
115 0.22
116 0.19
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.11
121 0.1
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.09
168 0.1
169 0.12
170 0.14
171 0.16
172 0.22
173 0.23
174 0.26
175 0.23
176 0.22
177 0.2
178 0.18
179 0.17
180 0.11
181 0.1
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.1
198 0.12
199 0.13
200 0.16
201 0.16
202 0.17
203 0.18
204 0.17
205 0.13
206 0.11
207 0.1
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.07
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.13
250 0.17
251 0.2
252 0.2
253 0.21
254 0.22
255 0.22
256 0.21
257 0.17
258 0.15
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.14
270 0.14
271 0.15
272 0.16
273 0.18
274 0.23
275 0.25
276 0.3
277 0.27
278 0.32
279 0.35
280 0.38
281 0.39
282 0.33
283 0.31
284 0.29
285 0.34
286 0.29
287 0.27
288 0.22
289 0.2
290 0.2
291 0.2
292 0.18
293 0.12
294 0.12
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.12
299 0.15
300 0.21
301 0.23
302 0.27
303 0.31
304 0.38
305 0.43
306 0.44
307 0.44
308 0.47
309 0.55
310 0.6
311 0.63
312 0.6
313 0.61
314 0.61
315 0.63
316 0.61
317 0.55
318 0.54
319 0.5
320 0.5
321 0.44
322 0.42
323 0.41
324 0.35
325 0.32
326 0.26
327 0.25
328 0.24
329 0.25
330 0.24
331 0.2
332 0.23
333 0.26
334 0.34
335 0.37
336 0.42
337 0.49
338 0.57
339 0.64
340 0.7
341 0.74
342 0.75
343 0.8