FuNGI

C4R1Y5

Protein Details

Accession

C4R1Y5

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-126	KDSLIQWKTKRHKGSCRALCFD	Hydrophilic
436-461	IDNPSESIQKKKRRKVIKNSGNLVLG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
445-450	KKKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis
KEGG	ppa:PAS_chr2-2_0400 -

Amino Acid Sequences

MAKTKTQILQSKLRKQESNVYPLLEINFEEMPIFAMAAHPSKSLIALGFATGHVQMITYDPKTLKEEARNLFKAFRSDYKGQTKSVMNTDRKWWRVDKLKIHATKDSLIQWKTKRHKGSCRALCFDPSGSKLFTAGSDNVLKCANSVTGKVLYKVVLDIKSRISKMIVAPTKPLILIGDESGNVHVYDQRTLKKLHFIENCHGDAVNGIVSLASTNENEFVSCGSSSLTHFNVKSGIIAESEDQEDEIMSVTVVDPDNCEVLMCGMSEGGVSVWNKNSNNFDSMIRKTKTGEDSVDSVIGTLKGDSCVWAGTSGGLVHLIHSKNGKILETREHSKTDDVTFLDLDYEYRLITCGTDRVRLWGELQDVEKEEDEEEQEEEEATTEEEDPSDSSDSTNDVEIDLPKDISSEYDENKSSINSNDDSRVVSDRSALLGDIDNPSESIQKKKRRKVIKNSGNLVLGSFFAGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.68
3	0.73
4	0.7
5	0.68
6	0.61
7	0.53
8	0.47
9	0.44
10	0.41
11	0.31
12	0.24
13	0.19
14	0.16
15	0.14
16	0.13
17	0.11
18	0.11
19	0.1
20	0.1
21	0.07
22	0.08
23	0.1
24	0.13
25	0.14
26	0.13
27	0.14
28	0.14
29	0.15
30	0.14
31	0.12
32	0.11
33	0.1
34	0.11
35	0.11
36	0.1
37	0.11
38	0.1
39	0.1
40	0.08
41	0.07
42	0.07
43	0.09
44	0.14
45	0.14
46	0.18
47	0.18
48	0.21
49	0.25
50	0.29
51	0.33
52	0.36
53	0.44
54	0.47
55	0.55
56	0.56
57	0.54
58	0.55
59	0.51
60	0.48
61	0.44
62	0.43
63	0.42
64	0.43
65	0.5
66	0.55
67	0.56
68	0.52
69	0.53
70	0.51
71	0.47
72	0.51
73	0.52
74	0.46
75	0.46
76	0.54
77	0.57
78	0.56
79	0.56
80	0.51
81	0.5
82	0.56
83	0.61
84	0.62
85	0.62
86	0.69
87	0.7
88	0.7
89	0.66
90	0.59
91	0.52
92	0.47
93	0.44
94	0.42
95	0.38
96	0.41
97	0.42
98	0.49
99	0.56
100	0.6
101	0.64
102	0.65
103	0.73
104	0.77
105	0.82
106	0.81
107	0.8
108	0.77
109	0.69
110	0.63
111	0.55
112	0.47
113	0.39
114	0.32
115	0.28
116	0.23
117	0.21
118	0.19
119	0.17
120	0.15
121	0.16
122	0.14
123	0.15
124	0.2
125	0.2
126	0.21
127	0.21
128	0.2
129	0.16
130	0.16
131	0.16
132	0.11
133	0.12
134	0.14
135	0.19
136	0.2
137	0.2
138	0.2
139	0.18
140	0.17
141	0.18
142	0.19
143	0.17
144	0.18
145	0.19
146	0.23
147	0.27
148	0.27
149	0.26
150	0.23
151	0.21
152	0.22
153	0.3
154	0.29
155	0.26
156	0.27
157	0.28
158	0.27
159	0.24
160	0.22
161	0.13
162	0.1
163	0.1
164	0.09
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.07
171	0.07
172	0.09
173	0.09
174	0.12
175	0.15
176	0.18
177	0.2
178	0.22
179	0.23
180	0.28
181	0.29
182	0.34
183	0.36
184	0.37
185	0.4
186	0.43
187	0.42
188	0.34
189	0.33
190	0.24
191	0.19
192	0.16
193	0.1
194	0.05
195	0.04
196	0.03
197	0.03
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.05
212	0.06
213	0.07
214	0.1
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.13
220	0.12
221	0.12
222	0.1
223	0.09
224	0.07
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.06
231	0.06
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.04
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.04
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.03
257	0.06
258	0.06
259	0.07
260	0.09
261	0.14
262	0.14
263	0.16
264	0.2
265	0.19
266	0.21
267	0.21
268	0.22
269	0.23
270	0.27
271	0.33
272	0.3
273	0.29
274	0.29
275	0.33
276	0.34
277	0.32
278	0.3
279	0.23
280	0.25
281	0.25
282	0.24
283	0.18
284	0.15
285	0.13
286	0.11
287	0.09
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.05
302	0.06
303	0.05
304	0.06
305	0.12
306	0.12
307	0.13
308	0.15
309	0.15
310	0.17
311	0.18
312	0.19
313	0.16
314	0.18
315	0.25
316	0.29
317	0.34
318	0.34
319	0.35
320	0.35
321	0.35
322	0.35
323	0.28
324	0.26
325	0.22
326	0.21
327	0.19
328	0.17
329	0.16
330	0.13
331	0.12
332	0.09
333	0.09
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.12
341	0.14
342	0.19
343	0.19
344	0.23
345	0.26
346	0.26
347	0.26
348	0.25
349	0.25
350	0.23
351	0.24
352	0.22
353	0.21
354	0.22
355	0.21
356	0.18
357	0.16
358	0.14
359	0.14
360	0.13
361	0.12
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.1
366	0.09
367	0.08
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.1
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.13
381	0.13
382	0.14
383	0.11
384	0.1
385	0.12
386	0.13
387	0.15
388	0.14
389	0.13
390	0.12
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.16
395	0.19
396	0.2
397	0.25
398	0.26
399	0.26
400	0.27
401	0.27
402	0.24
403	0.22
404	0.24
405	0.21
406	0.23
407	0.26
408	0.26
409	0.27
410	0.27
411	0.28
412	0.24
413	0.22
414	0.22
415	0.19
416	0.19
417	0.18
418	0.16
419	0.14
420	0.14
421	0.15
422	0.15
423	0.16
424	0.14
425	0.14
426	0.15
427	0.2
428	0.2
429	0.28
430	0.35
431	0.45
432	0.55
433	0.65
434	0.74
435	0.79
436	0.88
437	0.89
438	0.91
439	0.91
440	0.91
441	0.87
442	0.83
443	0.75
444	0.64
445	0.53
446	0.43
447	0.32

C4R1Y5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer