FuNGI

W1QFY0

Protein Details

Accession

W1QFY0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
152-178	GGARQSRRPFFKRKTRQVKVFDDNKRK	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	opa:HPODL_03753 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSNIKSEGSTRYEYFPLRACTEKDIEDTHYHILKFHSVKKVNPQKDFEEPARLHRKDPKNLQFQLSLKELEQRRIEERKNELLKEQKKRELLAQQGIKTEELPTVILDDDVDWSKLPEAERRWREEERQRREEEAAREAKRELEMSVVAPDGGARQSRRPFFKRKTRQVKVFDDNKRKLRYEEYYPWVLEDYDAKQAWIGNYEAGNTDNYCLLMLDNQNKCFKMIPVEKFYKFTPRNKYATLTLEEAEAKMKENSQTSRWIMRKMQDEVERGERVDFRYRKMRATSQRAEDVKRSDDETLDFDDEFQDDEEAPILEGNEEESKLVEKKIKSEQLRANNLIEKDEGDDLDDLFETRKIDKEGKKLRRALAKNAMNEVYDTDDEEDPYLSESEMEEVETQQSADAKIKQEETGELPVISIRRTTPQIKVKSYRDGFVVLKASKEVLSEFPAGEWNPKTAIKRSMSPESVSPKKIKVKLEGDSGPITKADVDALVANGPIPLQTLVRQLKHKVSLDPNYKDELKRILRENFIVKDKMVMKRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.4
3	0.39
4	0.38
5	0.41
6	0.39
7	0.4
8	0.42
9	0.41
10	0.37
11	0.35
12	0.36
13	0.34
14	0.35
15	0.35
16	0.35
17	0.33
18	0.32
19	0.31
20	0.34
21	0.36
22	0.41
23	0.46
24	0.45
25	0.5
26	0.59
27	0.68
28	0.68
29	0.7
30	0.68
31	0.63
32	0.67
33	0.69
34	0.61
35	0.6
36	0.53
37	0.55
38	0.6
39	0.56
40	0.54
41	0.57
42	0.63
43	0.64
44	0.73
45	0.73
46	0.73
47	0.76
48	0.75
49	0.72
50	0.65
51	0.6
52	0.53
53	0.44
54	0.35
55	0.38
56	0.37
57	0.37
58	0.38
59	0.37
60	0.41
61	0.48
62	0.52
63	0.52
64	0.56
65	0.59
66	0.61
67	0.59
68	0.58
69	0.6
70	0.64
71	0.67
72	0.69
73	0.66
74	0.63
75	0.63
76	0.64
77	0.62
78	0.6
79	0.59
80	0.57
81	0.52
82	0.52
83	0.51
84	0.44
85	0.36
86	0.3
87	0.22
88	0.16
89	0.14
90	0.11
91	0.11
92	0.1
93	0.09
94	0.08
95	0.07
96	0.09
97	0.1
98	0.1
99	0.09
100	0.09
101	0.11
102	0.13
103	0.14
104	0.18
105	0.24
106	0.34
107	0.4
108	0.46
109	0.51
110	0.53
111	0.6
112	0.64
113	0.68
114	0.68
115	0.7
116	0.67
117	0.64
118	0.64
119	0.62
120	0.56
121	0.54
122	0.52
123	0.46
124	0.44
125	0.41
126	0.39
127	0.33
128	0.3
129	0.21
130	0.15
131	0.14
132	0.13
133	0.14
134	0.12
135	0.1
136	0.09
137	0.09
138	0.07
139	0.08
140	0.11
141	0.11
142	0.18
143	0.25
144	0.32
145	0.4
146	0.45
147	0.54
148	0.6
149	0.7
150	0.75
151	0.79
152	0.84
153	0.85
154	0.88
155	0.86
156	0.85
157	0.83
158	0.82
159	0.81
160	0.8
161	0.78
162	0.77
163	0.74
164	0.67
165	0.6
166	0.57
167	0.52
168	0.5
169	0.51
170	0.48
171	0.46
172	0.44
173	0.42
174	0.36
175	0.31
176	0.23
177	0.17
178	0.14
179	0.16
180	0.16
181	0.15
182	0.15
183	0.16
184	0.16
185	0.15
186	0.14
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.08
197	0.07
198	0.06
199	0.06
200	0.08
201	0.11
202	0.19
203	0.21
204	0.24
205	0.27
206	0.27
207	0.28
208	0.26
209	0.23
210	0.24
211	0.29
212	0.31
213	0.36
214	0.41
215	0.41
216	0.42
217	0.42
218	0.44
219	0.41
220	0.44
221	0.46
222	0.48
223	0.5
224	0.5
225	0.52
226	0.45
227	0.44
228	0.39
229	0.31
230	0.24
231	0.22
232	0.2
233	0.17
234	0.15
235	0.11
236	0.1
237	0.09
238	0.1
239	0.11
240	0.14
241	0.16
242	0.16
243	0.22
244	0.23
245	0.3
246	0.31
247	0.32
248	0.32
249	0.35
250	0.38
251	0.36
252	0.39
253	0.36
254	0.36
255	0.35
256	0.37
257	0.32
258	0.27
259	0.25
260	0.21
261	0.19
262	0.26
263	0.25
264	0.24
265	0.32
266	0.33
267	0.36
268	0.38
269	0.44
270	0.44
271	0.52
272	0.54
273	0.49
274	0.55
275	0.54
276	0.52
277	0.47
278	0.41
279	0.34
280	0.3
281	0.28
282	0.21
283	0.19
284	0.18
285	0.16
286	0.16
287	0.14
288	0.13
289	0.12
290	0.11
291	0.11
292	0.1
293	0.08
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.08
310	0.09
311	0.11
312	0.14
313	0.14
314	0.18
315	0.26
316	0.34
317	0.35
318	0.43
319	0.48
320	0.53
321	0.59
322	0.57
323	0.52
324	0.48
325	0.45
326	0.38
327	0.31
328	0.23
329	0.18
330	0.16
331	0.13
332	0.1
333	0.1
334	0.09
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.09
342	0.11
343	0.14
344	0.22
345	0.27
346	0.37
347	0.46
348	0.54
349	0.62
350	0.65
351	0.67
352	0.7
353	0.68
354	0.67
355	0.67
356	0.63
357	0.57
358	0.55
359	0.5
360	0.41
361	0.37
362	0.29
363	0.22
364	0.16
365	0.15
366	0.14
367	0.13
368	0.13
369	0.13
370	0.13
371	0.09
372	0.11
373	0.1
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.08
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.08
386	0.09
387	0.09
388	0.12
389	0.15
390	0.18
391	0.2
392	0.22
393	0.22
394	0.22
395	0.23
396	0.23
397	0.23
398	0.21
399	0.18
400	0.17
401	0.17
402	0.17
403	0.15
404	0.13
405	0.11
406	0.14
407	0.19
408	0.23
409	0.3
410	0.38
411	0.45
412	0.52
413	0.59
414	0.6
415	0.65
416	0.64
417	0.57
418	0.5
419	0.46
420	0.39
421	0.36
422	0.38
423	0.28
424	0.27
425	0.25
426	0.25
427	0.21
428	0.2
429	0.18
430	0.13
431	0.17
432	0.17
433	0.17
434	0.16
435	0.19
436	0.19
437	0.22
438	0.21
439	0.18
440	0.2
441	0.24
442	0.27
443	0.29
444	0.37
445	0.36
446	0.42
447	0.47
448	0.52
449	0.51
450	0.5
451	0.51
452	0.51
453	0.54
454	0.52
455	0.49
456	0.48
457	0.54
458	0.58
459	0.58
460	0.58
461	0.59
462	0.59
463	0.63
464	0.58
465	0.53
466	0.51
467	0.46
468	0.38
469	0.31
470	0.26
471	0.19
472	0.16
473	0.13
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.1
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.08
482	0.08
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.08
487	0.11
488	0.2
489	0.27
490	0.32
491	0.38
492	0.41
493	0.48
494	0.55
495	0.56
496	0.55
497	0.57
498	0.63
499	0.67
500	0.67
501	0.63
502	0.61
503	0.62
504	0.56
505	0.51
506	0.51
507	0.49
508	0.5
509	0.54
510	0.55
511	0.55
512	0.59
513	0.62
514	0.58
515	0.57
516	0.53
517	0.45
518	0.46
519	0.48

W1QFY0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer