FuNGI

W1QFD2

Protein Details

Accession

W1QFD2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
522-583	STTKTSKGITRVEKRKRNKPKKLPKDLSKKLDEERWLPMKDRSYYKPKKGKKGKDTQGGLVD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
531-575	TRVEKRKRNKPKKLPKDLSKKLDEERWLPMKDRSYYKPKKGKKGK
602-614	GKKQASKKKKGKK

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 12.833, cyto 9.5, mito_nucl 8.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR031545 SRP_TPR-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	opa:HPODL_00203 -
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72 PF17004 SRP_TPR_like

Amino Acid Sequences

MSLSDLVSQLQIFSKSDSHRQVLDLGSKILSQEPTNVAAFKQCLVALINLDNYKTAREMLDKHSDLIAENRDILAVELAYIYYKLDDEKSLAELVAQGSTNRGLKHVLAQHYYRVGKNEKALEIYRELLNGTPPEEVLDLSVNERAVLSQMKVYSEDSTLQPVSAPHSNSYDQKFNSALILLRDGDYEASLELLREARQQCLVSLADYEEEEQLEELAPIDVEIAFLTQLLSGNDAAKPFYDEINVSKLKNQVLKVLITTNLASFQHQPSNAALLYKNLGFPQSLNKILDRLAIRQIRDLHRNEILLAYKAGKSVSKSAAKHEHQFPESLLPQALAAISKITEFDSKNLKSLGNEKLVFREAIRNPQKLGLCLFAAQLSASAGKPQNAARVLEAAVEADSPVLLRPAVACLLFAVYDKLDRENDKIKLLLSLYQHLISAELKTVDQLKLLKFVAFQMITFDEPKSQELFLKLQSAVSSDPLVSVVLGGEAETSLGNVDPLILEVDTDSLLEQGLQPLISKTSTTKTSKGITRVEKRKRNKPKKLPKDLSKKLDEERWLPMKDRSYYKPKKGKKGKDTQGGLVDQATEESLNIGSSSSTPAVGKKQASKKKKGKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.35
4	0.4
5	0.41
6	0.4
7	0.41
8	0.42
9	0.4
10	0.42
11	0.35
12	0.31
13	0.28
14	0.26
15	0.26
16	0.26
17	0.23
18	0.18
19	0.21
20	0.22
21	0.24
22	0.26
23	0.25
24	0.22
25	0.24
26	0.24
27	0.2
28	0.19
29	0.16
30	0.16
31	0.17
32	0.18
33	0.16
34	0.17
35	0.21
36	0.2
37	0.2
38	0.21
39	0.19
40	0.19
41	0.18
42	0.17
43	0.15
44	0.19
45	0.23
46	0.28
47	0.38
48	0.37
49	0.38
50	0.37
51	0.35
52	0.32
53	0.33
54	0.3
55	0.22
56	0.21
57	0.2
58	0.18
59	0.18
60	0.17
61	0.13
62	0.08
63	0.07
64	0.06
65	0.06
66	0.07
67	0.07
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.08
72	0.09
73	0.11
74	0.12
75	0.13
76	0.15
77	0.15
78	0.14
79	0.13
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.11
84	0.09
85	0.1
86	0.14
87	0.17
88	0.15
89	0.16
90	0.16
91	0.16
92	0.24
93	0.29
94	0.31
95	0.33
96	0.34
97	0.37
98	0.42
99	0.44
100	0.38
101	0.38
102	0.37
103	0.36
104	0.41
105	0.42
106	0.37
107	0.38
108	0.38
109	0.36
110	0.34
111	0.32
112	0.27
113	0.22
114	0.21
115	0.17
116	0.18
117	0.16
118	0.15
119	0.12
120	0.12
121	0.13
122	0.12
123	0.12
124	0.1
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.12
129	0.11
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.09
134	0.11
135	0.1
136	0.11
137	0.13
138	0.14
139	0.15
140	0.16
141	0.16
142	0.16
143	0.17
144	0.15
145	0.19
146	0.18
147	0.16
148	0.15
149	0.14
150	0.17
151	0.19
152	0.2
153	0.17
154	0.21
155	0.24
156	0.28
157	0.32
158	0.34
159	0.3
160	0.31
161	0.3
162	0.27
163	0.25
164	0.21
165	0.18
166	0.13
167	0.15
168	0.13
169	0.12
170	0.12
171	0.11
172	0.11
173	0.09
174	0.08
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.05
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.13
183	0.14
184	0.15
185	0.18
186	0.18
187	0.17
188	0.2
189	0.19
190	0.14
191	0.13
192	0.13
193	0.1
194	0.1
195	0.11
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.04
215	0.04
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.07
220	0.08
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.08
225	0.1
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.09
230	0.11
231	0.17
232	0.19
233	0.17
234	0.19
235	0.22
236	0.24
237	0.27
238	0.26
239	0.25
240	0.25
241	0.25
242	0.23
243	0.22
244	0.19
245	0.16
246	0.16
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.12
252	0.14
253	0.16
254	0.16
255	0.17
256	0.15
257	0.18
258	0.16
259	0.15
260	0.13
261	0.1
262	0.12
263	0.11
264	0.11
265	0.09
266	0.09
267	0.08
268	0.08
269	0.13
270	0.16
271	0.18
272	0.18
273	0.18
274	0.18
275	0.18
276	0.22
277	0.17
278	0.16
279	0.21
280	0.23
281	0.23
282	0.26
283	0.31
284	0.31
285	0.36
286	0.36
287	0.32
288	0.31
289	0.31
290	0.27
291	0.24
292	0.21
293	0.15
294	0.13
295	0.12
296	0.1
297	0.1
298	0.11
299	0.1
300	0.1
301	0.13
302	0.19
303	0.23
304	0.24
305	0.29
306	0.38
307	0.39
308	0.43
309	0.45
310	0.44
311	0.38
312	0.39
313	0.34
314	0.29
315	0.27
316	0.23
317	0.17
318	0.12
319	0.11
320	0.11
321	0.1
322	0.05
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.09
330	0.09
331	0.12
332	0.2
333	0.2
334	0.22
335	0.22
336	0.22
337	0.2
338	0.25
339	0.27
340	0.26
341	0.27
342	0.25
343	0.27
344	0.27
345	0.27
346	0.22
347	0.25
348	0.2
349	0.3
350	0.35
351	0.34
352	0.34
353	0.39
354	0.39
355	0.31
356	0.31
357	0.23
358	0.17
359	0.16
360	0.15
361	0.11
362	0.1
363	0.08
364	0.07
365	0.06
366	0.07
367	0.06
368	0.09
369	0.1
370	0.11
371	0.13
372	0.14
373	0.19
374	0.2
375	0.21
376	0.17
377	0.18
378	0.17
379	0.16
380	0.15
381	0.1
382	0.08
383	0.07
384	0.06
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.08
404	0.09
405	0.11
406	0.13
407	0.15
408	0.19
409	0.25
410	0.26
411	0.26
412	0.26
413	0.24
414	0.24
415	0.23
416	0.23
417	0.19
418	0.2
419	0.2
420	0.19
421	0.19
422	0.17
423	0.17
424	0.13
425	0.12
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.13
431	0.12
432	0.14
433	0.16
434	0.16
435	0.19
436	0.2
437	0.2
438	0.17
439	0.18
440	0.21
441	0.18
442	0.17
443	0.16
444	0.17
445	0.17
446	0.18
447	0.18
448	0.15
449	0.16
450	0.18
451	0.17
452	0.16
453	0.17
454	0.19
455	0.21
456	0.2
457	0.22
458	0.21
459	0.2
460	0.19
461	0.19
462	0.16
463	0.15
464	0.14
465	0.11
466	0.11
467	0.1
468	0.1
469	0.08
470	0.07
471	0.05
472	0.05
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.05
487	0.06
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.09
504	0.11
505	0.11
506	0.12
507	0.13
508	0.17
509	0.25
510	0.28
511	0.31
512	0.34
513	0.41
514	0.46
515	0.5
516	0.54
517	0.56
518	0.62
519	0.7
520	0.75
521	0.78
522	0.82
523	0.86
524	0.89
525	0.9
526	0.91
527	0.92
528	0.93
529	0.94
530	0.96
531	0.96
532	0.95
533	0.95
534	0.93
535	0.91
536	0.87
537	0.81
538	0.75
539	0.71
540	0.66
541	0.58
542	0.57
543	0.56
544	0.51
545	0.48
546	0.49
547	0.49
548	0.5
549	0.54
550	0.53
551	0.56
552	0.64
553	0.72
554	0.76
555	0.79
556	0.83
557	0.87
558	0.91
559	0.9
560	0.91
561	0.91
562	0.91
563	0.86
564	0.81
565	0.77
566	0.68
567	0.58
568	0.47
569	0.38
570	0.27
571	0.22
572	0.17
573	0.1
574	0.08
575	0.08
576	0.08
577	0.08
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.08
582	0.12
583	0.12
584	0.13
585	0.14
586	0.17
587	0.23
588	0.29
589	0.34
590	0.4
591	0.49
592	0.58
593	0.67
594	0.75

W1QFD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer