FuNGI

W1QDR6

Protein Details

Accession

W1QDR6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-130	VPLPWREKRLQAKRQLQETEEKLKKLEEIQNKRRNKNTKKGVDAFI	Hydrophilic
691-710	TASAKKGKKSPKIIVKNLAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
695-700	KKGKKS

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	opa:HPODL_04332 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12565 RRM1_MRD1 cd12320 RRM6_RBM19_RRM5_MRD1

Amino Acid Sequences

MSRIIVKGLPLYYTEDKLKTHFQKKGVVTDVKLVRNRQGESRRFAFIGYRSQQDAENAVKYFDKTFIDTARISVQPAKTFSDPTVPLPWREKRLQAKRQLQETEEKLKKLEEIQNKRRNKNTKKGVDAFIEDQVSSNPKLQEFLEVSKPSVQQKSWKNEDLVSAQPDNSTDLQSASLATENASDDEYEEFNGFQSEEEESEKMITLDEAENRQTQVETAQDDNKEEVKQSAEIDDLEWFKLRRKRIKEGEVTEEPEKSQDINKANDIQIEQVGQSAQHQSDDEEEPQLNEQDKAIQRISQTGRLFLRNILYSATEDDFRELFGTYGSLDEVHIAVDTRTGNSKGFAYVKFTSADDAVKAYLELDKQIFQGRLLHILPAEAKKDHTLTDFDLANLPLKKQRELKKKYEASKAQFSWNSLYMNNDAVLESVASKMGISKGELIDPTNSSSAVKQALAEAHVIGDVRKYFEDKGVDLTSFNTKERDDKVILVKNFQHGTTKEEIGELFSAYGQLNRLLMPPAGTIAIVEFRDAPAARAAFSKLAFRRLGKSILYLEKGPKNLFTKEASTEELESVSKTESKADTTEIMDIDNEEDVEISGPTVSVFVKNLNFSTTTNELTATFKSLPGFVVAVVRTRPDPKRTGKTQSMGFGFVEFKTKEQAENAIKIMNGHLLDGHQLQLKLSNRVSQGKSDTASAKKGKKSPKIIVKNLAFESTRNDIFELFSPFGNLKSVRVPKKFDKSARGFAFVEFSTLKEAESAMDQLQGVHLLGRRLVMDFADAESKDVEEEIERMTKKAKFQTGVRKMAQLRESHSGKRKLDLEDESEM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.32
3	0.32
4	0.36
5	0.44
6	0.47
7	0.53
8	0.55
9	0.55
10	0.61
11	0.64
12	0.68
13	0.66
14	0.62
15	0.54
16	0.57
17	0.6
18	0.58
19	0.59
20	0.53
21	0.52
22	0.53
23	0.54
24	0.55
25	0.58
26	0.58
27	0.6
28	0.61
29	0.57
30	0.51
31	0.49
32	0.45
33	0.4
34	0.42
35	0.38
36	0.39
37	0.37
38	0.38
39	0.39
40	0.35
41	0.35
42	0.29
43	0.3
44	0.26
45	0.25
46	0.26
47	0.25
48	0.25
49	0.24
50	0.23
51	0.21
52	0.24
53	0.26
54	0.28
55	0.27
56	0.28
57	0.29
58	0.27
59	0.26
60	0.29
61	0.3
62	0.31
63	0.33
64	0.36
65	0.33
66	0.34
67	0.33
68	0.35
69	0.33
70	0.32
71	0.39
72	0.36
73	0.39
74	0.45
75	0.5
76	0.49
77	0.52
78	0.57
79	0.59
80	0.67
81	0.72
82	0.75
83	0.79
84	0.79
85	0.83
86	0.79
87	0.71
88	0.69
89	0.65
90	0.65
91	0.6
92	0.53
93	0.46
94	0.42
95	0.41
96	0.4
97	0.43
98	0.43
99	0.49
100	0.59
101	0.67
102	0.75
103	0.8
104	0.82
105	0.84
106	0.83
107	0.83
108	0.83
109	0.83
110	0.84
111	0.83
112	0.79
113	0.72
114	0.67
115	0.59
116	0.52
117	0.43
118	0.33
119	0.27
120	0.24
121	0.23
122	0.19
123	0.21
124	0.19
125	0.19
126	0.2
127	0.2
128	0.25
129	0.25
130	0.28
131	0.31
132	0.3
133	0.32
134	0.35
135	0.38
136	0.36
137	0.38
138	0.36
139	0.37
140	0.45
141	0.52
142	0.55
143	0.57
144	0.53
145	0.5
146	0.52
147	0.48
148	0.43
149	0.38
150	0.32
151	0.27
152	0.26
153	0.24
154	0.24
155	0.21
156	0.18
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.13
161	0.13
162	0.1
163	0.1
164	0.08
165	0.08
166	0.09
167	0.09
168	0.1
169	0.1
170	0.09
171	0.08
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.07
181	0.08
182	0.08
183	0.09
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.12
189	0.1
190	0.09
191	0.08
192	0.08
193	0.1
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.17
198	0.18
199	0.18
200	0.16
201	0.14
202	0.13
203	0.13
204	0.14
205	0.15
206	0.19
207	0.2
208	0.21
209	0.23
210	0.23
211	0.21
212	0.19
213	0.18
214	0.16
215	0.16
216	0.16
217	0.15
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.14
222	0.13
223	0.12
224	0.14
225	0.13
226	0.19
227	0.24
228	0.32
229	0.38
230	0.44
231	0.54
232	0.62
233	0.7
234	0.72
235	0.72
236	0.72
237	0.67
238	0.64
239	0.56
240	0.47
241	0.37
242	0.29
243	0.25
244	0.18
245	0.17
246	0.19
247	0.21
248	0.24
249	0.26
250	0.29
251	0.29
252	0.3
253	0.27
254	0.22
255	0.18
256	0.16
257	0.13
258	0.1
259	0.1
260	0.08
261	0.09
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.14
268	0.16
269	0.15
270	0.15
271	0.15
272	0.14
273	0.15
274	0.17
275	0.14
276	0.12
277	0.11
278	0.16
279	0.18
280	0.21
281	0.2
282	0.2
283	0.2
284	0.27
285	0.29
286	0.3
287	0.29
288	0.29
289	0.31
290	0.31
291	0.32
292	0.26
293	0.26
294	0.19
295	0.19
296	0.16
297	0.14
298	0.13
299	0.14
300	0.14
301	0.12
302	0.11
303	0.12
304	0.11
305	0.11
306	0.11
307	0.09
308	0.08
309	0.06
310	0.07
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.04
322	0.06
323	0.07
324	0.07
325	0.09
326	0.1
327	0.11
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.15
332	0.14
333	0.18
334	0.18
335	0.19
336	0.19
337	0.19
338	0.17
339	0.16
340	0.16
341	0.1
342	0.09
343	0.08
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.08
351	0.09
352	0.09
353	0.12
354	0.12
355	0.11
356	0.15
357	0.14
358	0.17
359	0.16
360	0.16
361	0.13
362	0.13
363	0.15
364	0.13
365	0.14
366	0.11
367	0.11
368	0.12
369	0.13
370	0.13
371	0.13
372	0.13
373	0.12
374	0.15
375	0.15
376	0.13
377	0.14
378	0.14
379	0.15
380	0.14
381	0.14
382	0.14
383	0.16
384	0.19
385	0.25
386	0.34
387	0.42
388	0.49
389	0.55
390	0.62
391	0.68
392	0.7
393	0.72
394	0.7
395	0.64
396	0.65
397	0.59
398	0.54
399	0.48
400	0.43
401	0.36
402	0.31
403	0.27
404	0.19
405	0.19
406	0.15
407	0.14
408	0.13
409	0.11
410	0.09
411	0.08
412	0.07
413	0.06
414	0.05
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.06
422	0.06
423	0.08
424	0.08
425	0.1
426	0.1
427	0.1
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.1
432	0.1
433	0.09
434	0.09
435	0.1
436	0.1
437	0.09
438	0.08
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.08
444	0.06
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.07
451	0.07
452	0.09
453	0.09
454	0.13
455	0.15
456	0.13
457	0.17
458	0.17
459	0.17
460	0.16
461	0.17
462	0.18
463	0.18
464	0.18
465	0.15
466	0.15
467	0.18
468	0.21
469	0.24
470	0.21
471	0.22
472	0.28
473	0.33
474	0.33
475	0.33
476	0.32
477	0.32
478	0.31
479	0.29
480	0.27
481	0.21
482	0.25
483	0.25
484	0.25
485	0.2
486	0.2
487	0.19
488	0.16
489	0.16
490	0.11
491	0.07
492	0.06
493	0.07
494	0.07
495	0.08
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.08
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.09
504	0.08
505	0.08
506	0.08
507	0.07
508	0.06
509	0.05
510	0.08
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.11
519	0.11
520	0.12
521	0.13
522	0.14
523	0.13
524	0.14
525	0.2
526	0.18
527	0.23
528	0.25
529	0.25
530	0.28
531	0.29
532	0.32
533	0.25
534	0.27
535	0.26
536	0.28
537	0.29
538	0.27
539	0.29
540	0.3
541	0.32
542	0.3
543	0.3
544	0.3
545	0.29
546	0.3
547	0.27
548	0.27
549	0.28
550	0.29
551	0.26
552	0.24
553	0.23
554	0.21
555	0.19
556	0.16
557	0.13
558	0.11
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.13
563	0.13
564	0.14
565	0.15
566	0.16
567	0.17
568	0.17
569	0.18
570	0.15
571	0.14
572	0.12
573	0.12
574	0.11
575	0.09
576	0.07
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.06
581	0.05
582	0.05
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.1
591	0.12
592	0.13
593	0.14
594	0.15
595	0.16
596	0.15
597	0.21
598	0.2
599	0.2
600	0.19
601	0.19
602	0.18
603	0.19
604	0.19
605	0.17
606	0.15
607	0.15
608	0.15
609	0.15
610	0.14
611	0.14
612	0.13
613	0.1
614	0.13
615	0.12
616	0.13
617	0.13
618	0.14
619	0.15
620	0.22
621	0.27
622	0.29
623	0.37
624	0.44
625	0.52
626	0.58
627	0.64
628	0.65
629	0.65
630	0.63
631	0.62
632	0.55
633	0.48
634	0.41
635	0.34
636	0.28
637	0.23
638	0.25
639	0.19
640	0.17
641	0.2
642	0.21
643	0.21
644	0.21
645	0.29
646	0.27
647	0.3
648	0.3
649	0.27
650	0.26
651	0.25
652	0.24
653	0.2
654	0.15
655	0.12
656	0.12
657	0.11
658	0.13
659	0.14
660	0.14
661	0.14
662	0.14
663	0.14
664	0.2
665	0.23
666	0.26
667	0.27
668	0.31
669	0.31
670	0.39
671	0.41
672	0.39
673	0.41
674	0.39
675	0.39
676	0.37
677	0.39
678	0.34
679	0.4
680	0.43
681	0.45
682	0.49
683	0.55
684	0.61
685	0.65
686	0.71
687	0.73
688	0.76
689	0.79
690	0.8
691	0.82
692	0.77
693	0.74
694	0.66
695	0.61
696	0.51
697	0.41
698	0.39
699	0.35
700	0.31
701	0.26
702	0.25
703	0.21
704	0.22
705	0.25
706	0.24
707	0.2
708	0.19
709	0.2
710	0.2
711	0.2
712	0.22
713	0.19
714	0.16
715	0.24
716	0.34
717	0.41
718	0.46
719	0.53
720	0.58
721	0.67
722	0.75
723	0.73
724	0.74
725	0.73
726	0.78
727	0.74
728	0.7
729	0.61
730	0.52
731	0.49
732	0.38
733	0.34
734	0.24
735	0.21
736	0.2
737	0.19
738	0.19
739	0.15
740	0.15
741	0.12
742	0.14
743	0.15
744	0.11
745	0.13
746	0.13
747	0.13
748	0.13
749	0.13
750	0.11
751	0.12
752	0.14
753	0.13
754	0.14
755	0.15
756	0.15
757	0.15
758	0.16
759	0.13
760	0.13
761	0.12
762	0.13
763	0.17
764	0.17
765	0.17
766	0.16
767	0.16
768	0.14
769	0.14
770	0.13
771	0.09
772	0.1
773	0.12
774	0.18
775	0.19
776	0.2
777	0.26
778	0.29
779	0.35
780	0.42
781	0.47
782	0.47
783	0.55
784	0.65
785	0.69
786	0.74
787	0.69
788	0.69
789	0.64
790	0.66
791	0.63
792	0.56
793	0.52
794	0.52
795	0.54
796	0.55
797	0.62
798	0.63
799	0.59
800	0.63
801	0.62
802	0.58
803	0.6
804	0.57

W1QDR6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer