Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1Q9W3

Protein Details
Accession W1Q9W3    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-56ERVLVPIEKRKRNARERLETKQDLHydrophilic
266-293GATAMKSKSSKKKERRRKGAKTDTSSYSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-286KSKSSKKKERRRKGAK
357-365RKIVKKDRE
378-387RSKLALRRKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG opa:HPODL_02809  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSKKWIDKKTAQSYALLHRAHEDPLYYNEEAGERVLVPIEKRKRNARERLETKQDLQKELDLKIAQGDIRKNEGEAALYGITYDDSQYDYMQHLKPIGEDKTGIFIAREDKPKKVELPTELLPSKETVKYDYQRQQNIQDDIAGFKPDMNPDLREVLEALEDEAYIDPDQDEDNVDVFGTLLGGKPEVVKDSEYEEYDEWDMDNYEDEYGDYDSNDEGGNFDWEKDFSRFKKEQSRSKVANDWDSEDEFDDEDEDEDEVGSLPDLGATAMKSKSSKKKERRRKGAKTDTSSYSMSSSALCRTEQMTIIDDKFDVMKERYEQEEEEEYEPFAFENERQDLAALVDDFLDNYTLEKGGRKIVKKDRELEKIQRAADSVSRSKLALRRKKASNGGDVSTFKGLADDMKKLRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.62
3 0.52
4 0.42
5 0.37
6 0.37
7 0.35
8 0.32
9 0.25
10 0.2
11 0.24
12 0.29
13 0.26
14 0.24
15 0.23
16 0.22
17 0.21
18 0.19
19 0.16
20 0.1
21 0.1
22 0.12
23 0.13
24 0.15
25 0.24
26 0.33
27 0.39
28 0.45
29 0.55
30 0.63
31 0.72
32 0.8
33 0.8
34 0.82
35 0.82
36 0.85
37 0.85
38 0.79
39 0.75
40 0.72
41 0.66
42 0.58
43 0.53
44 0.49
45 0.42
46 0.39
47 0.39
48 0.31
49 0.27
50 0.25
51 0.25
52 0.21
53 0.23
54 0.26
55 0.23
56 0.28
57 0.28
58 0.26
59 0.26
60 0.25
61 0.21
62 0.17
63 0.17
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.11
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.18
81 0.18
82 0.19
83 0.24
84 0.24
85 0.2
86 0.2
87 0.19
88 0.21
89 0.21
90 0.2
91 0.14
92 0.14
93 0.17
94 0.22
95 0.3
96 0.28
97 0.32
98 0.35
99 0.38
100 0.41
101 0.41
102 0.41
103 0.36
104 0.4
105 0.39
106 0.42
107 0.4
108 0.36
109 0.31
110 0.27
111 0.27
112 0.23
113 0.21
114 0.18
115 0.25
116 0.28
117 0.36
118 0.43
119 0.46
120 0.5
121 0.52
122 0.55
123 0.54
124 0.53
125 0.44
126 0.38
127 0.32
128 0.27
129 0.26
130 0.19
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.11
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.17
140 0.16
141 0.14
142 0.14
143 0.12
144 0.11
145 0.09
146 0.08
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.11
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.04
205 0.05
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.1
212 0.12
213 0.17
214 0.17
215 0.25
216 0.27
217 0.31
218 0.42
219 0.46
220 0.53
221 0.57
222 0.64
223 0.59
224 0.61
225 0.62
226 0.54
227 0.53
228 0.45
229 0.4
230 0.33
231 0.3
232 0.27
233 0.21
234 0.19
235 0.13
236 0.12
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.12
259 0.19
260 0.29
261 0.39
262 0.49
263 0.57
264 0.68
265 0.78
266 0.87
267 0.91
268 0.93
269 0.93
270 0.94
271 0.95
272 0.93
273 0.89
274 0.84
275 0.76
276 0.69
277 0.59
278 0.48
279 0.38
280 0.29
281 0.22
282 0.17
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.19
294 0.19
295 0.19
296 0.17
297 0.16
298 0.14
299 0.13
300 0.15
301 0.13
302 0.16
303 0.18
304 0.21
305 0.24
306 0.26
307 0.25
308 0.26
309 0.3
310 0.29
311 0.28
312 0.26
313 0.23
314 0.2
315 0.2
316 0.15
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.14
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.17
325 0.17
326 0.16
327 0.18
328 0.12
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.12
341 0.14
342 0.21
343 0.28
344 0.33
345 0.41
346 0.51
347 0.6
348 0.64
349 0.72
350 0.72
351 0.74
352 0.77
353 0.77
354 0.76
355 0.73
356 0.67
357 0.6
358 0.52
359 0.46
360 0.43
361 0.4
362 0.35
363 0.32
364 0.32
365 0.31
366 0.36
367 0.39
368 0.45
369 0.48
370 0.52
371 0.58
372 0.65
373 0.73
374 0.77
375 0.78
376 0.77
377 0.72
378 0.65
379 0.63
380 0.56
381 0.51
382 0.43
383 0.37
384 0.26
385 0.22
386 0.19
387 0.2
388 0.22
389 0.26