Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QDD2

Protein Details
Accession W1QDD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-87EQAPEPKPQPAKRGKKSRKKKSPPPEDDDIDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-79KPQPAKRGKKSRKKKSP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
KEGG opa:HPODL_03367  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MSNRALRRLQKQELETTSDDEPEYVPRRAANAFALLGDESDGGESEEQEPDREQYIEQAPEPKPQPAKRGKKSRKKKSPPPEDDDIDAILAQLQIDTQTTDQDKPFDSFDGPYENLADGASELTAARLQSALPLLQFDPRDLDPDREFEAVFGKLSSAAVDDADATPSMFVSPDVLKQIKLLSKRVRGWCGRDRRSIPGTSRKLVMCKIRDDWIPTPKKPLSMEMVPGSTHDFCVVETPAYPRAITTQFYIYTVIHPDHEALIHLLQQYPYHLETILQVTSILQRQGDNSNTNGLIERALFVFDWSLRTNFQLGSGDCRLPFEYFLNRQCYLTVFKYITVLTQKSTFYTALNYCKLLLSLDPAGDPYGVRYFIDFYAVMAGEFQYLVDLCNSFLVKTYREWLTPPLAYSLAICQYKIDPTAATDALSNAYNTYPYTGEMLLHKLAAHKEPSSRVSDYIKLATAVYLTRVEMMLEEAECRGWLVAELKKTVQKGKKAGAQFDKKEIPENLLRHVILSNETSAMARIPAQFWKDHEIFEFDVLPPKSSKGTTIFDHIDQARVSNAIIHQSMEQEEERQIAELIRRTAEQEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.57
3 0.51
4 0.44
5 0.38
6 0.33
7 0.25
8 0.22
9 0.23
10 0.27
11 0.25
12 0.25
13 0.24
14 0.27
15 0.28
16 0.29
17 0.24
18 0.23
19 0.21
20 0.2
21 0.2
22 0.17
23 0.16
24 0.14
25 0.11
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.08
31 0.09
32 0.1
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.17
37 0.18
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.2
42 0.25
43 0.27
44 0.27
45 0.33
46 0.32
47 0.39
48 0.42
49 0.42
50 0.45
51 0.47
52 0.55
53 0.58
54 0.68
55 0.71
56 0.8
57 0.84
58 0.86
59 0.93
60 0.94
61 0.95
62 0.95
63 0.95
64 0.95
65 0.95
66 0.94
67 0.9
68 0.87
69 0.79
70 0.7
71 0.61
72 0.51
73 0.39
74 0.29
75 0.22
76 0.14
77 0.11
78 0.08
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.12
86 0.14
87 0.18
88 0.19
89 0.21
90 0.23
91 0.23
92 0.24
93 0.21
94 0.2
95 0.18
96 0.19
97 0.22
98 0.21
99 0.19
100 0.19
101 0.17
102 0.16
103 0.14
104 0.12
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.08
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.11
121 0.11
122 0.15
123 0.16
124 0.14
125 0.17
126 0.16
127 0.2
128 0.2
129 0.24
130 0.21
131 0.24
132 0.26
133 0.23
134 0.23
135 0.19
136 0.2
137 0.16
138 0.15
139 0.12
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.14
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.2
166 0.22
167 0.25
168 0.31
169 0.34
170 0.41
171 0.49
172 0.55
173 0.58
174 0.58
175 0.62
176 0.63
177 0.66
178 0.64
179 0.65
180 0.62
181 0.61
182 0.61
183 0.58
184 0.56
185 0.55
186 0.55
187 0.48
188 0.49
189 0.43
190 0.41
191 0.41
192 0.43
193 0.36
194 0.35
195 0.35
196 0.35
197 0.35
198 0.39
199 0.39
200 0.41
201 0.44
202 0.41
203 0.46
204 0.43
205 0.45
206 0.41
207 0.38
208 0.34
209 0.3
210 0.33
211 0.26
212 0.26
213 0.22
214 0.22
215 0.21
216 0.16
217 0.14
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.11
222 0.11
223 0.08
224 0.08
225 0.11
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.11
230 0.14
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.16
237 0.17
238 0.14
239 0.13
240 0.14
241 0.13
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.1
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.08
271 0.08
272 0.1
273 0.13
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.16
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.11
282 0.09
283 0.07
284 0.07
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.11
301 0.16
302 0.18
303 0.18
304 0.17
305 0.18
306 0.18
307 0.15
308 0.16
309 0.13
310 0.16
311 0.2
312 0.24
313 0.28
314 0.28
315 0.27
316 0.26
317 0.26
318 0.25
319 0.22
320 0.21
321 0.17
322 0.17
323 0.18
324 0.18
325 0.18
326 0.17
327 0.16
328 0.14
329 0.16
330 0.16
331 0.15
332 0.18
333 0.16
334 0.13
335 0.16
336 0.18
337 0.2
338 0.22
339 0.21
340 0.19
341 0.19
342 0.18
343 0.15
344 0.12
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.12
361 0.1
362 0.09
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.07
378 0.08
379 0.07
380 0.11
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.19
385 0.19
386 0.19
387 0.21
388 0.21
389 0.24
390 0.23
391 0.23
392 0.2
393 0.19
394 0.18
395 0.17
396 0.16
397 0.17
398 0.17
399 0.16
400 0.14
401 0.15
402 0.17
403 0.18
404 0.16
405 0.1
406 0.11
407 0.16
408 0.15
409 0.14
410 0.13
411 0.12
412 0.12
413 0.13
414 0.11
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.11
423 0.11
424 0.12
425 0.12
426 0.15
427 0.14
428 0.14
429 0.14
430 0.15
431 0.17
432 0.19
433 0.21
434 0.2
435 0.23
436 0.27
437 0.3
438 0.32
439 0.31
440 0.31
441 0.32
442 0.34
443 0.33
444 0.31
445 0.28
446 0.24
447 0.22
448 0.19
449 0.16
450 0.12
451 0.12
452 0.11
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.1
459 0.09
460 0.08
461 0.09
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.05
468 0.07
469 0.11
470 0.14
471 0.17
472 0.2
473 0.22
474 0.26
475 0.29
476 0.37
477 0.4
478 0.44
479 0.48
480 0.53
481 0.57
482 0.58
483 0.64
484 0.66
485 0.68
486 0.64
487 0.65
488 0.64
489 0.57
490 0.59
491 0.51
492 0.47
493 0.44
494 0.43
495 0.4
496 0.39
497 0.38
498 0.32
499 0.32
500 0.27
501 0.22
502 0.22
503 0.18
504 0.14
505 0.14
506 0.13
507 0.13
508 0.12
509 0.11
510 0.12
511 0.12
512 0.14
513 0.18
514 0.21
515 0.23
516 0.25
517 0.32
518 0.31
519 0.3
520 0.3
521 0.3
522 0.29
523 0.28
524 0.27
525 0.2
526 0.27
527 0.27
528 0.27
529 0.23
530 0.24
531 0.25
532 0.24
533 0.28
534 0.25
535 0.29
536 0.3
537 0.36
538 0.38
539 0.36
540 0.42
541 0.38
542 0.36
543 0.31
544 0.29
545 0.23
546 0.2
547 0.19
548 0.16
549 0.17
550 0.18
551 0.19
552 0.19
553 0.19
554 0.2
555 0.21
556 0.21
557 0.21
558 0.18
559 0.19
560 0.19
561 0.19
562 0.18
563 0.17
564 0.17
565 0.21
566 0.25
567 0.26
568 0.26
569 0.27