Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QID4

Protein Details
Accession W1QID4    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
841-867SSQKSPSKASKGRPPRNTKASRARAADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
846-871PSKASKGRPPRNTKASRARAADKAKR
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG opa:HPODL_04834  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
Amino Acid Sequences MSRKLKESLKSGPELGDVGSSPRSKSQSLRRRVSSGRLRQARLSNSGDPASHPKLPEQLDSLPKEEVNALDLNNEPIASQQNHDHEDFTCDGPKVMDMRDAPTEPRKPMLDSNCTIDNHAKTDTCPKLETIDLPIAILSETRIGSSPLADGTREAETNSIEVFPSATPTSDTEHSRGPQEEEQKTVLGLGKYSGGFVDDDFVLHPNDKFELTSILVPTSKLAESNNGKEASTEKFENEYPGIEKLTESKSTNESEAINIESAKQEIATAVKDPIRNSDPGCSDVGLAGPVESRAELDKEPTGPNENSSRPIEPVEGTITPPSFSNVPQEPVHNDVIADRCDSRSYSLQGSIMASYHDEPKNSKIPDSPDSTSTVVHHPLTVSDRCSELNKKDRQVPKLKTVNVTNNPFYVPTMGARSDMTDRRRNHSSGNNQGQKGLQQADLELHDALTNFGASYMTQYRTPAPSLDMKSVDWDAMSGISFTGSRAMIDTQSQHYPSYSYPVLDPRDHRAVNHYEGCVPLGDDPYRAEQIPAKSFSSSSRYSSGVKKEESDEFHDENQPPFLFDPNKVEDFNGGDPSKKRGGGTKGRTWNRQEYSDRDRQQFFDLWLSTVPRNAKAAAEALGIRYTTASNWIKQFRDNGQEEIPMGGILGRPYANPLTEEHETHIISFYKRITQEKRAMKLDELLDELTTQFEDLKLSKTGLRKHLNDMNFKYQRLSKHAENRNSPATIAYRQKWIDYLDQSGANYTRNCVFIDEAGFDENMKDNFGWAFKGSHPVVDIKNNAPAFTLFGAISHEGIVDVQVKYPKNSKAWHECVMQWEHHINTDKPNDPEPGCAEENAGSSQKSPSKASKGRPPRNTKASRARAADKAKRMTMAGNKELDTSLPGSSKDHFMYFLWSLMDRLRHNSTFNQRCFFILDNARIHKGGEITDMIKMANQKYDTGFEVLYLPPYSPELNPIENIWSMMKRNFADTRRSKLVDRLACSQNGITPEIVAKTVKHATKYFDHCRQGIPLKNLH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.32
3 0.24
4 0.17
5 0.16
6 0.2
7 0.2
8 0.21
9 0.26
10 0.29
11 0.3
12 0.38
13 0.47
14 0.51
15 0.6
16 0.68
17 0.68
18 0.71
19 0.73
20 0.75
21 0.75
22 0.75
23 0.76
24 0.75
25 0.72
26 0.72
27 0.75
28 0.7
29 0.67
30 0.63
31 0.56
32 0.52
33 0.51
34 0.44
35 0.4
36 0.42
37 0.41
38 0.38
39 0.35
40 0.33
41 0.38
42 0.41
43 0.4
44 0.37
45 0.38
46 0.43
47 0.45
48 0.44
49 0.39
50 0.36
51 0.34
52 0.31
53 0.24
54 0.19
55 0.18
56 0.16
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.12
63 0.12
64 0.18
65 0.17
66 0.19
67 0.23
68 0.28
69 0.32
70 0.33
71 0.33
72 0.28
73 0.31
74 0.31
75 0.27
76 0.26
77 0.23
78 0.22
79 0.22
80 0.23
81 0.21
82 0.2
83 0.23
84 0.2
85 0.23
86 0.28
87 0.29
88 0.31
89 0.38
90 0.42
91 0.38
92 0.42
93 0.4
94 0.39
95 0.46
96 0.49
97 0.48
98 0.45
99 0.48
100 0.49
101 0.47
102 0.46
103 0.44
104 0.38
105 0.33
106 0.34
107 0.3
108 0.26
109 0.35
110 0.38
111 0.35
112 0.34
113 0.32
114 0.32
115 0.33
116 0.33
117 0.29
118 0.28
119 0.24
120 0.23
121 0.22
122 0.19
123 0.17
124 0.15
125 0.1
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.12
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.09
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.18
157 0.21
158 0.24
159 0.23
160 0.28
161 0.29
162 0.32
163 0.32
164 0.33
165 0.35
166 0.41
167 0.41
168 0.39
169 0.39
170 0.35
171 0.32
172 0.29
173 0.27
174 0.18
175 0.16
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.13
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.11
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.19
210 0.24
211 0.28
212 0.33
213 0.31
214 0.31
215 0.3
216 0.31
217 0.27
218 0.27
219 0.24
220 0.19
221 0.21
222 0.22
223 0.25
224 0.24
225 0.21
226 0.18
227 0.19
228 0.18
229 0.16
230 0.15
231 0.16
232 0.19
233 0.21
234 0.21
235 0.22
236 0.25
237 0.27
238 0.28
239 0.25
240 0.22
241 0.19
242 0.19
243 0.17
244 0.14
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.12
257 0.16
258 0.18
259 0.18
260 0.23
261 0.25
262 0.26
263 0.26
264 0.29
265 0.27
266 0.27
267 0.28
268 0.22
269 0.19
270 0.17
271 0.16
272 0.11
273 0.09
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.09
282 0.09
283 0.11
284 0.13
285 0.15
286 0.17
287 0.18
288 0.22
289 0.2
290 0.23
291 0.26
292 0.26
293 0.28
294 0.29
295 0.29
296 0.25
297 0.26
298 0.24
299 0.19
300 0.19
301 0.18
302 0.16
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.11
310 0.11
311 0.16
312 0.16
313 0.2
314 0.21
315 0.23
316 0.23
317 0.26
318 0.27
319 0.2
320 0.18
321 0.17
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.19
332 0.19
333 0.2
334 0.2
335 0.2
336 0.2
337 0.17
338 0.13
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.15
343 0.16
344 0.16
345 0.17
346 0.22
347 0.29
348 0.29
349 0.29
350 0.26
351 0.3
352 0.34
353 0.38
354 0.35
355 0.29
356 0.32
357 0.31
358 0.28
359 0.25
360 0.23
361 0.2
362 0.18
363 0.17
364 0.13
365 0.14
366 0.18
367 0.18
368 0.17
369 0.15
370 0.16
371 0.16
372 0.2
373 0.23
374 0.26
375 0.34
376 0.38
377 0.4
378 0.48
379 0.53
380 0.58
381 0.63
382 0.61
383 0.61
384 0.63
385 0.63
386 0.59
387 0.58
388 0.59
389 0.56
390 0.56
391 0.48
392 0.41
393 0.38
394 0.34
395 0.29
396 0.21
397 0.14
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.16
405 0.2
406 0.25
407 0.3
408 0.32
409 0.37
410 0.41
411 0.4
412 0.41
413 0.44
414 0.47
415 0.49
416 0.57
417 0.58
418 0.54
419 0.53
420 0.49
421 0.41
422 0.36
423 0.28
424 0.19
425 0.13
426 0.13
427 0.13
428 0.13
429 0.13
430 0.1
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.07
442 0.09
443 0.11
444 0.11
445 0.12
446 0.14
447 0.16
448 0.17
449 0.14
450 0.14
451 0.19
452 0.2
453 0.22
454 0.21
455 0.19
456 0.21
457 0.2
458 0.18
459 0.11
460 0.09
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.06
470 0.05
471 0.05
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.1
477 0.1
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.13
483 0.12
484 0.15
485 0.13
486 0.12
487 0.12
488 0.17
489 0.2
490 0.21
491 0.22
492 0.23
493 0.29
494 0.28
495 0.28
496 0.28
497 0.28
498 0.3
499 0.31
500 0.26
501 0.2
502 0.2
503 0.21
504 0.16
505 0.12
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.11
512 0.12
513 0.11
514 0.11
515 0.13
516 0.16
517 0.18
518 0.2
519 0.19
520 0.18
521 0.19
522 0.2
523 0.22
524 0.2
525 0.19
526 0.19
527 0.2
528 0.22
529 0.27
530 0.31
531 0.3
532 0.29
533 0.28
534 0.28
535 0.3
536 0.3
537 0.31
538 0.3
539 0.28
540 0.29
541 0.32
542 0.3
543 0.27
544 0.27
545 0.21
546 0.16
547 0.15
548 0.17
549 0.14
550 0.14
551 0.18
552 0.19
553 0.21
554 0.21
555 0.2
556 0.18
557 0.19
558 0.19
559 0.19
560 0.16
561 0.16
562 0.17
563 0.21
564 0.23
565 0.22
566 0.21
567 0.22
568 0.3
569 0.37
570 0.43
571 0.47
572 0.54
573 0.58
574 0.63
575 0.62
576 0.63
577 0.56
578 0.56
579 0.51
580 0.48
581 0.51
582 0.55
583 0.55
584 0.5
585 0.49
586 0.44
587 0.44
588 0.39
589 0.32
590 0.28
591 0.23
592 0.2
593 0.19
594 0.2
595 0.17
596 0.18
597 0.18
598 0.15
599 0.16
600 0.16
601 0.15
602 0.13
603 0.14
604 0.12
605 0.11
606 0.1
607 0.1
608 0.1
609 0.09
610 0.08
611 0.08
612 0.07
613 0.06
614 0.14
615 0.15
616 0.17
617 0.22
618 0.26
619 0.27
620 0.29
621 0.33
622 0.29
623 0.36
624 0.36
625 0.34
626 0.31
627 0.3
628 0.29
629 0.25
630 0.21
631 0.12
632 0.09
633 0.07
634 0.06
635 0.05
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.08
640 0.09
641 0.09
642 0.1
643 0.11
644 0.15
645 0.17
646 0.18
647 0.17
648 0.2
649 0.19
650 0.19
651 0.2
652 0.17
653 0.15
654 0.17
655 0.16
656 0.18
657 0.21
658 0.27
659 0.3
660 0.36
661 0.45
662 0.51
663 0.56
664 0.55
665 0.54
666 0.48
667 0.48
668 0.41
669 0.33
670 0.27
671 0.21
672 0.17
673 0.15
674 0.14
675 0.09
676 0.08
677 0.07
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.07
682 0.1
683 0.11
684 0.12
685 0.16
686 0.21
687 0.27
688 0.35
689 0.41
690 0.41
691 0.46
692 0.52
693 0.54
694 0.56
695 0.56
696 0.57
697 0.53
698 0.51
699 0.47
700 0.44
701 0.43
702 0.42
703 0.43
704 0.4
705 0.47
706 0.55
707 0.6
708 0.61
709 0.62
710 0.6
711 0.55
712 0.47
713 0.4
714 0.34
715 0.32
716 0.34
717 0.3
718 0.32
719 0.32
720 0.33
721 0.32
722 0.32
723 0.32
724 0.27
725 0.29
726 0.25
727 0.25
728 0.25
729 0.25
730 0.23
731 0.2
732 0.18
733 0.16
734 0.17
735 0.17
736 0.17
737 0.16
738 0.16
739 0.14
740 0.16
741 0.15
742 0.13
743 0.13
744 0.12
745 0.11
746 0.11
747 0.12
748 0.11
749 0.11
750 0.1
751 0.1
752 0.11
753 0.11
754 0.12
755 0.11
756 0.13
757 0.12
758 0.2
759 0.19
760 0.19
761 0.2
762 0.22
763 0.24
764 0.27
765 0.29
766 0.23
767 0.3
768 0.29
769 0.28
770 0.25
771 0.23
772 0.2
773 0.17
774 0.17
775 0.1
776 0.1
777 0.13
778 0.12
779 0.12
780 0.1
781 0.09
782 0.07
783 0.08
784 0.09
785 0.09
786 0.09
787 0.11
788 0.16
789 0.18
790 0.2
791 0.27
792 0.31
793 0.33
794 0.38
795 0.44
796 0.49
797 0.54
798 0.57
799 0.54
800 0.5
801 0.51
802 0.5
803 0.42
804 0.36
805 0.34
806 0.29
807 0.31
808 0.35
809 0.3
810 0.34
811 0.39
812 0.41
813 0.4
814 0.42
815 0.42
816 0.38
817 0.4
818 0.36
819 0.35
820 0.31
821 0.28
822 0.26
823 0.23
824 0.23
825 0.22
826 0.21
827 0.15
828 0.15
829 0.2
830 0.23
831 0.25
832 0.27
833 0.32
834 0.4
835 0.47
836 0.54
837 0.59
838 0.66
839 0.73
840 0.8
841 0.82
842 0.82
843 0.86
844 0.85
845 0.84
846 0.84
847 0.83
848 0.81
849 0.77
850 0.73
851 0.71
852 0.73
853 0.72
854 0.7
855 0.66
856 0.61
857 0.56
858 0.52
859 0.5
860 0.48
861 0.47
862 0.44
863 0.41
864 0.39
865 0.39
866 0.38
867 0.32
868 0.26
869 0.2
870 0.16
871 0.15
872 0.15
873 0.16
874 0.18
875 0.22
876 0.22
877 0.21
878 0.2
879 0.19
880 0.24
881 0.23
882 0.23
883 0.2
884 0.18
885 0.19
886 0.2
887 0.25
888 0.21
889 0.26
890 0.31
891 0.32
892 0.35
893 0.42
894 0.5
895 0.54
896 0.57
897 0.55
898 0.49
899 0.48
900 0.49
901 0.42
902 0.4
903 0.37
904 0.39
905 0.41
906 0.45
907 0.46
908 0.43
909 0.4
910 0.35
911 0.29
912 0.24
913 0.21
914 0.2
915 0.18
916 0.19
917 0.19
918 0.17
919 0.17
920 0.2
921 0.19
922 0.23
923 0.23
924 0.23
925 0.25
926 0.28
927 0.28
928 0.27
929 0.25
930 0.19
931 0.2
932 0.19
933 0.2
934 0.17
935 0.15
936 0.13
937 0.16
938 0.17
939 0.15
940 0.2
941 0.21
942 0.23
943 0.24
944 0.24
945 0.25
946 0.24
947 0.25
948 0.23
949 0.22
950 0.23
951 0.24
952 0.3
953 0.27
954 0.33
955 0.39
956 0.4
957 0.48
958 0.51
959 0.57
960 0.6
961 0.62
962 0.58
963 0.58
964 0.64
965 0.6
966 0.58
967 0.57
968 0.54
969 0.52
970 0.52
971 0.45
972 0.38
973 0.34
974 0.31
975 0.23
976 0.19
977 0.2
978 0.19
979 0.2
980 0.18
981 0.15
982 0.2
983 0.27
984 0.3
985 0.33
986 0.35
987 0.39
988 0.47
989 0.56
990 0.59
991 0.61
992 0.64
993 0.6
994 0.6
995 0.63
996 0.63
997 0.62