Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QEF0

Protein Details
Accession W1QEF0    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-122CGERGHFRNQCKQRRKFNFCTDCNHydrophilic
193-241PRQLRRQYHSSQSRKRRPLFEEYRDNGHRDKRQKKNDWSDKNNKNEKNDHydrophilic
270-293GPPAPSRSGYVTKRKRKEKKDKRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-293HRDKRQKKNDWSDKNNKNEKNDKNGKFGGKYKDNRTPQPKKSGVLPQKPAGPPAPSRSGYVTKRKRKEKKDKRK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016713  Air1/2_Saccharomycetales  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0043633  P:polyadenylation-dependent RNA catabolic process  
KEGG opa:HPODL_05190  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSDPEDLDEIPSSETPSVPPVVSLDYGEVNNNNDELVELRGEGRYFGVTDPELSQPVCSNCHRRGHIRANCKVVVCHACGKVDDHYETQCPNSMVCTNCGERGHFRNQCKQRRKFNFCTDCNSKSHSADRCPNIWRSYITIAYEKNHKFKYPADYIYCYNCAERGHYGDECPRPRVSKTPNINGSAFTGENLPRQLRRQYHSSQSRKRRPLFEEYRDNGHRDKRQKKNDWSDKNNKNEKNDKNGKFGGKYKDNRTPQPKKSGVLPQKPAGPPAPSRSGYVTKRKRKEKKDKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.16
4 0.18
5 0.15
6 0.15
7 0.14
8 0.16
9 0.17
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.17
15 0.17
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.14
20 0.12
21 0.12
22 0.11
23 0.11
24 0.09
25 0.08
26 0.09
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.13
35 0.12
36 0.13
37 0.15
38 0.16
39 0.17
40 0.16
41 0.16
42 0.17
43 0.18
44 0.21
45 0.24
46 0.29
47 0.34
48 0.42
49 0.46
50 0.48
51 0.56
52 0.62
53 0.65
54 0.68
55 0.68
56 0.66
57 0.64
58 0.59
59 0.5
60 0.45
61 0.41
62 0.34
63 0.34
64 0.29
65 0.28
66 0.27
67 0.29
68 0.26
69 0.26
70 0.25
71 0.21
72 0.22
73 0.23
74 0.23
75 0.22
76 0.22
77 0.18
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.17
82 0.19
83 0.22
84 0.2
85 0.23
86 0.24
87 0.23
88 0.24
89 0.28
90 0.35
91 0.38
92 0.41
93 0.48
94 0.57
95 0.65
96 0.71
97 0.74
98 0.76
99 0.8
100 0.85
101 0.84
102 0.85
103 0.85
104 0.77
105 0.76
106 0.72
107 0.64
108 0.56
109 0.51
110 0.43
111 0.35
112 0.39
113 0.35
114 0.35
115 0.38
116 0.39
117 0.39
118 0.39
119 0.41
120 0.36
121 0.33
122 0.28
123 0.24
124 0.24
125 0.22
126 0.21
127 0.19
128 0.19
129 0.19
130 0.26
131 0.25
132 0.28
133 0.27
134 0.26
135 0.26
136 0.28
137 0.34
138 0.31
139 0.33
140 0.31
141 0.33
142 0.34
143 0.34
144 0.33
145 0.26
146 0.21
147 0.18
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.16
153 0.16
154 0.17
155 0.21
156 0.28
157 0.28
158 0.29
159 0.28
160 0.27
161 0.29
162 0.35
163 0.36
164 0.39
165 0.44
166 0.5
167 0.53
168 0.55
169 0.54
170 0.46
171 0.42
172 0.34
173 0.27
174 0.18
175 0.16
176 0.13
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.16
181 0.2
182 0.27
183 0.3
184 0.33
185 0.37
186 0.4
187 0.48
188 0.57
189 0.64
190 0.66
191 0.72
192 0.79
193 0.82
194 0.83
195 0.8
196 0.75
197 0.75
198 0.75
199 0.73
200 0.73
201 0.66
202 0.68
203 0.63
204 0.61
205 0.54
206 0.53
207 0.52
208 0.52
209 0.6
210 0.62
211 0.71
212 0.78
213 0.84
214 0.87
215 0.9
216 0.9
217 0.9
218 0.9
219 0.88
220 0.88
221 0.88
222 0.82
223 0.8
224 0.79
225 0.76
226 0.76
227 0.78
228 0.71
229 0.69
230 0.69
231 0.66
232 0.62
233 0.62
234 0.61
235 0.6
236 0.64
237 0.64
238 0.68
239 0.7
240 0.74
241 0.78
242 0.78
243 0.76
244 0.8
245 0.76
246 0.68
247 0.69
248 0.7
249 0.7
250 0.69
251 0.68
252 0.62
253 0.66
254 0.65
255 0.61
256 0.54
257 0.49
258 0.44
259 0.44
260 0.48
261 0.41
262 0.42
263 0.44
264 0.49
265 0.52
266 0.58
267 0.62
268 0.65
269 0.73
270 0.82
271 0.86
272 0.89
273 0.93