Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W1QIA8

Protein Details
Accession W1QIA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
520-547DMTPGRDKKGAKKIRKPTKRQATAGPVSHydrophilic
564-585MDEPARKRRMPYKQQPDSGTPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
525-539RDKKGAKKIRKPTKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG opa:HPODL_00727  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSNNTQAHMMRLLNSIQPPPGMTRQQRLEQMIQTGELKDEDILLLKRHQQMIKQQQAQLHAAQAAGQLTPQQQQQLVQKKLAQQQQQQQQQSQPGQRNFLGLSQEQLAKLNPQQRKMLMIQQLRRRAKTQRFYESSDEILKKFESYPASLEFHIHENHYRFGNQDAIIPKSSPTVKEFLEYVAKGEIPEPLVEVIKDGGVQLYDGSLILKVYDHRNLIPIKQEKQEPSDGKQDKPETKTKPKEYRTVLRFTQLAQYDDLSYQADTQQFHDTFALTFESEVLTATNRNINLQPILNPYHYDKSLRPYDMVVPEYDPETDKMKFVHRADAREVDQDGQKTSLYPLSYRNYPYKPLHEDLPHTNSKYEQLMTILSESYTHNNRLSESAKTNTNEPGQFQRLRFVEMWRHKVELIKQAAISGGMNPNASDPSMNGLLGGMTQQQRALINQERMLNQRQKEQMASAVAAAGHPHAMKPVDSRQGSAPVPNMNGNFMARGVSTPVPHSMPGSMPGSMPGPASAGADMTPGRDKKGAKKIRKPTKRQATAGPVSSPSPSMYQQIPGAYSPMDEPARKRRMPYKQQPDSGTPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.26
4 0.26
5 0.25
6 0.28
7 0.33
8 0.38
9 0.4
10 0.46
11 0.51
12 0.57
13 0.62
14 0.62
15 0.6
16 0.54
17 0.54
18 0.46
19 0.42
20 0.37
21 0.31
22 0.26
23 0.21
24 0.18
25 0.14
26 0.13
27 0.11
28 0.13
29 0.14
30 0.16
31 0.19
32 0.25
33 0.31
34 0.37
35 0.39
36 0.4
37 0.49
38 0.58
39 0.65
40 0.65
41 0.63
42 0.6
43 0.62
44 0.6
45 0.5
46 0.42
47 0.32
48 0.25
49 0.22
50 0.21
51 0.16
52 0.13
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.16
57 0.17
58 0.18
59 0.18
60 0.23
61 0.32
62 0.4
63 0.41
64 0.42
65 0.44
66 0.49
67 0.56
68 0.59
69 0.58
70 0.56
71 0.62
72 0.68
73 0.73
74 0.7
75 0.66
76 0.64
77 0.63
78 0.63
79 0.61
80 0.61
81 0.55
82 0.56
83 0.52
84 0.5
85 0.42
86 0.38
87 0.34
88 0.25
89 0.24
90 0.22
91 0.23
92 0.21
93 0.22
94 0.19
95 0.18
96 0.23
97 0.29
98 0.31
99 0.33
100 0.37
101 0.37
102 0.41
103 0.41
104 0.43
105 0.44
106 0.47
107 0.51
108 0.55
109 0.64
110 0.65
111 0.65
112 0.62
113 0.63
114 0.65
115 0.67
116 0.67
117 0.67
118 0.66
119 0.68
120 0.69
121 0.62
122 0.55
123 0.53
124 0.46
125 0.36
126 0.33
127 0.28
128 0.24
129 0.22
130 0.23
131 0.19
132 0.19
133 0.21
134 0.23
135 0.25
136 0.24
137 0.24
138 0.21
139 0.22
140 0.21
141 0.2
142 0.22
143 0.22
144 0.24
145 0.25
146 0.24
147 0.21
148 0.22
149 0.25
150 0.19
151 0.21
152 0.22
153 0.23
154 0.24
155 0.23
156 0.21
157 0.21
158 0.23
159 0.2
160 0.2
161 0.2
162 0.2
163 0.21
164 0.21
165 0.19
166 0.22
167 0.2
168 0.19
169 0.16
170 0.16
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.07
198 0.1
199 0.13
200 0.15
201 0.15
202 0.2
203 0.21
204 0.22
205 0.28
206 0.31
207 0.31
208 0.34
209 0.38
210 0.36
211 0.39
212 0.45
213 0.39
214 0.38
215 0.44
216 0.43
217 0.4
218 0.44
219 0.46
220 0.44
221 0.46
222 0.5
223 0.48
224 0.56
225 0.64
226 0.67
227 0.71
228 0.69
229 0.73
230 0.71
231 0.73
232 0.67
233 0.64
234 0.55
235 0.48
236 0.44
237 0.37
238 0.36
239 0.29
240 0.26
241 0.2
242 0.2
243 0.18
244 0.17
245 0.17
246 0.11
247 0.09
248 0.08
249 0.09
250 0.11
251 0.1
252 0.12
253 0.18
254 0.17
255 0.18
256 0.18
257 0.16
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.16
281 0.15
282 0.16
283 0.17
284 0.18
285 0.19
286 0.2
287 0.18
288 0.21
289 0.26
290 0.25
291 0.23
292 0.22
293 0.25
294 0.26
295 0.25
296 0.2
297 0.16
298 0.15
299 0.15
300 0.14
301 0.11
302 0.09
303 0.12
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.16
308 0.22
309 0.22
310 0.3
311 0.29
312 0.32
313 0.35
314 0.38
315 0.35
316 0.31
317 0.31
318 0.23
319 0.23
320 0.2
321 0.18
322 0.14
323 0.13
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.11
328 0.11
329 0.16
330 0.18
331 0.22
332 0.24
333 0.29
334 0.29
335 0.35
336 0.37
337 0.38
338 0.4
339 0.38
340 0.4
341 0.37
342 0.39
343 0.38
344 0.41
345 0.38
346 0.33
347 0.32
348 0.28
349 0.27
350 0.26
351 0.21
352 0.15
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.1
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.12
362 0.15
363 0.17
364 0.18
365 0.18
366 0.19
367 0.22
368 0.23
369 0.23
370 0.24
371 0.24
372 0.28
373 0.28
374 0.29
375 0.29
376 0.32
377 0.29
378 0.27
379 0.31
380 0.31
381 0.35
382 0.33
383 0.36
384 0.32
385 0.35
386 0.34
387 0.32
388 0.36
389 0.39
390 0.46
391 0.4
392 0.41
393 0.38
394 0.41
395 0.42
396 0.4
397 0.37
398 0.32
399 0.3
400 0.29
401 0.28
402 0.25
403 0.2
404 0.14
405 0.13
406 0.11
407 0.12
408 0.11
409 0.12
410 0.12
411 0.12
412 0.1
413 0.07
414 0.1
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.12
427 0.13
428 0.14
429 0.2
430 0.23
431 0.25
432 0.28
433 0.32
434 0.33
435 0.37
436 0.44
437 0.44
438 0.39
439 0.43
440 0.44
441 0.43
442 0.42
443 0.39
444 0.35
445 0.3
446 0.29
447 0.21
448 0.17
449 0.15
450 0.13
451 0.12
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.1
457 0.11
458 0.12
459 0.16
460 0.22
461 0.3
462 0.3
463 0.32
464 0.32
465 0.38
466 0.37
467 0.36
468 0.32
469 0.27
470 0.28
471 0.3
472 0.28
473 0.23
474 0.24
475 0.21
476 0.19
477 0.15
478 0.14
479 0.11
480 0.11
481 0.13
482 0.14
483 0.15
484 0.16
485 0.19
486 0.2
487 0.2
488 0.2
489 0.18
490 0.17
491 0.2
492 0.2
493 0.18
494 0.16
495 0.17
496 0.17
497 0.16
498 0.15
499 0.11
500 0.11
501 0.1
502 0.11
503 0.1
504 0.09
505 0.08
506 0.1
507 0.1
508 0.11
509 0.18
510 0.17
511 0.21
512 0.25
513 0.29
514 0.36
515 0.48
516 0.55
517 0.59
518 0.69
519 0.77
520 0.83
521 0.91
522 0.91
523 0.91
524 0.92
525 0.91
526 0.85
527 0.83
528 0.82
529 0.79
530 0.73
531 0.65
532 0.55
533 0.47
534 0.44
535 0.35
536 0.27
537 0.23
538 0.21
539 0.22
540 0.22
541 0.24
542 0.25
543 0.26
544 0.26
545 0.23
546 0.23
547 0.2
548 0.19
549 0.16
550 0.2
551 0.22
552 0.23
553 0.29
554 0.37
555 0.47
556 0.48
557 0.54
558 0.57
559 0.64
560 0.72
561 0.78
562 0.78
563 0.79
564 0.85
565 0.84