Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QDS1

Protein Details
Accession W1QDS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-63DSQSEEQEKKKSRRPKENAFTQQKLKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-50KKSRR
Subcellular Location(s) plas 15, nucl 7, vacu 2, mito 1, cyto 1, golg 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005045  CDC50/LEM3_fam  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0045332  P:phospholipid translocation  
KEGG opa:HPODL_04337  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03381  CDC50  
Amino Acid Sequences MLSGLRRRKEDRSEDDPITQPNPLVDAMEEDDDDLSDSQSEEQEKKKSRRPKENAFTQQKLKAYHPILTPKTVIPLLLVIAIIFVPIGAGMLYGSYQVQEFVIDYSDCKTLASPDYFSEIPEENYRFQFKKDITVKPQWKLATNESSYWNGFDEERDICQIQFQIPNQIGPHVYFFYRLNNFHANHRRYVKSFSEDQLNGKAASVSTIKDTVGQNCEPLSVNEEGKKYYPCGLIANSLFNDTFSIFSAVNDTTNDYMLYREGIAWSTNKDRFKKTKYKASEVVPPPNWYKAYPEGYNDTNMPDISEWYEFQNWMQPSALPLFSKMISRNDDDVLPEGIYQVDVGYHFPVTPYNGSKYLYLSTRSVIGGKNSFLGISWIVAGGICFVLSLIFLIVNVVHPRRSGDLSLLSWNKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.67
3 0.62
4 0.56
5 0.48
6 0.41
7 0.33
8 0.26
9 0.25
10 0.2
11 0.17
12 0.13
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.15
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.14
21 0.11
22 0.09
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.13
27 0.16
28 0.19
29 0.24
30 0.33
31 0.42
32 0.49
33 0.57
34 0.64
35 0.71
36 0.79
37 0.83
38 0.85
39 0.86
40 0.89
41 0.91
42 0.9
43 0.86
44 0.81
45 0.78
46 0.71
47 0.65
48 0.57
49 0.55
50 0.48
51 0.47
52 0.46
53 0.5
54 0.48
55 0.47
56 0.46
57 0.38
58 0.39
59 0.34
60 0.28
61 0.19
62 0.17
63 0.14
64 0.12
65 0.11
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.05
70 0.04
71 0.03
72 0.03
73 0.02
74 0.03
75 0.02
76 0.02
77 0.02
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.16
99 0.18
100 0.17
101 0.17
102 0.21
103 0.21
104 0.21
105 0.21
106 0.17
107 0.17
108 0.21
109 0.23
110 0.21
111 0.24
112 0.28
113 0.26
114 0.26
115 0.31
116 0.26
117 0.34
118 0.38
119 0.43
120 0.46
121 0.55
122 0.6
123 0.56
124 0.61
125 0.52
126 0.5
127 0.47
128 0.45
129 0.43
130 0.38
131 0.38
132 0.36
133 0.36
134 0.32
135 0.28
136 0.23
137 0.16
138 0.15
139 0.13
140 0.13
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.16
150 0.15
151 0.19
152 0.19
153 0.2
154 0.19
155 0.2
156 0.18
157 0.15
158 0.16
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.17
164 0.2
165 0.2
166 0.23
167 0.28
168 0.29
169 0.36
170 0.45
171 0.41
172 0.43
173 0.47
174 0.46
175 0.41
176 0.46
177 0.4
178 0.35
179 0.35
180 0.31
181 0.33
182 0.31
183 0.31
184 0.28
185 0.26
186 0.22
187 0.19
188 0.17
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.08
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.17
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.16
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.11
208 0.12
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.17
214 0.15
215 0.18
216 0.18
217 0.15
218 0.17
219 0.17
220 0.19
221 0.19
222 0.2
223 0.16
224 0.16
225 0.15
226 0.13
227 0.13
228 0.09
229 0.09
230 0.07
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.12
253 0.17
254 0.22
255 0.28
256 0.32
257 0.39
258 0.46
259 0.54
260 0.61
261 0.62
262 0.67
263 0.68
264 0.72
265 0.71
266 0.66
267 0.67
268 0.62
269 0.64
270 0.56
271 0.53
272 0.47
273 0.45
274 0.43
275 0.33
276 0.32
277 0.3
278 0.33
279 0.31
280 0.32
281 0.32
282 0.32
283 0.34
284 0.3
285 0.24
286 0.2
287 0.18
288 0.16
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.12
294 0.13
295 0.15
296 0.15
297 0.15
298 0.21
299 0.19
300 0.19
301 0.19
302 0.16
303 0.17
304 0.2
305 0.21
306 0.15
307 0.16
308 0.16
309 0.17
310 0.2
311 0.21
312 0.24
313 0.26
314 0.29
315 0.3
316 0.3
317 0.3
318 0.27
319 0.27
320 0.22
321 0.19
322 0.15
323 0.13
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.11
336 0.13
337 0.17
338 0.2
339 0.23
340 0.26
341 0.27
342 0.28
343 0.28
344 0.29
345 0.28
346 0.28
347 0.25
348 0.23
349 0.24
350 0.24
351 0.24
352 0.23
353 0.25
354 0.25
355 0.24
356 0.25
357 0.22
358 0.21
359 0.19
360 0.19
361 0.14
362 0.11
363 0.11
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.07
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.06
381 0.09
382 0.15
383 0.17
384 0.18
385 0.19
386 0.22
387 0.26
388 0.29
389 0.27
390 0.26
391 0.3
392 0.31
393 0.39