Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QCP5

Protein Details
Accession W1QCP5    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-63APPPSADKSKAKKNKKPSVTGNEAHydrophilic
187-210IPPTSVKQTKQKAKKAKQYVDVDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-72KKVDAPPPSADKSKAKKNKKPSVTGNEAGLKFKNKNP
76-88PPKSTERRTAKSK
220-246RERPARSNNTRGRGRAPRGKAPKSAAP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG opa:HPODL_03983  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSNNKNLYALLGNDVSDDEGEVLPPKEIVKKTTSSKKVDAPPPSADKSKAKKNKKPSVTGNEAGLKFKNKNPDVEPPKSTERRTAKSKNYDRHSKSGKTETAKSQKTKLGDEVEAQIEAEADAAEELAAEEEEEAEKPVYKTLDDYFSELQLQQEGLAAQPKRAPNAGAEDKWSNAELLVKEREVFIPPTSVKQTKQKAKKAKQYVDVDVIVADEVRVPRERPARSNNTRGRGRAPRGKAPKSAAPKIELNDKNFPAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.12
4 0.11
5 0.09
6 0.08
7 0.08
8 0.11
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.13
13 0.18
14 0.2
15 0.23
16 0.25
17 0.31
18 0.39
19 0.49
20 0.55
21 0.55
22 0.58
23 0.62
24 0.67
25 0.69
26 0.67
27 0.61
28 0.6
29 0.6
30 0.59
31 0.54
32 0.5
33 0.51
34 0.52
35 0.58
36 0.61
37 0.66
38 0.7
39 0.77
40 0.83
41 0.82
42 0.84
43 0.83
44 0.82
45 0.8
46 0.73
47 0.67
48 0.63
49 0.56
50 0.49
51 0.41
52 0.36
53 0.31
54 0.32
55 0.37
56 0.32
57 0.37
58 0.39
59 0.47
60 0.51
61 0.53
62 0.52
63 0.47
64 0.54
65 0.54
66 0.52
67 0.5
68 0.5
69 0.51
70 0.58
71 0.61
72 0.62
73 0.67
74 0.75
75 0.74
76 0.74
77 0.79
78 0.75
79 0.75
80 0.72
81 0.66
82 0.63
83 0.61
84 0.59
85 0.53
86 0.53
87 0.53
88 0.56
89 0.57
90 0.53
91 0.5
92 0.48
93 0.46
94 0.43
95 0.39
96 0.33
97 0.28
98 0.27
99 0.25
100 0.22
101 0.19
102 0.17
103 0.12
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.03
108 0.03
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.15
131 0.14
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.18
136 0.16
137 0.15
138 0.1
139 0.1
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.15
148 0.16
149 0.17
150 0.18
151 0.18
152 0.14
153 0.23
154 0.27
155 0.23
156 0.26
157 0.26
158 0.25
159 0.26
160 0.24
161 0.16
162 0.12
163 0.14
164 0.12
165 0.15
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.17
170 0.17
171 0.16
172 0.18
173 0.14
174 0.17
175 0.18
176 0.22
177 0.27
178 0.29
179 0.3
180 0.37
181 0.46
182 0.51
183 0.6
184 0.66
185 0.71
186 0.78
187 0.85
188 0.86
189 0.84
190 0.84
191 0.8
192 0.75
193 0.7
194 0.6
195 0.5
196 0.39
197 0.31
198 0.21
199 0.15
200 0.1
201 0.07
202 0.07
203 0.1
204 0.13
205 0.13
206 0.21
207 0.29
208 0.33
209 0.38
210 0.47
211 0.55
212 0.61
213 0.7
214 0.72
215 0.73
216 0.75
217 0.71
218 0.7
219 0.69
220 0.71
221 0.7
222 0.68
223 0.69
224 0.74
225 0.76
226 0.74
227 0.71
228 0.71
229 0.7
230 0.71
231 0.65
232 0.6
233 0.59
234 0.55
235 0.59
236 0.56
237 0.53
238 0.54